UNIVERSITATEA POLITEHNICA TIMIŞOARA

Παρουσίαση με θέμα: "UNIVERSITATEA POLITEHNICA TIMIŞOARA"— Μεταγράφημα παρουσίασης:

1 UNIVERSITATEA POLITEHNICA TIMIŞOARA
STUDII MASTER EB 1 1 1 1

2

3 BIOINFORMATICA STRUCTURALA - II
Prof Dr George I Mihalaş UMF Victor Babeş 1 1 1 1

4 CURSUL 1 1 1 1 1

5 Planul cursului Introducere Microscopia Metode spectrometrice
Obiectul și capitolele binformaticii Metode de studiu a structurilor Microscopia Microscopia optică Microscopia electronică Metode spectrometrice Spectrometria optică Spectrografia de masă

6 Introducere

7 1.1. Obiectul și capitolele bioinformaticii
OBIECTUL BIOINFORMATICII: dezvoltarea sistematică şi aplicaţiile tehnicii de calcul şi soluţiilor computaţionale pentru analiza datelor biologice obţinute din experienţe, modele sau baze de date. CAPITOLELE PRINCIPALE: Bioinformatica secvențială Bioinformatica structurală Modelare moleculară și Rețele regulatoare

8 1.2. Metode experimentale de studiu în bioinformatica structurală
Microscopia: optică, electronică Spectrometria optică Spectrografia de masă Difracția razelor X Imagistica RMN Flow-citometria Tehnici de secvențiere Alte metode: Microarrays, PCR

9 2. Microscopie

10 2.1. Microscopia optică 1. Definiție: Microscopul optic = instrument optic ce realizează imagini mărite ale unui obiect 2. Părți componente: obiectiv, ocular, sursa de lumina ... 3. Formarea imaginii:

11 - Grosisment (mărire lineară) G = i / o
4. Caracteristici - Grosisment (mărire lineară) G = i / o - Rezoluție d = 1.22 λ / 2 n sin ϑ 5. Tipuri - iluminare: directă, oblică, fond întunecat - fluorescență, dual-photon - contrast de fază, cu lumină polarizată etc.

12 6. Fluorescența – single photon / dual photon
nivele energetice stabile, excitate stări metastabile tranziții radiative și neradiative dezavantaj: excitare simultană a mai multor structuri microscopie confocală excitare punctuală dual-photon excitare în două trepte

13 2.2. Microscopia electronică
Creșterea rezoluției – prin micșorare λ microscopie în UV (dar nu raze X  difracție !) microscopie electronică Principiu Louis de Broglie – caracterul dual al particulelor (electronul) λ = h / p = h / m.v Sursă de electroni accelerați v = √ 2 e U

14 3. Schemă

15 Interacțiunea electronilor cu materia
5. Tipuri de microscoape electronice - de transmisie - cu baleiaj (pentru probe biologice) - de reflexie

16 6. Imagini

17 3. Spectrometrie

18 1. Spectrul undelor electromagnatice
3.1. Spectroscopia optică 1. Spectrul undelor electromagnatice

19 2. Nivele energetice în atom
absorbție, emisie fotoni ε = E2 – E1 = h.ν tranziții (UV, viz.)

20 3. Spectre moleculare nivele de vibrație - spectroscopia în infraroșu (sticla înlocuită cu sare) - spectre de benzi

21 4. Spectrele moleculelor organice
Identificare: legături chimice - aminoacizi - apa

22 3.2. Spectrografia de masă Principiu - devierea sarcinilor în câmp electric și magnetic - raza traiectoriei ~ masa: R = m.v / q.B

23 2. Schemă

24 3. Pregătirea preparatului

25 4. Prezentarea rezultatelor

26 5. Interpretarea rezultatelor

27 PAUZA