Ομάδα Β2: Κουλαξίδης Ευθύμιος- Ορέστης Κατηγορία: Βιβλιογραφικό Β2

Β3 ΘΕΜΑ: Systems biology in drug discovery ΟΜΑΔΑ: Τζωρτζόπουλος Γεώργιος ΚΑΤΗΓΟΡΙΑ: Βιβλιογραφικό θέμα

Συνοπτική περιγραφή… Συστημική βιολογία: θεωρία συστημάτων σε κύτταρα και οργανισμούς Υπολογιστική μοντελοποίηση δίκτυα διακίνησης σήματος, συλλογή δεδομένων, επικρατέστερες μέθοδοι και μαθηματικά μοντέλα Εφαρμοσμένα παραδείγματα μεταβολισμός, πρωτεΐνες και γονίδια Οφέλη στην ανακάλυψη φαρμάκων χρόνος, ψηφιακές προσομοιώσεις, εντοπισμός στόχου

NO SLIDE SENT Ομάδα - Χατζή Δέσποινα Κατηγορία: Βιβλιογραφικό B5

ΕΥΣΤΑΘΙΟΣ ΜΑΔΕΝΙΔΗΣ ΑΜ B6

Outline  Φυσιολογικά χαρακτηριστικά του σπέρματος και πως μπορούν τα Biomems να βοηθήσουν στην ανάπτυξη μεθόδων ανίχνευσης της γονιμότητας.  Συμβατικός τύπος ελέγχου σπέρματος  Χρησιμοποίηση biochips και lab on chips για έρευνα,έλεγχο, αναγνώριση και επεξεργασία παραλλαγμένων γονίδιων κ προβλημάτων γονιμότητας  Υπάρχουσες μελέτες και ανακαλύψεις  Μια νέα ιδέα και μελέτη…  Market research Σχεδιασμός και κατασκευή προϊόντος (κατασκευαστικό θέμα)

ΘΕΜΑ: Ρομποτικά χέρια με εφαρμογή ως προσθετικά μέλη ΟΜΑΔΑ B7: Κοντούδης Γεώργιος Κατηγορία: Βιβλιογραφικό ShortName: Robot-Hands-Prosthetic B7

Ανασκόπηση ρομποτικών χεριών Κατηγορίες ρομποτικών χεριών Aλληλεπίδραση ανθρώπου-ρομπότ(HRI)

Ομαδα: Λουίζα-Ελπίδα Δούναβη Ορέστης Κουλαχίδης B8B8

ΘΕΜΑ: Πειραματικές μέθοδοι στη συστημική βιολογία ΟΜΑΔΑ: Κοντάρη Μαρία Κατηγορία: Online course ShortName: Experimental_methods B10B10

Course Syllabus Week1Introduction WeeK2Deep mRNA Sequencing Week3Mass Spectrometry-Based Proteomics Week4 Mid-term Exam Week5Flow and Mass Cytometry for Single Cell Protein Levels and Cell Fate Week6Live-cell Imaging for Single Cell Protein Dynamics Week7aIntegrating and Interpreting Datasets with Network Models and Dynamical Models Week7bOverview and Conclusions Week8Final Exam

ΘΕΜΑ: Νανοσυστήματα μεταφοράς φαρμακομορίων ΟΜΑΔΑ: Τζανόπουλος Αντώνιος ΚΑΤΗΓΟΡΙΑ: Βιβλιογραφικό B11 NO SLIDE SENT

Fabrication with 3d printing l Εισαγωγή lΠροσδιορισμός μεθόδων 3d printing(βιομίμηση, αυτοσυναρμολόγηση, μικροόργανα) lΤεχνικές bioprinting(inject, microextrusion, laser assisted bioprinting) lΠρώτες ύλες για 3d printing lΣυμπεράσματα B12B12 Δημήτρης Ζαρκάδας

Computational-Υπολογιστικά Συνεργάτες: Θεώδορος Σακελλαρόπουλος

Εμβιομηχανική και Βιοϊατρική Τεχνολογία Μαυράκης Ευάγγελος Y1Y1

Κυριότερα είδη δικτύων:  Protein-protein interaction (PPI) networks  Regulatory networks (GRNs)  Signal transduction networks  Metabolic networks  Βiochemical networks

Εξήγηση Βιολογικού Φαινομένου  Cell Signaling η διαδικασία μεταφοράς της πληροφορίας από προς και μέσα στα κύτταρα.  Κινάσες: Μεταφέρουν πολλές πληροφορίες στα κύτταρα (πολλαπλασιασμός, μίτωση, απόπτωση, γονιδιακή έκφραση)  ΜAPK: Πρωτεϊνικές Κινάσες Ενεργοποιούμενες από Μιτογόνα

Τεχνολογική Ανάγκη  Ανάγκη Μοντελοποίησης Παραγωγής Κινασών στα Κύτταρα  Δημιουργία φαρμάκων που εμποδίζουν κάποιο επίπεδο του signaling αλλά ποιο;  Μείωση πολλαπλασιασμού κυττάρων (καρκίνος)  Αύξηση παραγωγής ινσουλίνης (διαβήτης)

Πειραματικά Δεδομένα

Μοντελοποίηση  Κάθε διάγραμμα μας δίνει την συγκέντρωση μιας κινάσης με δεδομένη διέγερση και σε δεδομένο περιβάλλον  Διαφορική Εξίσωση dCk/dt = - k1 * Ck + k2 * Cs  Εύρεση των k1, k2 για να ταιριάζει η υπολογιστική επίλυση της δ.ε. στα πειραματικά δεδομένα με μεθόδους αιτιοκρατικής βελτιστοποίησης.

Εμβιομηχανική και Βιο-Ιατρική Τεχνολογία Ομάδα : Μάριος Δαμίγος, Αθανάσιος Λιατσικούρας Υπολογιστικό Θέμα InfoGraphics Y2 Συνεργάτες: Θεώδορος Σακελλαρόπουλος