28 Νοεμβρίου 2017 Πέμπτη σειρά ασκήσεων

Συναρτήσεις χαρτογράφησης

p = Η πιθανότητα να συμβεί ανασυνδυασμός στο συγκεκριμένο τμήμα |------ n = το πλήθος των τμημάτων στα οποία χωρίσαμε το χρωμόσωμα ----| n! P( r ) = -------------- pr (1-p)(n-r) (διωνυμική κατανομή) r! (n-r)! Όσο το n αυξάνει το p μικραίνει. Έτσι θεωρούμε πως m = p * n σταθερό n (n-1) (n-2) … (n-r+1) P( r ) = -------------------------------- (m/n)r (1 - m/n)(n-r) r!

P( r ) = -------------- (κατανομή Poisson) r! mr e-m P( r ) = -------------- (κατανομή Poisson) r! Η πιθανότητα να γίνει 1 τουλάχιστον ανασυνδυασμός κατά μήκος του χρωμοσώματος είναι Ρ(τουλάχιστον 1) = 1 – Ρ(0) m0 e-m Ρ(0) = ---------------- = e-m 0! Ρ(τουλάχιστον 1) = 1 – Ρ(0) = 1 - e-m Όμως έτσι και συμβεί ανασυνδυασμός οι μισοί γαμέτες θα είναι ανασυνδυασμένοι οπότε RF = ½ (1 - e-m) Στην περιοχή κατά μέσο όρο συμβαίνουν m ανασυνδυασμοί. Άρα οι πραγματικοί γαμέτες που προέρχονται από ανασυνδυασμό είναι ½ m συνεπώς RFcorrected = ½ m Δηλαδή m = 2 * RFcorrected

RFcorrected = ½ m = - ½ ln (1 – 2 RF) Συνάρτηση του Haldane RF = ½ (1 - e-m)  e-m = 1 – 2 RF  - m ln(e) = ln (1 – 2 RF)  m = - ln (1 – 2 RF) RFcorrected = ½ m = - ½ ln (1 – 2 RF) p = Η πιθανότητα να συμβεί ανασυνδυασμός στο συγκεκριμένο τμήμα |------ n = το πλήθος των τμημάτων στα οποία χωρίσαμε το χρωμόσωμα ----| Προϋπόθεση για τον υπολογισμό των ανωτέρω είναι πως σε κάθε στοιχειώδες τμήμα του χρωμοσωμάτος η πιθανότητα να συμβεί ανασυνδυασμός είναι p ανεξάρτητα από το τι συμβαίνει στα γειτονικά τμήματα. Αυτό σημαίνει πως ο συντελεστής σύμπτωσης είναι ίσος με την μονάδα. Άλλες συναρτήσεις χαρτογράφησης;

Συνάρτηση Kosambi 1 – e-2m RF = --------------------------- Προϋπόθεση: Ο συντελεστής σύμπτωσης διαφορετικός από 0 και 1 1 – e-2m RF = --------------------------- 2 * (1 + e-2m) RFcorrected = ¼ ln [(1 + 2 * RF) / (1 - 2 * RF)]

Συνάρτηση Morgan RFcorrected = RF Προϋπόθεση: Συντελεστής σύμπτωσης = 0 RFcorrected = RF

1) Στο φυτό Primula sinensis οι τόποι Β(Β,b) και G(G,g) ελέγχουν το χρώμα του άνθους και του στίγματος αντίστοιχα. Φυτά με γονότυπο Β- έχουν μπλε άνθη, ενώ με γονότυπο bb έχουν άνθη με μπλε-φαιό χρώμα. Φυτά G- έχουν πράσινο στίγμα, ενώ με γονότυπο κόκκινο. Κάνετε την εξής διασταύρωση Bbgg X bbGg. Οι δυο γενετικοί τόποι βρίσκονται στο ίδιο χρωμόσωμα ; Να δικαιολογήσετε την απάντησή σας. Η0 : Έστω οι τόποι B και G είναι συνδεδεμένοι

Bg/bg X bG/bg θηλυκό / αρσενικό bG (1-c)/2 bg (1-c)/2 bG (c/2) bg (c/2) Bg (1-c)/2 Bg (c/2) Άγνωστο. Δεν μπορεί να βρεθεί αφού «πατρικοί» και «ανασυνδυασμένοι» γαμέτες είναι ίδιοι και δεν μπορεί κανείς να τους ξεχωρίσει.

