Δύο χρήσιμες εφαρμογές ESTs στο δάκο της ελιάς: κυτταρογενετικός χάρτης και EPIC δείκτες Τσουμάνη ΚΤ1, Αυγουστίνος ΑΑ1,2,

Παρουσίαση με θέμα: "Δύο χρήσιμες εφαρμογές ESTs στο δάκο της ελιάς: κυτταρογενετικός χάρτης και EPIC δείκτες Τσουμάνη ΚΤ1, Αυγουστίνος ΑΑ1,2,"— Μεταγράφημα παρουσίασης:

1 Δύο χρήσιμες εφαρμογές ESTs στο δάκο της ελιάς: κυτταρογενετικός χάρτης και EPIC δείκτες
Τσουμάνη ΚΤ1, Αυγουστίνος ΑΑ1,2, Κακάνη ΕΓ1, Δροσοπούλου Ε3, Μαυραγάνη-Τσιπίδου Π3, Ματθιόπουλος ΚΔ1 1Τμήμα Βιοχημείας & Βιοτεχνολογίας, Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας, Λάρισα 2Τμήμα Βιολογίας, Πανεπιστήμιο Πατρών 3Τμήμα Βιολογίας, Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης

2 Απομόνωση EST (expressed sequence tags) δεικτών
Προσδιορισμός της λειτουργίας των αντίστοιχων γονιδίων. Ταξινόμηση και κατηγοριοποίηση των αντίστοιχων γονιδίων του δάκου με βάση την μοριακή αλλά και την βιολογική τους λειτουργία κατά GO (Gene Ontology terms).

3 Δημιουργία κυτταρογενετικού χάρτη του δάκου
IIIR IIIL e2 e3 41 109 111 90 IIR IIL β-tubulin 165 106 Ace 50 117 37 100 92 IL IR s36 Sxl PS2a white 72 81 87 122 VR VL Hsp70 38 105 43 104 200 paramyosin sodI IVR IVL scarlet hsp83 113 88 94 110 168 189 Χαρτογράφηση 35 EST δεικτών στα πολυταινικά του χρωμοσώματα.

4 Ανάπτυξη EPIC δεικτών (Exon-Primed Intron-Crossing)
Δια-ειδική ενίσχυση αλληλουχίας ιντρονίων σε 10 είδη των Tephritidae. Σύγκριση αλληλουχιών – διερεύνηση συγγένειας epicBo 242 epicBo 149

5 Συζήτηση EST δείκτες Κυτταρογενετικός χάρτης EPIC δείκτες
μεγάλος αριθμός σημείων εισόδου στο γονιδίωμα εκτίμηση της οργάνωσης του γονιδιώματος του δάκου Κυτταρογενετικός χάρτης εμπλουτισμός των διαθέσιμων χαρτών (ως τώρα μόνο 10 ετερόλογοι δείκτες και 13 μικροδορυφορικοί κλώνοι) διερεύνηση συνταινικότητας μεταξύ συγγενικών ειδών EPIC δείκτες διαλεύκανση περιπτώσεων συμπλεγμάτων ειδών (complex species)