ΑΝΤΙΓΡΑΦΗ DNA

ΑΝΤΙΓΡΑΦΗ DNA

ΔΥΝΗΤΙΚΟΙ ΤΥΠΟΙ ΑΝΤΙΓΡΑΦΗΣ DNA

ΘΕΣΗ ΕΝΑΡΞΗΣ ΑΝΤΙΓΡΑΦΗΣ DNA

ΘΕΣΗ ΕΝΑΡΞΗΣ ΑΝΤΙΓΡΑΦΗΣ DNA ΖΕΥΓΗ Α-Τ ΑΠΟΔΙΑΤΑΣΣΟΝΤΑΙ ΠΙΟ ΕΥΚΟΛΑ

ΔΙΧΑΛΑ ΑΝΤΙΓΡΑΦΗΣ DNA

B. Μαρμάρας, Μ. Λαμπροπούλου - Μαρμάρα «Βιολογία Κυττάρου», εκδ B. Μαρμάρας, Μ. Λαμπροπούλου - Μαρμάρα «Βιολογία Κυττάρου», εκδ. Typorama 2005

ΟΔΗΓΟΣ & ΣΥΝΟΔΟΣ ΚΛΩΝΟΣ DNA ΘΡΑΥΣΜΑΤΑ OKAZAKI

DNA ΠΟΛΥΜΕΡΑΣΗ DNA pol III (I, II) B. Μαρμάρας, Μ. Λαμπροπούλου - Μαρμάρα «Βιολογία Κυττάρου», εκδ. Typorama 2005

DNA ΠΟΛΥΜΕΡΑΣΗ DNA pol III ΠΟΛΥΜΕΡΙΣΜΟΣ DNA ΔΙΟΡΘΩΣΗ ΛΑΘΩΝ-ΕΞΩΝΟΥΚΛΕΑΣΗ πριν προστεθεί το επόμενο νουκλεοτίδιο

B. Μαρμάρας, Μ. Λαμπροπούλου - Μαρμάρα «Βιολογία Κυττάρου», εκδ B. Μαρμάρας, Μ. Λαμπροπούλου - Μαρμάρα «Βιολογία Κυττάρου», εκδ. Typorama 2005

B. Μαρμάρας, Μ. Λαμπροπούλου - Μαρμάρα «Βιολογία Κυττάρου», εκδ B. Μαρμάρας, Μ. Λαμπροπούλου - Μαρμάρα «Βιολογία Κυττάρου», εκδ. Typorama 2005

B. Μαρμάρας, Μ. Λαμπροπούλου - Μαρμάρα «Βιολογία Κυττάρου», εκδ B. Μαρμάρας, Μ. Λαμπροπούλου - Μαρμάρα «Βιολογία Κυττάρου», εκδ. Typorama 2005

B. Μαρμάρας, Μ. Λαμπροπούλου - Μαρμάρα «Βιολογία Κυττάρου», εκδ B. Μαρμάρας, Μ. Λαμπροπούλου - Μαρμάρα «Βιολογία Κυττάρου», εκδ. Typorama 2005 21

DNA ΠΟΛΥΜΕΡΑΣΗ ΕΥΚΑΡΙΩΤΙΚΩΝ DNA pol δ, ε δ κύριο ένζυμο πολυμερισμού ε σύνθεση θραυσμάτων Okazaki γ  μιτοχονδριακό DNA β  επιδιόρθωση λαθών α  ???

The regulated sliding clamp that holds DNA polymerase on the DNA The regulated sliding clamp that holds DNA polymerase on the DNA. (A) The structure of the clamp protein from E. coli, as determined by x-ray crystallography, with a DNA helix added to indicate how the protein fits around DNA. (B) A similar protein is present in eucaryotes, as illustrated by this comparison of the E. coli sliding clamp (left) with the PCNA protein from humans (right). (C) Schematic illustration showing how the clamp is assembled to hold a moving DNA polymerase molecule on the DNA. In the simplified reaction shown here, the clamp loader dissociates into solution once the clamp has been assembled. At a true replication fork, the clamp loader remains close to the lagging-strand polymerase, ready to assemble a new clamp at the start of each new Okazaki fragment (see Figure 5-22). (A and B, from X.-P. Kong et al., Cell 69:425–437, 1992. © Elsevier.) B. Μαρμάρας, Μ. Λαμπροπούλου - Μαρμάρα «Βιολογία Κυττάρου», εκδ. Typorama 2005