2) Ένα θηλυκό άτοµο δροσόφιλας, ετερόζυγο για το φυλοσύνδετο, θνησιγόνο και υπολειπόµενο γονίδιο l, διασταυρώθηκε µε αρσενικό άτοµο από στέλεχος που φέρει τα φυλοσύνδετα και υπολειπόμενα γονίδια ruby (rb) και cut (ct). Mερικά θηλυκά της F1 µε γονότυπο + + l / rb ct + διασταυρώθηκαν µε αρσενικά του στελέχους ruby- cut και έδωσαν τα παρακάτω αποτελέσματα Συχνότητα % Φαινότυποι Αρσενικά Θηλυκά [+ + +] 3.90 43.75 [rb + +] 12.40 6.25 [+ ct +] 0.10 6.25 [rb ct +] 83.60 43.75 Nα χαρτογραφηθούν τα τρία γονίδια και να βρεθεί ο συντελεστής σύμπτωσης σ’ αυτό το τµήµα του X χρωµοσώµατος.

Συχνότητα % Φαινότυποι Αρσενικά [rb ct +] 83.60 [rb + +] 12.40 [+ + +] 03.90 [+ ct +] 00.10 NCO SCO DCO (rb,ct) (l,rb) Η σωστή σειρά των τόπων είναι l – rb - ct + rb ct ======= l + + DCO + + ct l rb + RF(rb,ct) = 0.124 + 0.001 = 0.125 RF(l,rb) = 0.039 + 0.001 = 0.04 RF(l,ct) = 0.124 + 0.039 + 2 * 0.001 = 0.165 σσ = 0.001 / (0.04 * 0.125) = 0.20

3) Στο καλαμπόκι του αλληλόμορφο Υ του γενετικού τόπου Υ(Y,y) δίνει πράσινο μίσχο και επικρατεί του αλληλομόρφου y που δίνει κίτρινο. Το αλληλόμορφο Sh του γενετικού τόπου Sh(Sh,sh) ευθύνεται για πλήρες ενδοσπέρμιο και επικρατεί του sh που έχει σαν φαινότυπο συρικνωμένο ενδοσπέρμιο και τέλος το αλληλόμορφο C του γενετικού τόπου C(C,c) έχει σαν αποτέλεσμα χρωματιστούς σπόρους και επικρατεί του αλληλομόρφου c που δίνει άχρωμους σπόρους. Τρία διαφορετικά φυτά (Ι, ΙΙ και ΙΙΙ) όλα τριπλά ετερόζυγα, σε διασταύρωση ελέγχου έδωσαν τα παρακάτω απότελέσματα Φαινότυπος Φυτό Ι Φυτό ΙΙ Φυτό ΙΙΙ [y sh c] 095 368 022 [Y Sh C] 100 387 023 [y Sh C] 003 021 390 [Y sh c] 002 024 365 [y sh C] 020 004 098 [Y Sh c] 025 001 097 [y Sh c] 375 098 000 [Y sh C] 390 097 005 α) Να βρεθούν οι γονότυποι των φυτών I , II και III (να φαίνεται η σειρά των τόπων καθώς και ποια αλληλόμορφα υπάρχουν σε κάθε ομόλογο χρωμόσωμα). β) Να χαρτογραφηθούν οι τρεις γενετικοί τόποι με βάση τα αποτελέσματα που έχετε. Τι παρατηρείτε;

