Petar V. Todorov N EGATIVE G ENE S ENSOR S YSTEMS FOR MICRO RNA D ETECTION USING C HERRY Carlos Loya Van Vactor Laboratory.

Slides:



Advertisements
Παρόμοιες παρουσιάσεις
KB = (B ↔ p v q) & ~ B α= ~ p. (B ↔ p v q) & ~ B.
Advertisements

ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΘΕΣΣΑΛΙΑΣ
Παρουσίαση πρακτικής άσκησης Ιουλίου – Αυγούστου 2012 Δημήτρης Κοκορέτσης Α.Μ.: Τμήμα Γεωπονικής Βιοτεχνολογίας, Εργαστήριο Φυσιολογίας και Μορφολογίας.
Το Θέρμο είναι κωμό- πολη της Αιτωλοακα- ρνανίας με επίσημο πληθυσμό κα- τοίκων.
Στον πλανήτη μας απαντώνται 92 χημικά στοιχεία ελεύθερα στο περιβάλλον. Από αυτά, 27 είναι απαραίτητα για τη σύσταση των οργανισμών. Χημικά στοιχεία όπως.
ΠΥΡΙΤΙΟ ΟΠΤΙΚΕΣ ΙΝΕΣ Τα είναι οπτικές ίνες; Οι οπτικές ίνες είναι πολύ λεπτά νήματα φτιαγμένα από πλαστικό ή γυαλί, με διάμετρο μικρότερη των 8μm μέσα.
ΣΥΓΚΡΙΤΙΚΗ ΦΥΣΙΟΛΟΓΙΑ ΖΩΩΝ 39-40, 28 Μα ΐ ου 2015 Π.Παπαζαφείρη Βασικοί μηχανισμοί προσαρμογής Προσαρμογή σε μοριακό και γονιδιακό επίπεδο Επίπεδα ελέγχου.
Απόδιακου Αναστασία Τμήμα Βιοτεχνολογίας Γεωπονικού Πανεπιστημίου Αθηνών Φορέας πρακτικής άσκησης : Εργαστήριο Φυσιολογίας και Μορφολογίας φυτών ΓΠΑ Επιβλέπουσα.
ΡΑΔΙΕΝΕΡΓΕΙΑ Η ΕΠΙΔΡΑΣΗ ΤΗΣ ΣΤΟΝ ΑΝΘΡΩΠΙΝΟ ΟΡΓΑΝΙΣΜΟ.
Α ) Κύτταρο Β ) Δομές DNA - RNA Παρουσίαση Βιολογίας.
Ιλιάδα Μονομαχίες. Μονομαχία:Πάρη και Μενέλαου Ο Πάρης προβάλει απο το Τρωικό στράτευμα εναντίον του Μενέλαου.Πρίν την μονομαχία ο Πάρης κυριεύεται από.
Σύμφωνα με την European Federation of Biotechnology…
Ανανεώσιμες Πηγές Ενέργειας
Η θέση της χρωματίνης στον πυρήνα είναι τυχαία ή όχι
Κεφάλαιο 4ο: Τεχνολογία του ανασυνδυασμένου DNA
Γενετική και εξέλιξη του ανθρώπινο εγκεφάλου
Πρωταθλητές στο κάπνισμα οι Έλληνες μαθητές.
Αντικείμενο και σημασία της Γενετικής:
ΕΠΙΔΡΑΣΕΙΣ ΤΩΝ ΜΗΧΑΝΙΣΜΩΝ ΤΩΝ ΤΟΞΙΝΩΝ
ΕΛΛΗΝΟΓΑΛΛΙΚΗ ΣΧΟΛΗ ΠΕΙΡΑΙΑ «ΑΓΙΟΣ ΠΑΥΛΟΣ»
Πρωτεΐνες μεταφοράς οξυγόνου: μυοσφαιρίνη,
Η ΦΙΛΙΑ ΣΤΗΝ ΠΟΡΕΙΑ ΤΗΣ ΙΣΤΟΡΙΑΣ