ΕΛΙΚΑΣΗ B. Μαρμάρας, Μ. Λαμπροπούλου - Μαρμάρα «Βιολογία Κυττάρου», εκδ. Typorama 2005

The structure of a DNA helicase The structure of a DNA helicase. (A) A schematic diagram of the protein as a hexameric ring. (B) Schematic diagram showing a DNA replication fork and helicase to scale. (C) Detailed structure of the bacteriophage T7 replicative helicase, as determined by x-ray diffraction. Six identical subunits bind and hydrolyze ATP in an ordered fashion to propel this molecule along a DNA single strand that passes through the central hole. Red indicates bound ATP molecules in the structure. (B, courtesy of Edward H. Egelman; C, from M.R. Singleton et al., Cell 101:589–600, 2000. © Elsevier.) B. Μαρμάρας, Μ. Λαμπροπούλου - Μαρμάρα «Βιολογία Κυττάρου», εκδ. Typorama 2005

ΠΡΩΤΕΪΝΕΣ ΠΟΥ ΔΕΣΜΕΥΟΝΤΑΙ ΣΕ ΜΟΝΟΚΛΩΝΟ DNA, SSB PROTEINS B. Μαρμάρας, Μ. Λαμπροπούλου - Μαρμάρα «Βιολογία Κυττάρου», εκδ. Typorama 2005

The structure of the single-strand binding protein from humans bound to DNA. (A) A front view of the two DNA binding domains of RPA protein, which cover a total of eight nucleotides. Note that the DNA bases remain exposed in this protein–DNA complex. (B) A diagram showing the three-dimensional structure, with the DNA strand (red) viewed end-on. (B, from A. Bochkarev et al., Nature 385:176–181, 1997. © Macmillan Magazines Ltd.) B. Μαρμάρας, Μ. Λαμπροπούλου - Μαρμάρα «Βιολογία Κυττάρου», εκδ. Typorama 2005

ΠΡΙΜΟΣΩΜΑ= ΕΝΑΡΚΤΗΡΙΑ ΑΛΛΗΛΟΥΧΙΑ RNA ΠΡΙΜΑΣΗ

B. Μαρμάρας, Μ. Λαμπροπούλου - Μαρμάρα «Βιολογία Κυττάρου», εκδ B. Μαρμάρας, Μ. Λαμπροπούλου - Μαρμάρα «Βιολογία Κυττάρου», εκδ. Typorama 2005

DNA ΠΟΛΥΜΕΡΑΣΗ Ι  ΑΦΑΙΡΕΙ ΕΝΑΡΚΤΗΡΙΕΣ ΑΛΛΗΛΟΥΧΙΕΣ RNA ΣΥΜΠΛΗΡΩΝΕΙ ΚΕΝΑ

ΛΙΓΑΣΕΣ B. Μαρμάρας, Μ. Λαμπροπούλου - Μαρμάρα «Βιολογία Κυττάρου», εκδ. Typorama 2005

ΤΟΠΟΪΣΟΜΕΡΑΣΕΣ B. Μαρμάρας, Μ. Λαμπροπούλου - Μαρμάρα «Βιολογία Κυττάρου», εκδ. Typorama 2005

ΤΟΠΟΪΣΟΜΕΡΑΣΕΣ https://www.youtube.com/watch?v=EYGrElVyHnU B. Μαρμάρας, Μ. Λαμπροπούλου - Μαρμάρα «Βιολογία Κυττάρου», εκδ. Typorama 2005