Στο φυτό Ι το ένα ομόλογο Φυτό Ι (τριπλά ετερόζυγο) σε διασταύρωση ελέγχου Στο φυτό Ι το ένα ομόλογο χρωμόσωμα φέρει τα Y sh C. Το άλλο τα y Sh c. Φαινότυποι Άτομα [Y sh C] 390 [y Sh c] 375 [Y Sh C] 100 [y sh c] 095 [Y Sh c] 025 [y sh C] 020 [y Sh C] 003 [Y sh c] 002 Σύνολο 1010 NCO SCO DCO NCO SCO(C,Sh) SCO(Y,C) DCO Η σειρά των τόπων είναι τέτοια ώστε το C να βρίσκεται στην μέση. Y C sh ========= y c Sh RF(C,Sh) = 200/1010 = 0,1980 19,8cM RF(Y,C) = 50/1010 = 0,0495 4,95cM RF(Y,Sh) = 250/1010 = 0,2475 24,75cM διορθώντας για DCO RF(Y,Sh) = 240/1010 = 0,2376 23,76 χωρίς διόρθωση για DCO σσ = 5 / (0,198*0,0495*1010) = 0,505

Στο φυτό ΙΙ το ένα ομόλογο Φυτό ΙΙ (τριπλά ετερόζυγο) σε διασταύρωση ελέγχου Στο φυτό ΙΙ το ένα ομόλογο χρωμόσωμα φέρει τα Y Sh C. Το άλλο τα y sh c. Φαινότυποι Άτομα [Y Sh C] 387 [y sh c] 368 [y Sh c] 098 [Y sh C] 097 [Y sh c] 024 [y Sh C] 021 [y sh C] 004 [Y Sh c] 001 Σύνολο 1000 NCO SCO DCO NCO SCO(C,Sh) SCO(Y,C) DCO Η σειρά των τόπων είναι τέτοια ώστε το C να βρίσκεται στην μέση. Y C Sh ========= y c sh RF(C,Sh) = 200/1000 = 0.2 20.0cM RF(Y,C) = 50/1000 = 0.050 5.0cM RF(Y,Sh) = 250/1000 = 0.25 25.0cM διορθώντας για DCO RF(Y,Sh) = 240/1000 = 0.24 24.0cM χωρίς διόρθωση για DCO σσ = 5 / (0.2*0.05*1000) = 0.5

Στο φυτό IΙΙ το ένα ομόλογο χρωμόσωμα φέρει τα y Sh C. Το άλλο τα Y sh c. Φαινότυποι Άτομα [y Sh C] 390 [Y sh c] 365 [y sh C] 098 [Y Sh c] 097 [Y Sh C] 023 [y sh c] 022 [Y sh C] 005 [y Sh c] 000 Σύνολο 1000 NCO SCO DCO NCO SCO(C,Sh) SCO(Y,C) DCO Η σειρά των τόπων είναι τέτοια ώστε το C να βρίσκεται στην μέση. y C Sh ========= Y c sh RF(C,Sh) = 200/1000 = 0.2 20.0cM RF(Y,C) = 50/1000 = 0.050 5.0cM RF(Y,Sh) = 250/1000 = 0.25 25.0cM διορθώντας για DCO RF(Y,Sh) = 240/1000 = 0.24 24.0cM χωρίς διόρθωση για DCO σσ = 5 / (0.2*0.05*1000) = 0.5

4) Στην δροσόφιλα ο γενετικός τόπος Α(Α,α) απέχει από τον Β(Β,β) 16 cM. Ο γενετικός τόπος Γ(Γ,γ) απέχει από τον Β 24 cM (ο τόπος Β εδράζεται ανάμεσα στους τόπους Α και Γ). Θηλυκά άτομα με γονότυπο ΑβΓ/αΒγ διασταυρώθηκαν με αρσενικά γονοτύπου ΑΒΓ/αβγ και έδωσαν στην F­1 5000 απογόνους. Αν τα αλληλόμορφα που συμβολίζονται με κεφαλαία, επικρατούν εκείνων που συμβολίζονται με μικρά γράμματα και ο συντελεστής σύμπτωσης στην περιοχή αυτή του χρωμοσώματος είναι 0,5 να βρεθούν οι αναμενόμενες συχνότητες όλων των φαινοτύπων των F­1 απογόνων καθώς και το αντίστοιχοι αριθμοί ατόμων. A B Γ 16 cM 24 cM

