Εργαστηριακό Κέντρο Φυσικών Επιστημών Αγίων Αναργύρων 28/02/2007

Slides:



Advertisements
Παρόμοιες παρουσιάσεις
ΒΙΟΛΟΓΙΑ ΘΕΤΙΚΗΣ ΚΑΤΕΥΘΥΝΣΗΣ Γ΄ΛΥΚΕΙΟΥ
Advertisements

15.2.
ΚΕΦΑΛΑΙΟ 4ο ΤΕΧΝΟΛΟΓΙΑ ΤΟΥ ΑΝΑΣΥΝΔΥΑΣΜΕΝΟΥ DNA
3 ο ΣΥΝΕΔΡΙΟ ΤΩΝ ΤΕΛΩΝΕΙΑΚΩΝ ΧΗΜΙΚΩΝ ΤΗΣ ΕΥΡΩΠΗΣ Αθήνα, Ιουνίου 2007.
Πειραματική Διδασκαλία στη Βιολογία της Γ΄ Γυμνασίου Κεφάλαιο 3
ΕΦΑΡΜΟΣΜΕΝΗ ΜΟΡΙΑΚΗ ΒΙΟΛΟΓΙΑ
Γονίδια και Γονιδιώματα Μία Συνοπτική Παρουσίαση
γενετικής πληροφορίας
ΕΦΑΡΜΟΣΜΕΝΗ ΜΟΡΙΑΚΗ ΒΙΟΛΟΓΙΑ ΜΑΘΗΜΑ 3&4 ΡΑΜΠΙΑΣ ΘΕΟΔΩΡΟΣ
Μικροσυστοιχίες και ανάλυση δεδομένων
ΑΣΚΗΣΗ ΜΙΚΡΟΣΥΣΤΟΙΧΙΑΣ
DNA μικροσυστοιχίες: βήμα προς βήμα
Εκπαιδευτικές Δραστηριότητες στο ΕΚΕΦΕ “Δημόκριτος”
SAM Significance analysis of Microarrays ΕΦΑΡΜΟΓΗ ΣΤΗΝ ΑΝΤΙΔΡΑΣΗ ΛΕΜΦΟΒΛΑΣΤΟΕΙΔΩΝ ΚΥΤΤΑΡΩΝ ΣΕ ΑΚΤΙΝΟΒΟΛΙΑ ΙΟΝΙΣΜΟΥ.
ΣΥΝΕΙΣΦΟΡΑ ΒΙΟΤΕΧΝΟΛΟΓΙΑΣ
ΚΕΦΑΛΑΙΟ 6ο ΜΕΤΑΛΛΑΞΕΙΣ ΜΕΡΟΣ Β
ΔΙΑΛΕΞΗ 14 Τεχνικές Ανάλυσης – Πειραματικά εργαλεία για την
Το έργο «Εθνικό Πληροφοριακό Σύστημα Έρευνας και Τεχνολογίας (ΕΠΣΕ+Τ) - Γ' ΦΑΣΗ "Αποθετήρια και Επιστημονικά Ηλεκτρονικά Περιοδικά Ανοικτής Πρόσβασης"»
ΑΝΤΙΓΡΑΦΗ, ΕΚΦΡΑΣΗ ΚΑΙ ΡΥΘΜΙΣΗ ΤΗΣ ΓΕΝΕΤΙΚΗΣ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΑΣ
Εφαρμογές της βιοτεχνολογίας στην Ιατρική.
Διάγνωση γενετικών ασθενειών
Θα έλεγες ότι είσαι ένας
Εφαρμογές της Βιοτεχνολογίας στην Ιατρική
ΓΕΝΙΚΟΣ ΜΗΧΑΝΙΣΜΟΣ ΤΗΣ ΜΕΤΑΓΡΑΦΗΣ
Εργασία Πληροφορικής 2 ου Εξαμήνου Συστήματα Στήριξης Οδοντιατρικής Απόφασης (ΣΣΟΑ) Δημάδης Αργύρης Θεοδοσοπούλου Ζωή Παπαδούλης Κων/νος.
Διάγνωση γενετικών ασθενειών
Τεχνικές Γονιδιωματικής Κλωνοποίησης
Μάθημα 8 Από την αλληλουχία του γονιδιώματος στη λειτουργία των γονιδίων.
ΒΑΣΙΚΕΣ ΕΝΝΟΙΕΣ ΒΙΟΛΟΓΙΑΣ & Η ΔΙΔΑΚΤΙΚΗ ΤΗΣ Dr. ΜΙΧΜΙΖΟΣ ΔΗΜΗΤΡΗΣ
ΒΑΣΙΚΕΣ ΕΝΝΟΙΕΣ ΒΙΟΛΟΓΙΑΣ & Η ΔΙΔΑΚΤΙΚΗ ΤΗΣ Dr. ΜΙΧΜΙΖΟΣ ΔΗΜΗΤΡΗΣ
Μοριακή Ταξινόμηση βακτηρίων
Ανάπτυξη κυττάρων σε βιοαντιδραστήρα ΜΙΚΡΟΒΙΑΚΗ ΒΙΟΤΕΧΝΟΛΟΓΙΑ
ΕΞΑΤΟΜΙΚΕΥΜΕΝΗ ΙΑΤΡΙΚΗ
Η ροή της γενετικής πληροφορίας
ΒΙΟΧΗΜΕΙΑ, ΠΕΚ 2014 Γενετική μηχανική, ανασυνδυασμένο DNA, ΑΑΠ (PCR)