Τρούγκος Κ Αν. Καθ. Βιολογικής Χημείας
Γενετική μηχανική, ανασυνδυασμένο DNA, ΑΑΠ (PCR)
ΕΙΣΑΓΩΓΗ ΣΤΗ ΦΥΣΙΟΛΟΓΙΑ ΤΟΥ ΑΝΘΡΩΠΟΥ
ΤΑ ΕΛΛΗΝΙΚΑ ΣΥΝΤΑΓΜΑΤΑ
ΚΕΦΑΛΑΙΟ 1ο ΓΕΝΕΤΙΚΟ ΥΛΙΚΟ ΜΕΡΟΣ Β
ΕΙΚΟΝΑ 6.13 Θέσεις έναρξης αντιγραφής σε ευκαρυωτικά χρωμοσώματα. Η αντιγραφή ξεκινά από πολλαπλές θέσεις έναρξης (ori), καθεμία από τις οποίες σχηματίζει.
Πολυμεσικές Υπηρεσίες στην Υγεία (ΛΟΓ51) 5. Βιοπληροφορική
2η διάλεξη: Αμινοξέα και πρωτεΐνες, μέρος Α
AIDS Σύνδρομο επίκτητης ανοσολογικής ανεπάρκειας
Η βιολογική εξέλιξη- O κόσμος του RNA
ΓΗΡΑΝΣΗ – ΤΕΛΟΜΕΡΑΣΗ – ΚΛΩΝΟΠΟΙΗΣΗ
Τα μόρια της ζωής.
ΔΙΑΓΩΝΙΣΜΟΣ ΓΙΑ ΤΗ ΔΙΑΦΥΛΙΚΗ ΙΣΟΤΗΤΑ
ΚΥΤΤΑΡΟ: Η ΘΕΜΕΛΙΩΔΗΣ ΜΟΝΑΔΑ ΤΗΣ ΖΩΗΣ
Ο ταφικός κύκλος Β των Μυκηνών και
3η θεματική ενότητα Δόγμα Βιολογία
Βησσαρίων ο Τραπεζούντιος
Περιβαλλοντολόγοι : Εργασία 1
Διατήρηση και μεταβίβαση της γενετικής πληροφορίας
ΤΟ ΓΕΝΕΤΙΚΟ ΥΛΙΚΟ ΟΡΓΑΝΩΝΕΤΑΙ ΣΕ ΧΡΩΜΟΣΩΜΑΤΑ
Η θεμελιώδης μονάδα ζωής
Τεχνικές και Μεθοδολογία
ΥΔΑΤΑΝΘΡΑΚΕΣ 2o ΓΕΛ ΧΑΪΔΑΡΙΟΥ.
Retinoblastoma Gene p53 Gene.
Η ΔΟΜΗ ΤΩΝ ΝΟΥΚΛΕΙΚΩΝ ΟΞΕΩΝ
Θέρμο Αιτωλοακαρνανίας
Μάθημα 8ο, ΤΡΟΦΗ & ΤΡΟΦΙΜΑ
Ηλεκτροφόρηση πρωτεϊνών και νουκλεϊκών οξέων
ΒΙΟΛΟΓΙΑ Γ΄ ΓΥΜΝΑΣΙΟΥ 3ο Γυμνάσιο Ναυπάκτου Α. Δρίβας
Κυκλοφοριακή αγωγή Ένα πρόγραμμα για να μάθουμε να κυκλοφορούμε με ασφάλεια. Β΄ Δημοτικού 12ου Δημοτικού Σχολείου Βόλου Υπεύθυνοι προγράμματος : Θωμάς.
ΕΚΘΕΣΗ –ΕΚΦΡΑΣΗ Γ΄ ΛΥΚΕΙΟΥ
Ασκηση 1: Εισαγωγή στην Γενετική Ανάλυση
Τεχνικές της Μοριακής Βιολογίας
ΑΝΤΙΓΡΑΦΗ DNA.
נושא 5: מגנטים ומגנטיות.
ΝΟΥΚΛΕΪΚΑ ΟΞΕΑ.
Ομήρου Ιλιάδα Ζ
Παρατήρηση των χρωμοσωμάτων - καρυότυπος
Ασκηση 3 Ηλεκτροφόρηση DNA.
ΕιΣαγωγη ΣτιΣ ΒιοϊατρικεΣ ΕπιΣτημεΣ- ΑΣφαλεια Βιοϊατρικων ΕργαΣτηριων
Λειτουργίες του γενετικού υλικού
Ασφαλής χρήση του κινητού τηλεφώνου
Ομήρου Ιλιάδα Ζ
CAPN1, CAPN7, CTSB, and CTSL mediated the degradation of SMN proteins.
5.Μοριακές τεχνικές στη διάγνωση των λοιμώξεων
Fig. 1 Prelamin A increases CK2 accumulation in the NM.
Μεταγράφημα παρουσίασης:

Petar V. Todorov N EGATIVE G ENE S ENSOR S YSTEMS FOR MICRO RNA D ETECTION USING C HERRY Carlos Loya Van Vactor Laboratory

W HAT IS MICRO RNA? Non-protein coding ribonucleic acid Single-stranded ~21 nucleotides Important regulator of gene expression Acts by binding mRNA In Drosophila ~156 miRs and ~600+ in humans Shown to be involved in: – Development – Differentiation – Proliferation – Cell death – Metabolic control – Transposon silencing – Antiviral defense V. Narry Kim, Jinju Han & Mikiko C. Siomi, 2009

AAAA AGO2 GW18 2 Inhibition at Initiation of Translation 1 Inhibition of Translation Elongation AAAA AGO2 GW Endonucleolytic cleavage AND Degradation AGO1/2 3 AAAA Carlos Loya

C URRENT M ETHODS FOR MI R D ETECTION : I N SITU HYBRIDIZATION (D ROSOPHILA E MBRYO ) miR-315 miR-124miR-8 miR-13b-2 A. Aboobaker, P. Tomancak, N. Patel, G. Rubin, & E. Lai, 2005

N EGATIVE S ENSOR S YSTEM T UBULIN PROMOTER EGFP miR-x Binding Site x3 FLUORESCENCE!

miR-8 Sensor (EGFP) MUSCLE (PHALLOIDIN) W1118 miR-8 C URRENT M ETHODS FOR MI R D ETECTION : N EGATIVE F LUORESCENCE S ENSOR Motor neuron Brain (Extracts) Muscle (Extracts) ControlmiR-8 ControlmiR-8 α -GFP α - Tub α -GFP α - Tub Western Blots Brain Carlos Loya et al. 2009

C LONING M AP pAc-Cherry KpnI-Cherry-NotI ptub-KpnI-EGFP-NotI-SV40 ptub- -SV40 -EGFP- -Cherry- ptub- -SV40 ptub-Cherry- SV40 PCR & Purify Restriction Digest & Purify Restriction Digest Ligate Run Gel & Extract

PTUB -EGFP-SV40 V ECTOR ptub-EGFP-SV40

R ESTRICTION D IGEST : K PN I & N OT I ptub- -SV40 -EGFP-

ptub- -SV40 & EGFP 10kb Ladder

C LONING M AP pAc- Cherry KpnI-Cherry- NotI ptub-KpnI-EGFP-NotI-SV40 ptub- -SV40 -EGFP- -Cherry- ptub- -SV40 ptub-Cherry- SV40 PCR & Purify Restriction Digest & Purify Restriction Digest Ligate Run Gel & Extract

95°C DENATURE 60°C ANNEAL PRIMERS 72°C REPLICATE DNA Cherry

95°C DENATURE 60°C ANNEAL PRIMERS 72°C REPLICATE DNA

95°C DENATURE 60°C ANNEAL PRIMERS 72°C REPLICATE DNA

CherryNotIKpnI

ptub-Cherry-SV40 ptub- -SV40

F ROM V ECTOR TO T RANSGENIC A NIMAL O RDER TRANSGENIC LINE E XPRESSING DNA V ECTOR 3. M INIPREP 2. T RANSFORM & A MPLIFY B ACTERIA 1. V ERIFY S EQUENCE

MICRO RNA S OF I NTEREST miR-315 miR-124 miR-8 miR-13b-2 A. Aboobaker, P. Tomancak, N. Patel, G. Rubin, & E. Lai, 2005

SPECIAL THANKS TO PROF. DAVID VAN VACTOR CARLOS LOYA