Πιθανότητα DCO = σσ * RF(A,B)* RF(Α,Γ) = 0,5 * 0,16 * 0,24 = 0,0192 ΑβΓ/αΒγ X ΑΒΓ/αβγ ΑΒΓ αβγ NCO:ΑβΓ NCO:αΒγ SCO(A,B): ABγ SCO(A,B): αβΓ SCO(B,Γ): Αβγ SCO(Β,Γ): αΒΓ DCO: ΑΒΓ DCO: αβγ Στα αρσενικά της δροσόφιλας δεν συμβαίνει ανασυνδυασμός. Άρα οι 2 πατρικοί γαμέτες θα είναι οι μόνοι, θα είναι ισοπίθανοι και θα έχουν συχνότητα εμφάνισης ½ . A B Γ 16 cM 24 cM Πιθανότητα DCO = σσ * RF(A,B)* RF(Α,Γ) = 0,5 * 0,16 * 0,24 = 0,0192 Πιθανότητα SCO(Α,Β) = RF(Α,Β) – DCO = 0,16 - 0.0192 = 0,1408 Πιθανότητα SCO(Β,Γ) = RF(Β,Γ) – DCO = 0,24 - 0.0192 = 0,2208 Πιθανότητα NCO = 1 – DCO - SCO(Α,Β) - SCO(Β,Γ) = = 1 – 0,0192 – 0,1408 – 0,2208 = 0,6192

ΑΒΓ ½ αβγ ½ NCO:ΑβΓ (0,3096) ΑΒΓ/ΑβΓ [ΑΒΓ] 0,1548 ΑβΓ/αβγ [ΑβΓ] 0,1548 NCO:αΒγ (0,3096) ΑΒΓ/αΒγ [ΑΒΓ] 0,1548 αΒγ/αβγ [αΒγ] 0,1548 SCO(A,B): ABγ (0,0704) ΑΒΓ/ΑΒγ [ΑΒΓ] 0,0352 ΑΒγ/αβγ [ΑΒγ] 0,0352 SCO(A,B): αβΓ (0,0704) ΑΒΓ/αβΓ [ΑΒΓ] 0,0352 αβΓ/αβγ [αβΓ] 0,0352 SCO(B,Γ): Αβγ (0,1104) ΑΒΓ/Αβγ [ΑΒΓ] 0,0552 Αβγ/αβγ [Αβγ] 0,0552 SCO(Β,Γ): αΒΓ (0,1104) ΑΒΓ/αΒΓ [ΑΒΓ] 0,0552 αΒΓ/αβγ [αΒΓ] 0,0552 DCO: ΑΒΓ (0,0096) ΑΒΓ/ΑΒΓ [ΑΒΓ] 0,0048 ΑΒΓ/αβγ [ΑΒΓ] 0,0048 DCO: αβγ (0,0096) αβγ/αβγ [αβγ] 0,0048 Φαινότυποι απογόνων Συχνότητες Άτομα σε σύνολο 5000 [ΑΒΓ] 0,5048 2524 [ΑβΓ] 0,1548 774 [αΒγ] [ΑΒγ] 0,0352 176 [αβΓ] [Αβγ] 0,0552 276 [αΒΓ] [αβγ] 0,0048 24

[+ + +] 030 [+ + z] 032 [+ y +] 441 [+ y z] 001 [x + +] 000 5) Θηλυκά άτομα δροσόφιλας ετεροζυγωτά για τις υπολειπόμενες μεταλλαγές x, y και z διασταυρώθηκαν με αρσενικά «αγρίου» τύπου και έδωσαν στην F­1 τους παρακάτω απογόνους Θηλυκά: [+ + +] 1010 Αρσενικά: [+ + +] 030 [+ + z] 032 [+ y +] 441 [+ y z] 001 [x + +] 000 [x + z] 430 [x y +] 027 [x y z] 039 Να εξηγηθούν τα αποτελέσματα και να χαρτογραφηθούν πλήρως οι 3 γενετικοί τόποι. Προφανώς οι μεταλλαγές x, y, z αφορούν φυλοσύνδετους γενετικούς τόπους κι έτσι εξηγούνται οι φαινοτυπικές διαφορές μεταξύ θηλυκών και αρσενικών απογόνων. Τα θηλυκά έχουν πάρει το Χ χρωμόσωμα του πατέρα τους που είναι «αγρίου τύπου» και επικρατεί στα x,y,z. Κατά συνέπεια θα εστιαστούμε στην ανάλυση των αρσενικών απογόνων.

