Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος ΟΛΟΚΛΗΡΩΜΕΝOI ΒΙΟΑΙΣΘΗΤΗΡEΣ: ΑΡΧΕΣ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΑΣ ΚΑΙ ΠΡΟΟΠΤΙΚΕΣ K. Mισιακόs Ινστιτούτο Μικροηλεκτρονικής ΕΚΕΦΕ «ΔΗΜΟΚΡΙΤΟΣ»

Παρουσίαση με θέμα: "Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος ΟΛΟΚΛΗΡΩΜΕΝOI ΒΙΟΑΙΣΘΗΤΗΡEΣ: ΑΡΧΕΣ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΑΣ ΚΑΙ ΠΡΟΟΠΤΙΚΕΣ K. Mισιακόs Ινστιτούτο Μικροηλεκτρονικής ΕΚΕΦΕ «ΔΗΜΟΚΡΙΤΟΣ»"— Μεταγράφημα παρουσίασης:

1 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος ΟΛΟΚΛΗΡΩΜΕΝOI ΒΙΟΑΙΣΘΗΤΗΡEΣ: ΑΡΧΕΣ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΑΣ ΚΑΙ ΠΡΟΟΠΤΙΚΕΣ K. Mισιακόs Ινστιτούτο Μικροηλεκτρονικής ΕΚΕΦΕ «ΔΗΜΟΚΡΙΤΟΣ»

2 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος ΙΝΣΤ. ΜΙΚΡΟΗΛΕΚΤΡΟΝΙΚΗΣ: ΟΠΤΟΗΛΕΚΤΡΟΝΙΚΟΙ ΜΕΤΑΤΡΟΠΕΙΣ ΙΡΡΠ: ΕΠΙΛΟΓΗ ΒΙΟΜΟΡΙΩΝ- ΑΝΤΙΔΡΑΣΕΩΝ-ΑΝΑΛΥΣΕΩΝ ΤΡΟΠΟΠΟΙΗΣΕΙΣ ΕΠΙΦΑΝΕΙΩΝ Δρ. Σ. Κακαμπάκος, Δρ. Π. Πέτρου

3 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος ΒΙΟΑΙΣΘΗΤΗΡΕΣ ΚΑΙ ΒΙΟΨΗΦΙΔΕΣ: ΟΜΟΙΟΤΗΤΕΣ-ΔΙΑΦΟΡΕΣ ΕΠΙΠΕΔΗ ΤΕΧΝΟΛΟΓΙΑ ΣΕ ΒΙΟΜΟΡΙΑΚΑ ΔΙΑΓΝΩΣΤΙΚΑ

4 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος ΤΕΧΝΙΚΕΣ ΑΝΑΠΤΥΓΜΕΝΕΣ ΣΤΗΝ ΤΕΧΝΟΛΟΓΙΑ ΤΩΝ ICs ΜΕΤΑΦΕΡΟΝTAI ΣΤΑ ΒΙΟΜΟΡΙΑΚΑ ΔΙΑΓΝΩΣΤΙΚΑ

5 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος ΠΟΛΛΕΣ ΕΤΑΙΡΙΕΣ ΗΜΙΑΓΩΓΩΝ ΗΔΗ ΔΡΑΣΤΗΡΙΟΠΟΙΟΥΝΤΑΙ ΣΤΟ ΧΩΡΟ ΤΩΝ ΙΑΤΡΙΚΩΝ ΔΙΑΓΝΩΣΤΙΚΩΝ ΚΟΙΝΟ ΣΤΟΙΧΕΙΟ: ΕΠΙΠΕΔΗ TEXNOΛΟΓΙΑ

6 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος ΒΑΣΙΚΗ ΔΙΑΦΟΡΑ ΒΙΟΑΙΣΘΗΤΗΡΕΣ: EΠΙΤΟΠΟΥ ΠΡΟΣΔΙΟΡΙΣΜΟΙ ΠΕΡΙΟΡΙΣΜΕΝΟΥ ΑΡΙΘΜΟΥ ΑΝΑΛΥΤΩΝ ΒΙΟΨΗΦΙΔΕΣ: ΜΑΖΙΚΗ ΕΞΑΓΩΓΗ ΔΕΔΟΜΕΝΩΝ (GENOMICS)

7 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος ΨΗΦΙΔΕΣ DNA Microarray Genomics ΨΗΦΙΔΕΣ ΠΡΩΤΕΙΝΩΝ Microarray Proteomics

8 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος Fluorescent scan of a high-density microarray printed using a GeneJet™ (Incyte). Piezojet delivery of 200-pl droplets Μικροσυστοιχία γονιδίων επισημασμέμων με διάφορα φθορίζοντα μόρια © 1998, Elsevier Science Ltd.