Υβριδοποίηση νουκλεϊνικών οξέων- Ανίχνευση αλληλουχιών Όταν ένα υδατικό διάλυμα DNA θερμανθεί στους 100 ο C ή εκτεθεί σε πολύ αλακαλικό pH, σπάζουν οι.
ΣΥΓΚΡΙΤΙΚΗ ΦΥΣΙΟΛΟΓΙΑ ΖΩΩΝ 39-40, 28 Μα ΐ ου 2015 Π.Παπαζαφείρη Βασικοί μηχανισμοί προσαρμογής Προσαρμογή σε μοριακό και γονιδιακό επίπεδο Επίπεδα ελέγχου.
ΡΑΔΙΕΝΕΡΓΕΙΑ Η ΕΠΙΔΡΑΣΗ ΤΗΣ ΣΤΟΝ ΑΝΘΡΩΠΙΝΟ ΟΡΓΑΝΙΣΜΟ.
Η ροή της γενετικής πληροφορίας. Στo DNA βρίσκονται αποθηκευμένες οι πληροφορίες που αφορούν : στον αυτοδιπλασιασμό του →εξασφαλίζοντας έτσι τη μεταβίβαση.
Πρωταθλητές στο κάπνισμα οι Έλληνες μαθητές.
Ε. Περιστέρη1, Σ. Ν. Αυγέρης1, Π. Παπαδοπούλου2, Α. Μισεγιάννη2, Δ. Ι
ΕΠΙΔΡΑΣΕΙΣ ΤΩΝ ΜΗΧΑΝΙΣΜΩΝ ΤΩΝ ΤΟΞΙΝΩΝ
ΕΛΛΗΝΟΓΑΛΛΙΚΗ ΣΧΟΛΗ ΠΕΙΡΑΙΑ «ΑΓΙΟΣ ΠΑΥΛΟΣ»
Από το Αλφαβητάρι του Σχολείου στο Αλφαβητάρι της Ζωής
Οι ΣπουδΕΣ στο ΑριστοτΕλειο ΠανεπιστΗμιο
ΤΕΧΝΙΚΕΣ ΜΟΡΙΑΚΗΣ ΒΙΟΛΟΓΙΑΣ
ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΙΩΑΝΝΙΝΩΝ ΑΝΟΙΚΤΑ ΑΚΑΔΗΜΑΪΚΑ ΜΑΘΗΜΑΤΑ
ΜΔΕ: «Εφαρμογές της Βιολογίας στην Ιατρική»
Γενετική μηχανική, ανασυνδυασμένο DNA, ΑΑΠ (PCR)
ΑΝΤΙΓΡΑΦΗ, ΕΚΦΡΑΣΗ ΚΑΙ ΡΥΘΜΙΣΗ ΤΗΣ ΓΕΝΕΤΙΚΗΣ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΑΣ
ΚΕΦΑΛΑΙΟ 1ο ΓΕΝΕΤΙΚΟ ΥΛΙΚΟ ΜΕΡΟΣ Β
ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΙΩΑΝΝΙΝΩΝ ΑΝΟΙΚΤΑ ΑΚΑΔΗΜΑΪΚΑ ΜΑΘΗΜΑΤΑ
Γονιδιακό “σαμποτάζ” RNAi και “αντικατασκοπεία” CRISPR!
Η βιολογική εξέλιξη- O κόσμος του RNA
Τα μόρια της ζωής.
ΚΥΤΤΑΡΟ: Η ΘΕΜΕΛΙΩΔΗΣ ΜΟΝΑΔΑ ΤΗΣ ΖΩΗΣ
ΑΠΟΔΙΑΤΑΞΗ ΤΩΝ ΝΟΥΚΛΕΙΚΩΝ ΟΞΕΩΝ
ΠΟΛΥΓΟΝΙΔΙΑΚΕΣ ΟΙΚΟΓΕΝΕΙΕΣ-παραδείγματα
Διατήρηση και μεταβίβαση της γενετικής πληροφορίας
ΤΟ ΓΕΝΕΤΙΚΟ ΥΛΙΚΟ ΟΡΓΑΝΩΝΕΤΑΙ ΣΕ ΧΡΩΜΟΣΩΜΑΤΑ
Η θεμελιώδης μονάδα ζωής
Η ΔΟΜΗ ΤΩΝ ΝΟΥΚΛΕΙΚΩΝ ΟΞΕΩΝ
Μάθημα 8ο, ΤΡΟΦΗ & ΤΡΟΦΙΜΑ
ΕΚΘΕΣΗ –ΕΚΦΡΑΣΗ Γ΄ ΛΥΚΕΙΟΥ
ΝΟΥΚΛΕΪΚΑ ΟΞΕΑ.
Τεχνικές της Μοριακής Βιολογίας
Παρατήρηση των χρωμοσωμάτων - καρυότυπος
Λειτουργίες του γενετικού υλικού
Τίτλος εργασίας Πρώτος συγγραφέας1, Δεύτερος συγγραφέας2, Τρίτος συγγραφέας1,2 1Σχετιζόμενο Ίδρυμα/Φορέας 2Σχετιζόμενο Ίδρυμα/Φορέας.
Μεταγράφημα παρουσίασης:

Εργαστηριακό Κέντρο Φυσικών Επιστημών Αγίων Αναργύρων 28/02/2007 Εργαστηριακό Κέντρο Φυσικών Επιστημών Αγίων Αναργύρων 28/02/2007 Υπεύθυνος Εργ. Κέντρου : Καλλίνικος Χαρακόπουλος Επιμέλεια – Παρουσίαση : Λαμπρινή Σιαφάκα Το υλικό αυτό είναι από το σεμινάριο: «Τεχνολογίες αιχμής και η συμβολή τους στο μέλλον των Βιοεπιστημών» Ελληνικό Ινστιτούτο Παστέρ Πρόγραμμα «ΑΝΟΙΧΤΕΣ ΘΥΡΕΣ» 18-20 Δεκεμβρίου 2006

Τί είναι οι μικροσυστοιχίες ? “Οι μικροσυστοιχίες είναι γυάλινα πλακίδια με συστοιχίες εκατοντάδων χιλιάδων ολιγονουκλεοτιδίων/ τμημάτων DNA, που αντιπροσωπεύουν γνωστά ή άγνωστα γονίδια, και στις οποίες μπορεί να υβριδοποιηθεί το DNA ή RNA προς μελέτη, αφού έχει πρώτα σημανθεί με φθορίζουσες χρωστικές”

Δύο κύριες κατηγορίες μικροσυστοιχιών Μικροσυστοιχίες DNA Μικροσυστοιχίες γονιδιακής έκφρασης Array CGH Mutation screening SNP analysis • γονιδίωμα ειδών • γονιδίωμα ιστών • γονιδίωμα ασθενειών κ.α.

Πώς φτιάχνονται/ χρησιμοποιούνται… 1. Ιχνηθέτης 2. Γυάλινη επιφάνεια 3. Τεχνικές εναπόθεσης 4. Προετοιμασία δειγμάτων 5. Υβριδοποίηση (Hybridization) 6. Detection 7. Σκανάρισμα (Scanning) 8. Ανάλυση Συνήθως εμπορικά διαθέσιμα Συνήθως πραγματοποιούνται σ’ ερευνητικά εργαστήρια

Οι ιχνηθέτες… • Καλύπτουν ~ 1cm2 στη γυάλινη επιφάνεια • Εναποτίθενται ~ 100,000s ιχνηθέτες • Τα ολιγονουκλεοτίδια εναποτίθενται ή συνθέτονται επάνω στη γυάλινη επιφάνεια • Για κάθε γονίδιο χρησιμοποιούνται 1-20 ιχνηθέτες • Κάθε ιχνηθέτης είναι συμπληρωματικός για ένα μόνο μέρος του γονιδίου • Αυστηρά κριτήρια επιλογής ιχνηθετών 3’ 5’ Εξώνια Εσώνια Περιοχές συμπληρωματικές ιχνηθετών

Η τοποθέτηση… 4 κύριες μέθοδοι: • Μικροενέσεις • Πιεσοηλεκτρικώς • Φωτολιθογραφία • Ηλεκτρικά πεδία

Προετοιμασία δείγματος (π.χ. για μικροσυστοιχίες γον. έκφρασης) Αλληλουχίες ελέγχου Φθορίζουσα χρωστική RNA cDNA cRNA Κοκτέϊλ υβριδισμού

Υβριδοποίηση Κοκτέϊλ υβριδισμού Γυάλινη πλάκα με συστοιχίες ιχνηθετών Οι συμπληρωματικές αλληλουχίες υβριδοποιούνται

Detection / Scanning Μετατρέποντας το χρώμα σε αριθμούς Βιοπληροφορική Σταθμός πλυσίματος Scanner Μετατρέποντας το χρώμα σε αριθμούς Βιοπληροφορική

Εφαρμογές Μικροσυστοιχιών DNA • SNP ανάλυση • Εντοπισμός μεταλλάξεων – Σημειακών μεταλλάξεων – Αλλαγές αριθμού αντιγράφων (gene copy number changes) • Μελέτες εξέλιξης (evolution studies)

΄Αλλα παραδείγματα … • για εντοπισμό μεταλλάξεων του καρκίνου του μαστού • για έγκαιρη διάγνωση του καρκίνου του πνεύμονα • πολλές μορφές καρκίνου υπό μελέτη • για προγεννετικό έλεγχο μεταλλάξεων του γονιδίου της κυστικής ίνωσης • για προσδιορισμό προδιάθεσης σε ψυχιατρικές ασθένειες