Φαινότυποι Άτομα [+ y +] 441 [x + z] 430 [x y z] 039 [+ + z] 032 [+ + +] 030 [x y +] 027 [+ y z] 001 [x + +] 000 Σύνολο 1000 NCO SCO DCO NCO SCO(y,z) SCO(z,x) DCO Το ένα Χ του θηλυκού φέρει τα + y + ενώ το άλλο αντίστοιχα τα x + z. Το z βρίσκεται μεταξύ των x, y y + + ========= + z x y + + / + z x X + + + / Y RF(y,z) = 70 / 1000 = 0,07 7 cM RF(z,x) = 60 / 1000 = 0,06 6 cM RF(y,x) = 130 / 1000 = 0,13 13 cM με διόρθωση για DCO RF(y,x) = 128 / 1000 = 0,128 12,8 cM χωρίς διόρθωση για DCO σσ = 1 / (0,07 * 0,06 * 1000) = 0,238

Διασταυρώνουμε άτομα τριπλά ετερόζυγα 6) Στα ποντίκια οι γενετικοί τόποι Α,Β,Γ βρίσκονται στο ίδιο χρωμόσωμα όπως φαίνεται παρακάτω με τον συντ. σύμπτωσης στην περιοχή να είναι ίσος με 0.4. Α ---------------- Β -------------------------------------------- Γ 8 cM 25 cM Διασταυρώνουμε άτομα τριπλά ετερόζυγα ΑβΓ / αΒγ Χ ΑΒΓ / αβγ Πόσους απογόνους αναμένουμε να έχουν φαινότυπο [ΑΒΓ] αν συνολικά είχαμε 1000 απογόνους; Πιθανότητα DCO: 0.08 * 0.25 = 0.02 Άτομα από DCO που παρατηρώ = σσ * Πιθανότητα DCO = 0.4 * 0.02 = 0.008

NCO SCO(Β,Γ) SCO(Α,Β) DCO ΑΒΓ 0.339 αβγ ΑΒγ 0.121 αβΓ Αβγ 0.036 αΒΓ ΑβΓ 0.004 αΒγ ΑβΓ 0.339 αΒγ 0.339 Αβγ 0.121 αΒΓ 0.121 SCO(A,B) ΑΒγ 0.036 αβΓ 0.036 ΑΒΓ 0.004 αβγ 0.004 [ΑΒΓ]:0.339 + 0.004 + 0.339 (0.121 + 0.036 + 0.004 + 0.004 - 0.004) + 0.121 (0.036 + 0.121 + 0.036 + 0.004) + 0.036 (0.121 + 0.036 + 0.004 + 0.121) = = 0.339+0.004+0.339*0.161+0.121*0.197+0.036*0.282 = 0.431568 Άτομα [ΑΒΓ] = 1000 * 0.431568 =~ 432

7) Στον αραβόσιτο, η διασταύρωση AaBbCcDd X aabbccdd έδωσε τους ακόλουθους φαινοτύπους: [ABCD] 228 [ABCd] 069 [ABcD] 426 [AbCD] 224 [aBCD] 005 [ABcd] 006 [AbcD] 447 [abCD] 002 [aBCd] 435 [aBcD] 072 [AbCd] 074 [Abcd] 007 [aBcd] 240 [abCd] 441 [abcD] 078 [abcd] 222 α) Να χαρτογραφηθούν οι τέσσερις τόποι. β) Να βρεθεί ο γονότυπος με τα αλληλόμορφα καθενός ομολόγου χρωμοσώματος, του ετεροζυγωτού γονέα (να φαίνεται η σωστή σειρά).