9 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος Η Μικροτεχνολογία παρέχει με κατάλληλες τροποποιήσεις: σμίκρυνση, ακρίβεια, αυτοματισμούς, επαναληψιμότητα: ΠΡΟΑΠΑΙΤΟΥΜΕΝΑ ΓΙΑ ΒΙΟΨΗΦΙΔΕΣ KAI BIOAIΣΘΗΤΗΡΕΣ

10 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος ΣΥΝΙΣΤΩΣΕΣ ΤΩΝ ΒΙΟΑΙΣΘΗΤΗΡΩΝ, ΒΙΟΨΗΦΙΔΩΝ: ΣΤΕΡΕΟ ΥΠΟΣΤΡΩΜΑ ΣΤΟΙΧΕΙΑ AΝΑΓΝΩΡΙΣΗΣ (probes or capture molecules) ΣΧΗΜΑΤΟΠΟΙΗΣΗ (patterning)

11 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος Στερεό Υπόστρωμα Χαλαζίας, Γυαλί, Πυρίτιο Πολυμερή Πρέπει να έχουν καλές ιδιότητες πρόσδεσης βιομορίων και μικρό αυτοφθορισμό Θέματα σταθερότητας

12 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος ΣΤΟΙΧΕΙΑ AΝΑΓΝΩΡΙΣΗΣ (Probe, capture molecule) DNA: ssDNA ολιγονουκλεοτίδια (oligonucleotides) Πρωτείνες: αντισώματα, αντιγόνα

13 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος Οι πρωτείνες προσροφούνται απευθείας σε πολυμερή η σε τροποποιημένο γυαλί-χαλαζία- πυρίτιο 3-aminopropyltriethoxysilane (APTES). Το DNA ακινητοποιείται επιπλέον είτε ομοιοπολικά είτε μέσω πρωτεινών

14 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος NUNC SLIDES FOR BIO-ARRAYS

15 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος Packaged Chips BIOMIC Project

16 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος ΕΠΙΛΕΚΤΙΚΗ ΤΡΟΠΟΠΟΙΗΣΗ ΤΗΣ ΤΗΣ ΕΠΙΦΑΝΕΙΑΣ ΤΟΥ ΥΠΟΣΤΡΩΜΑΤΟΣ ΜΕ ΛΙΘΟΓΡΑΦΙΚΕΣ Η ΑΛΛΕΣ ΦΥΣΙΚΟΧΗΜΙΚΕΣ ΤΕΧΝΙΚΕΣ «ΠΡΟΣΩΠΟΠΟΙΗΜΕΝΟ» ΥΠΟΣΤΡΩΜΑ

17 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος © ieee, spectrum, March 2001 Copyright @ IEEE

18 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος © ieee, spectrum, March 2001 Copyright @ IEEE

19 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος Εναπόθεση: Με επαφή (pin printing) ή χωρίς επαφή (Ink Jet)

20 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος PERKIN-ELMER, PIEZO ARRAY SPOTTER

21 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος GeSiM Pipetting Sequence

22 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος AF 546 labeled streptavidin (red spots) and AF 488 labeled anti-rabbit IgG antibody (green spots).

23 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος Toξικολογία Ανακάλυψη νέων φαρμάκων Μελέτη Γονιδιώματος Οι Βιοψηφίδες χρησιμοποιούνται: Μέσω της μαζικής εξαγωγής βιολογικών δεδομένων

24 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος BIOARRAYS: Optical Detection: Scanners or Confocal or epi-fluorescence microscopy

25 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος ΒΙΟΑΙΣΘΗΤΗΡΕΣ ΒΙΟΨΗΦΙΔΕΣ ΧΑΜΗΛΗΣ ΠΥΚΝΟΤΗΤΑΣ Αλλά με αυτόνομη ενσωματωμένη ανάγνωση για φορητά βιοαναλυτικά μικροσυστήματα. Ιατρικές, περιβαλλοντικές αναλύσεις, ασφάλεια τροφίμων.

26 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος 3. Διέγερση-Ανίχνευση Φυσικός Μετατροπέας (Transducer System)

27 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος ΜΕΤΑΤΡΟΠΕΙΣ ΗΛΕΚΤΡΟΧΗΜΙΚΟΙ ΜΙΚΡΟΖΥΓΟΙ SAW ΟΠΤΙΚΟΙ

28 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος OΠTIKH ΑNIXNEYΣΗ: Η ΠΛΕΟΝ ΕΥΑΙΣΘΗΤΗ, ΠΡΟΣΑΡΜΟΣΙΜΗ, ΚΑΤΑΛΛΗΛΗ ΓΙΑ ΠΥΚΝΕΣ ΣΥΣΤΟΙΧΙΕΣ

29 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος SPR PRINCIPLE XANTEC

30 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος Sample Preprocessing Analytical Instrument Optical Electric Thermal Mechanic Fluidic Operator Data Energy Readout Waste Micro- fluidic Electric Reagents Optical By Hans Ruf, IBMT

31 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος

32 Monolithic Silicon Optoelectronic Transducers  Evanescent Wave BIOMIC Project

33 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος © SiO 2 Spacer Formation Formation of Self-aligned light emitting avalanche Diodes, silicon nitride waveguides, and detectors BIOMIC Project