ΤΟΠΟΪΣΟΜΕΡΑΣΗ Ι

ΤΟΠΟΪΣΟΜΕΡΑΣΗ ΙΙ

ΤΟΠΟΪΣΟΜΕΡΑΣΗ ΙΙ B. Μαρμάρας, Μ. Λαμπροπούλου - Μαρμάρα «Βιολογία Κυττάρου», εκδ. Typorama 2005

ΕΠΙΔΙΟΡΘΩΣΗ ΛΑΘΩΝ-ΕΝΖΥΜΑ ΕΠΙΔΙΩΡΘΩΣΗΣ

Οξείδωση Υδρόλυση Μεθυλίωση B. Μαρμάρας, Μ. Λαμπροπούλου - Μαρμάρα «Βιολογία Κυττάρου», εκδ. Typorama 2005

B. Μαρμάρας, Μ. Λαμπροπούλου - Μαρμάρα «Βιολογία Κυττάρου», εκδ B. Μαρμάρας, Μ. Λαμπροπούλου - Μαρμάρα «Βιολογία Κυττάρου», εκδ. Typorama 2005

B. Μαρμάρας, Μ. Λαμπροπούλου - Μαρμάρα «Βιολογία Κυττάρου», εκδ B. Μαρμάρας, Μ. Λαμπροπούλου - Μαρμάρα «Βιολογία Κυττάρου», εκδ. Typorama 2005

ΕΠΙΔΙΩΡΘΩΣΗ ΜΕ ΕΚΤΟΜΗ ΒΑΣΗΣ

ΔΙΜΕΡΗ ΠΥΡΙΜΙΔΙΝΩΝ/ΘΥΜΙΝΗΣ ΥΠΕΡΙΩΔΗΣ ΑΚΤΙΝΟΒΟΛΙΑ

ΜΕ ΕΚΤΟΜΗ ΝΟΥΚΛΕΟΤΙΔΙΟΥ ΕΠΙΔΙΩΡΘΩΣΗ ΜΕ ΕΚΤΟΜΗ ΝΟΥΚΛΕΟΤΙΔΙΟΥ

ΕΠΙΔΙΟΡΘΩΣΗ ΛΑΘΩΝ-ΕΝΖΥΜΑ ΕΠΙΔΙΩΡΘΩΣΗΣ B. Μαρμάρας, Μ. Λαμπροπούλου - Μαρμάρα «Βιολογία Κυττάρου», εκδ. Typorama 2005

Inherited Syndromes with Defects in DNA Repair NAME PHENOTYPE ENZYME OR PROCESS AFFECTED MSH2, 3, 6, MLH1, PMS2 colon cancer mismatch repair Xeroderma pigmentosum (XP) groups A  G skin cancer, cellular UV sensitivity, neurological abnormalities nucleotide excision-repair XP variant cellular UV sensitivity translesion synthesis by DNA polymerase d Ataxia  telangiectasia (AT) leukemia, lymphoma, cellular g-ray sensitivity, genome instability ATM protein, a protein kinase activated by double-strand breaks BRCA-2 breast and ovarian cancer repair by homologous recombination Werner syndrome premature aging, cancer at several sites, genome instability accessory 3 -exonuclease and DNA helicase Bloom syndrome cancer at several sites, stunted growth, genome instability accessory DNA helicase for replication Fanconi anemia groups A  G congenital abnormalities, leukemia, genome instability DNA interstrand cross-link repair 46 BR patient hypersensitivity to DNA-damaging agents, genome instability DNA ligase I

Γιατί λέμε ότι η αντιγραφή του DNA είναι ημισυντηρητική; Δώστε πειραματικά δεδομένα υπέρ αυτής της άποψης. Ποιες πρωτεΐνες συμμετέχουν στην αντιγραφή του DNA; Ποια η λειτουργία τους; Τι είναι ο οδηγός και τι ο συνοδός κλώνος DNA; Τι είναι τα θραύσματα Okazaki; Γιατί λέμε ότι η κατεύθυνση της αντιγραφής είναι πάντα 5’3’; Πώς (με βάση ποιες χημικές δομές) μπορούν να συμβούν λάθη κατά της αντιγραφή; Πώς γίνεται η διόρθωση λαθών κατά την αντιγραφή;