[ABC] 297 [ABc] 432 [AbC] 298 [aBC] 440 [Abc] 454 [abC] 443 [aBc] 312 [ABD] 654 [ABd] 075 [AbD] 671 [aBD] 077 [Abd] 081 [abD] 080 [aBd] 675 [abd] 663 Η0 1:1:1:1 χ2 = 0.479 df = 3 χ2 = 0.562 df = 3 Η0 1:1:1:1 χ2 = 0.290 df = 3 χ2 = 0.389 df = 3 [ABCD] 228 [ABCd] 069 [ABcD] 426 [AbCD] 224 [aBCD] 005 [ABcd] 006 [AbcD] 447 [abCD] 002 [aBCd] 435 [aBcD] 072 [AbCd] 074 [Abcd] 007 [aBcd] 240 [abCd] 441 [abcD] 078 [abcd] 222 [ACD] 452 [acd] 462 [ACd] 143 [acD] 150 [Acd] 013 [aCD] 007 [AcD] 873 [aCd] 876 [BCD] 233 [BCd] 504 [bCD] 226 [BcD] 498 [bCd] 515 [bcD] 525 [Bcd] 246 [bcd] 229 Η0 1:1:1:1 χ2 = 0.998 df = 3 χ2 = 0.840 df = 3

Ο τόπος Β μη συνδεδεμένος με τους A,C,D [ABCD] 228 [ABCd] 069 [ABcD] 426 [AbCD] 224 [aBCD] 005 [ABcd] 006 [AbcD] 447 [abCD] 002 [aBCd] 435 [aBcD] 072 [AbCd] 074 [Abcd] 007 [aBcd] 240 [abCd] 441 [abcD] 078 [abcd] 222 [ACD] 452 [acd] 462 [ACd] 143 [acD] 150 [Acd] 013 [aCD] 007 [AcD] 873 [aCd] 876 aCd 876 NCO AcD 893 acd 462 SCO ACD 452 acD 150 ACd 143 Acd 013 DCO aCD 007 NCO SCO(c,d) SCO(a,d) DCO RF(a,d) = 10,517 cM RF(c,d) = 31,384 cM RF(a,c) = 41,901 cM Το D υποχρεωτικά ανάμεσα στα Α,C a d C A D c σ.σ. = (13+7) / (0.10517 * 0.31384 * 2976) = 0,20360

Από την διασταύρωση AaBbCcDd X aabbccdd οι φαινότυποι των απογόνων θα εξαρτώνται από τον γαμέτη που πήραν από το ετερόζυγο άτομο. Έχω 4 τόπους θα τους κοιτάξω ανά ζεύγη Τόποι ΑΒ AB 729 ab 743 Ab 752 aB 752 Η0 1:1:1:1 χ2 = 0.475 Β.Ε. 3 Κ.Τ. 7.814 Τόποι AC RF = 0,40557 AC 595 ac 612 Ac 886 aC 883 Η0 1:1:1:1 χ2 = 106.33 Β.Ε. 3 Κ.Τ. 7.814 Τόποι AD RF = 0,10517 AD 1325 ad 1338 Ad 0156 aD 0157 Η0 1:1:1:1 χ2 = 1855.79 Β.Ε. 3 Κ.Τ. 7.814 [ABCD] 228 [ABCd] 069 [ABcD] 426 [AbCD] 224 [aBCD] 005 [ABcd] 006 [AbcD] 447 [abCD] 002 [aBCd] 435 [aBcD] 072 [AbCd] 074 [Abcd] 007 [aBcd] 240 [abCd] 441 [abcD] 078 [abcd] 222 Τόποι BC BC 737 bc 754 bC 741 Bc 744 Η0 1:1:1:1 χ2 = 0.212 Β.Ε. 3 Κ.Τ. 7.814 Τόποι BD BD 731 bd 744 bD 751 Bd 750 Η0 1:1:1:1 χ2 = 0.341 Β.Ε. 3 Κ.Τ. 7.814 Τόποι CD RF = 0,31384 CD 0459 cd 0475 Cd 1019 cD 1023 Η0 1:1:1:1 χ2 = 412.3 Β.Ε. 3 Κ.Τ. 7.814