34 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος WAVEGUIDE BENDING ON THE DETECTOR SIDE

35 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος LED under excitation

36 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος monolithic silicon optocouplers Emitters on the left, detectors on the right BIOMIC Project

37 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος A. Optocoupler quantum efficiency B. LED Light Spectrum and gold nanoparticle absorption

38 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος OPTOCOUPLER IS CONVERTED TO BIOSENSOR AFTER SURFACE ACTIVATION OF THE NITRIDE FIBER BY APTES AND THEN BY THE COATING OF THE BIOMOLECULAR PROBE. GOLD NANOPARTICLE LABELS EMPLOYED  Evanescent Wave

39 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος BIOSENSOR CHIP LAYOUT: NINE MONOLITHIC OPTOCOUPLERS+ SELECTIVE BIOAFFINITY LAYERS+ MICROFLUIDIC MODULE

40 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος Waste Biochip Fluidic tip Peristaltic pump BIOMIC Project Fluidic Diagram

41 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος Biotin-Streptavidin model assay with gold nanoparticle labels

42 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος Real time dual analyte assay 1 nM Au-anti-mIgG solution for 25 min, 52 pM Au-streptavidin

43 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος SNP DETECTION IN DNA Odd fibers: wild-type, 5΄-Biotin-GCGGGAGCGCCCCAC AAACTCCAGGATCTTTTGA-3 Even fibers : mutant, 5΄- Biotin-GCGGGAGTGCCCCACAAACTC CAGGATCTTTTGA-3΄ BIOMIC Project

44 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος Coating: mouse IgG (1), biotinylated BSA (2) and rabbit IgG (3) Reaction:R-phycoerythrin labeled anti-mouse IgG antibody (5 nM), streptavidin (2 nM) and anti-rabbit IgG antibody (10 nM), respectively.

45 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος Hybridization and Wash Fullmatch vs Mismatch wild type 5’-b-TCC AAA GCG AGC AA-3’, and mutant sequence (SNP) 5’-b-TCC AAA GTG AGC AA-3’ were immobilized on different fibers

46 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος Real time, hybridization assay signal for various concentrations of the full match to the 5’-b– GAG AAT CCC AGG ACA G-3’ immobilized sequence 1 nM, 10 nM, 40 nM, 160 nM, and 500 nM labeled with AlexaFluor647.

47 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος Single binding event biotin-streptaviding labelled with PS particles

48 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος GOLD SPR SHIFTS WITH RI CHANGES

49 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος Label free antibody assay. 66.67 nM anti-mouse IgG antibody in PBS, 30 min. 10 nM mouse IgG in PBS, 30 min. 30 nM anti-mouse IgG antibody in PBS buffer, 30 min.

50 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος Normalized signal response obtained by reacting biotinylated BSA immobilized on 1 μm wide lines (2 μm period) with 10 nM streptavidin. Up to 1: coating buffer 1-2: coating with biotinylated BSA 2-3: blocking 3 to end: reaction with 10 nM streptavidin LABEL FREE DETECTION PHOTONIC CRYSTAL ENGINEERING

51 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος Packaged Chips BIOMIC Project

52 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος Fluid Footprint and Wire-Bonding Scheme BIOMIC Project

53 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος Packaging with LCCC LCCCChip Microfluidic module (COC) Fluid El. contact (socket) Wire bonds Epoxy potting Glue BIOMIC Project

54 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος READ-OUT ELECTRONICS FOR PORTABLE BIOANALYTICAL MICROSYSTEM BIOMIC Project

55 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος

56 SINGLE DETECTOR CONFIGURATION -”NEMOSLAB” PROJECT

57 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος NEW PACKAGING CONCEPT, “NEMOSLAB” PROJECT

58 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος MINIATURIZED MICROSYSTEM

59 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος ΠΡΟΒΛΗΜΑΤΑ ΟΛΟΚΛΗΡΩΣΗ ΕΠΕΞΕΡΓΑΣΙΑΣ ΔΕΙΓΜΑΤΟΣ (ΓΙΑ DNA) ΣΤΑΘΕΡΟΤΗΤΑ ΠΡΩΤΕΙΝΩΝ ΜΕΙΩΣΗ ΚΟΣΤΟΥΣ

60 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος ΕΥΧΑΡΙΣΤΙΕΣ EU-IST -2001-PROJECT “BIOMIC” EU-IST -2004-PROJECT “NEMOSLAB”

61 Aπρίλιος. 2008, Δημόκριτος Monolithically integrated interferometric biochiPs for label-free earlY deTection of Human dIseAses (PYTHIA) Integrated BB-MZI device (schematic)Integrated BB-MZI device (cross-section) IMEL: Ι. Ράπτης, Ε. Μακαρώνα, Κ. Μισιακός IRRP: Π. Πέτρου, Σ. Κακαμπάκος