8) Σε κάποιο συγκεκριμένο διπλοειδές φυτό οι τρεις τόποι Α, Β και Γ είναι συνδεδεμένοι ως εξής Α----------------------------------Β--------------------------------------------------Γ ---------- 20 m.u. -------------------------- 30 m.u. ------------------   Το φυτό που είναι διαθέσιμο σε σας (βαφτίστε το πατρικό φυτό) έχει γονότυπο Α β γ / α Β Γ Α) Υποθέτοντας πως δεν υπάρχει παρεμβολή αν το φυτό αυτό αυτογονιμοποιηθεί ποιο ποσοστό των απογόνων θα έχουν γονότυπο α β γ / α β γ ; Β) Ξανα υποθέτωντας πως δεν υπάρχει παρεμβολή στην περίπτωση που το πατρικό φυτό διασταυρωθεί με ένα γονοτύπου α β γ / α β γ ποιες γονοτυπικές τάξεις θα παρατηρηθούν στους απογόνους; Ποια η συχνότητα της καθεμιάς αν συνολικά έχουμε 1000 απογόνους; Γ) Ξανα απαντήστε στο (Β) υποθέτοντας αυτή την φορά πως υπάρχει γενετική παρεμβολή 20% ανάμεσα στις συγκεκριμένες περιοχές του χρωμοσώματος.

P(DCO) : 1 * 0.2 * 0.3 = 0.06 P(SCO A,B) = 0.2 – 0.06 = 0.14 Α β γ / α Β Γ Χ Α β γ / α Β Γ NCO SCO(A,B) SCO(B,Γ) DCO Αβγ αΒΓ ΑΒΓ αβγ ΑβΓ αΒγ ΑΒγ αβΓ P(DCO) : 1 * 0.2 * 0.3 = 0.06 P(SCO A,B) = 0.2 – 0.06 = 0.14 P(αβγ) = 0.14/2 = 0.07 Ρ([αβγ]) = 0.072 = 0.0049

Α β γ / α Β Γ Χ α β γ / α β γ σ.σ. = 1 (Παρεμβολή = 0) Α β γ / α Β Γ Χ α β γ / α β γ σ.σ. = 1 (Παρεμβολή = 0) σ.σ. = 0.8 (Παρεμβολή 20%) αβγ NCO 0.56 Αβγ (0.28) 0.548 Αβγ (0.274) 280 274 αΒΓ (0.28) αΒΓ (0.274) SCO(A,B) 0.2-0.06 =0.14 ΑΒΓ (0.07) 0.2-0.048 =0.152 ΑΒΓ (0.076) 70 76 αβγ (0.07) αβγ (0.076) SCO(B,Γ) 0.3-0.06 =0.24 ΑβΓ (0.12) 0.3-0.048 =0.252 ΑβΓ (0.126) 120 126 αΒγ (0.12) αΒγ (0.126) DCO 0.2*0.3=0.06 ΑΒγ (0.03) 0.8*0.2*0.3=0.048 ΑΒγ (0.024) 30 24 αβΓ (0.03) αβΓ (0.024)

9) Στην Drosophila πέντε φυλοσύνδετοι γενετικοί τόποι (ec,sc,v,cv,και ct) δίνουν χαραακτηριστικά που λέγονται echinus, scute, vermillion, crossveinless και cut αντίστοιχα. Στην αρχή των πειραμάτων μας δεν ξέρουμε την διάταξη αυτών των γονιδίων πάνω στο χρωμόσωμα. Από τα αποτελέσματα των πειραμάτων που ακολουθούν να κατασκευαστεί ο συγκεντρωτικός γενετικός χάρτης γι αυτή την περιοχή του Χ χρωμοσώματος και να υπολογιστούν κατά περίπτωση οι συντελεστές σύμπτωσης όπου είναι δυνατόν. Οποτεδήποτε είναι δυνατόν, χρησιμοποιείστε μέσους όρους. Πείραμα 1 Θηλυκά άτομα echinus διασταυρώθηκαν με αρσενικά άτομα scute, crossveinless και στην F1 έδωσαν όλα τα θηλυκά κανονικά και όλα τα αρσενικά echinus. Μετά στα θηλυκά της F1 έγινε διασταύρωση ελέγχου με τα εξής αποτελέσματα (θηλυκοί και αρσενικοί απόγοντοι): 810 echinus 88 crossveinless 62 echinus, scute 828 scute, crossveinless, 89 scute 103 echinus, crossveinless

ΓΟΝΟΤΥΠΟΙ (σωστή σειρά τόπων) Πείραμα 2 Θηλυκά άτομα crossveinless διασταυρώθηκαν με αρσενικά άτομα echinus, cut και στην F1 έδωσαν όλα τα θηλυκά κανονικά και όλα τα αρσενικά crossveinless. Μετά στα θηλυκά της F1 έγινε διασταύρωση ελέγχου με τα εξής αποτελέσματα (θηλυκοί και αρσενικοί απόγοντοι): 2207 crossveinless 273 echinus,crossveinless 223 crossveinless,cut 5 κανονικά 2125 echinus,cut 265 cut 217 echinus 3 echinus,crossveinless, cut cv + + / cv + + x + ec ct / Y   cv + + / + ec ct x cv ec ct / Y ΦΑΙΝΟΤΥΠΟΙ   ΓΟΝΟΤΥΠΟΙ (σωστή σειρά τόπων) [cv + +] 2207 + cv + / ec cv ct NCO [+ ec ct] 2125 ec + ct / ec cv ct [cv ec +] 0273 ec cv + / ec cv ct SCO(ec,cv) [+ + ct] 0265 + + ct / ec cv ct [cv + ct] 0223 + cv ct / ec cv ct SCO(cv,ct) [+ ec +] 0217 ec + + / ec cv ct [+ + +] 0005 + + + / ec cv ct DCO [cv ec ct] 0003 ec cv ct / ec cv ct Σύνολο 5318 + cv + ec cv ct --------DCO ec + ct + + + RF(ec,cv) = 546/5318 = 0,1027 RF(cv,ct) = 448/5318 = 0,0842 RF(ec,ct) = 994/5318 = 0,1869 (διορθώνω για DCO) σ.σ.(ec,cv,ct) = 8 / (5318*0,1027*0,0842) = 0,1739

ΓΟΝΟΤΥΠΟΙ (σωστή σειρά τόπων) Πείραμα 3 Θηλυκά άτομα cut διασταυρώθηκαν με αρσενικά άτομα vermillion,crossveinless και στην F1 έδωσαν όλα τα θηλυκά κανονικά και όλα τα αρσενικά cut. Μετά στα θηλυκά της F1 έγινε διασταύρωση ελέγχου με τα εξής αποτελέσματα (θηλυκοί και αρσενικοί απόγοντοι): 766 vermillion,crossveinless 140 vermillion, cut 73 vermillion 2 κανονικά 759 cut 158 crossveinless 85 crossveinless, cut 2 vermillion, crossveinless, cut ct + + / ct + + x + cv v / Y   ct + + / + cv v x ct cv v / Y ΦΑΙΝΟΤΥΠΟΙ   ΓΟΝΟΤΥΠΟΙ (σωστή σειρά τόπων) [+ v cv] 0766 cv + v / cv ct v NCO [ct + +] 0759 + ct + / cv ct v [+ + cv] 0158 cv + + / cv ct v SCO(v,ct) [ct v +] 0140 + ct v / cv ct v [ct + cv] 0085 cv ct + / cv ct v SCO(ct,cv) [+ v +] 0073 + + v / cv ct v [+ + +] 0002 + + + / cv ct v DCO [ct v cv] cv ct v / cv ct v Σύνολο 1985 cv + v cv ct v ------------ DCO  + ct + + + + RF(v,ct) = 302/1985 = 0,1521 RF(ct,cv) = 162/1985 = 0,0816 RF(v,cv) = 464/1985 = 0,2337 (διορθώνω για DCO) σ.σ.(v,ct,cv) = 4 / (1985*0,1521*0,0816) = 0,1623

sc7,57ec-9,98-cv-8,29-ct--15,21--v ΣΥΝΟΛΙΚΑ ΤΟΠΟΙ ΑΠΟΣΤΑΣΗ ΦΑΙΝΟΜΕΝΗ ΠΕΙΡΑΜΑ ΜΕΣΟΣ ΟΡΟΣ sc - ec 07,57 cM Ι   ec - cv 09,70 cM 9,98 cM 10,27 cM ΙΙ cv - ct 08,42 cM 8,29 cM 08,16 cM ΙΙΙ ct - v 15,21 cM sc7,57ec-9,98-cv-8,29-ct--15,21--v

QUIZ