Η ΚΙΝΗΤΙΚΗ ΘΕΩΡΗΣΗ ΤΟΥ ΜΕΤΑΒΟΛΙΣΜΟΥ

Slides:



Advertisements
Παρόμοιες παρουσιάσεις
Σχέση ισοτιμίας και εισοδήματος
Advertisements

ΠΑΡΑΓΩΓΗ ΤΗΣ ΕΠΙΧΕΙΡΗΣΗΣ
ΠΕΡΙΠΛΟΚΕΣ ΣΤΗΝ ΚΙΝΗΤΙΚΗ ΕΝΖΥΜΙΚΩΝ ΑΝΤΙΔΡΑΣΕΩΝ
«Αναλυτική Χημεία – Ενόργανη Ανάλυση» Ισορροπίες Οξέων - Βάσεων
ΣΥΓΧΡΟΝΕΣ ΤΕΧΝΙΚΕΣ ΜΙΚΡΟΡΥΘΜΙΣΗΣ ΚΥΚΛΟΦΟΡΙΑΣ Κ. ΣΚΙΑΔΟΠΟΥΛΟΣ Α.ΖΕΙΜΠΕΚΗ Υ.Π.Ε.Χ.Ω.Δ.Ε.
TEST ΑΈΡΙΑ ΘΕΡΜΟΔΥΝΑΜΙΚΗ.
3.2 ΕΝΖΥΜΑ – ΒΙΟΛΟΓΙΚΟΙ ΚΑΤΑΛΥΤΕΣ
Σχολή Χημικών Μηχανικών ΕΜΠ
Κεφάλαιο 6: Κινητική Ενέργεια και Έργο
ΚΙΝΗΤΙΚΗ ΕΝΖΥΜΙΚΩΝ ΑΝΤΙΔΡΑΣΕΩΝ
ΙΣΟΖΥΓΙΑ ΜΑΖΑΣ ΚΑΙ ΣΤΟΙΧΕΙΟΜΕΤΡΙΑ
ΣΧΕΔΙΑΣΜΟΣ ΒΙΟΑΝΤΙΔΡΑΣΤΗΡΩΝ
Ανάλυση Συστημάτων Αυτομάτου Ελέγχου:
Ταχύτητα αντίδρασης Ως ταχύτητα αντίδρασης ορίζεται η μεταβολή της συγκέντρωσης ενός από τα αντιδρώντα ή τα προϊόντα στη μονάδα του χρόνου: ΔC C2.
Παν. Πάλλα - ΕΚΦΕ Ν. ΣΜΥΡΝΗΣ
Επίδραση κοινού ιόντος Πώς επηρεάζει το βαθμό ιοντισμού ενός ασθενούς ηλεκτρολύτη η διάσταση ενός ισχυρού ηλεκτρολύτη με κοινό ιόν;
Περί ρυθμιστικών διαλυμάτων
Ιονική ισχύς Η ιονική ισχύς, Ι, ενός διαλύματος δίνεται σαν το ημιάθροισμα του γινομένου της συγκέντρωσης καθενός συστατικού του διαλύματος πολλαπλασιασμένης.
Μεταβολικές οδοί και ένζυμα
1 Έλεγχος ροής και συμφόρησης (flow and congestion control) flow control Ο όρος έλεγχος ροής (flow control) χρησιμοποιείται συχνά για να περιγράψει τους.
ΣΧΕΔΙΑΣΜΟΣ ΒΙΟΑΝΤΙΔΡΑΣΤΗΡΩΝ
ΑΝΤΙΔΡΑΣΤΗΡΑΣ ΣΥΝΕΧΟΥΣ ΛΕΙΤΟΥΡΓΙΑΣ (χημοστάτης)
Καταλύτες: Ονομάζονται τα σώματα που με την παρουσία τους σε μικρά ποσά, αυξάνουν την ταχύτητα μίας αντίδρασης, ενώ στο τέλος της παραμένουν ουσιαστικά.
ΔΙΑΛΕΞΗ 8 Δομή και λειτουργία των πρωτεϊνών
ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΑΣΚΗΣΗ 6 : Θεώρημα Μέγιστης Ισχύος. Θεώρημα Μέγιστης Ισχύος Μπορούμε να υπολογίσουμε ποια είναι η αντίσταση που πρέπει να συνδέσουμε με μια.
Παράγοντες που επηρεάζουν την θέση της χημικής ισορροπίας.
6ο ΕΝΙΑΙΟ ΛΥΚΕΙΟ ΖΩΓΡΑΦΟΥ Βυζιργιαννάκης Μανώλης
ΜΕΤΑΤΟΠΙΣΗ ΣΥΝΑΡΤΗΣΗΣ
Κοινωνικοοικονομική Αξιολόγηση Επενδύσεων Διάλεξη 4η
3. ΤΑΧΥΤΗΤΑ ΑΝΤΙΔΡΑΣΗΣ ΚΑΙ ΣΧΕΔΙΑΣΜΟΣ ΑΝΤΙΔΡΑΣΤΗΡΩΝ
Κοινωνικοοικονομική Αξιολόγηση Επενδύσεων Διάλεξη 3η
2. ΒΑΘΜΟΣ ΜΕΤΑΤΡΟΠΗΣ ΚΑΙ ΣΧΕΔΙΑΣΜΟΣ ΑΝΤΙΔΡΑΣΤΗΡΩΝ
Η μεταμόρφωση των πετρωμάτων συνοδεύεται από μια σειρά διεργασιών και αλλαγών του πετρώματος. Οι διεργασίες αυτές περιλαμβάνουν:  Δημιουργία ορυκτών που.
ΑΛΓΕΒΡΟ - ΠΟΛΥΩΝΥΜΙΚΕΣ ΥΠΟΛΟΓΙΣΤΙΚΕΣ ΜΕΘΟΔΟΙ ΣΤΗ ΘΕΩΡΙΑ ΕΛΕΓΧΟΥ Διδακτορική διατριβή Σταύρος Δ. Βολογιαννίδης URL:
Κεφάλαια 8 και 9: ΕΝΖΥΜΑ Εξειδίκευση (Α) θρυψίνη (Β) θρομβίνη.
Τμήμα Ηλεκτρολόγων Μηχανικών ΤΕ
Εφαρμοσμένη Ενζυμολογία (Θ) Ενότητα 3: Στοιχεία ενζυματικής κινητικής Δρ. Βασίλης Ντουρτόγλου Τμήμα Οινολογίας και Τεχνολογίας Ποτών Ανοικτά Ακαδημαϊκά.
Χημική Κινητική. Μελετώνται.. η ταχύτητα των χημικών αντιδράσεων οι παράγοντες που επηρεάζουν την ταχύτητα χημικής αντίδρασης ο μηχανισμός της αντίδρασης.
Bιοχημεία Νοσηλευτικής Τρούγκος Κωνσταντίνος Αν. Καθ. Βιοχημείας Εργ. Βιολογικής Χημείας ΕΚΠΑ- Ιατρική Σχολή.
1 Σχέση ισοτιμίας και εισοδήματος Οικονομική πολιτική Βραχυχρόνιες-μακροχρόνιες επιπτώσεις.
Εισαγωγή στην Οικονομική Ι Ζήτηση, Προσφορά, Ελαστικότητες.
ΣΗΜΑΤΑ ΚΑΙ ΣΥΣΤΗΜΑΤΑ II Καθ. Πέτρος Π. Γρουμπός Διάλεξη 8η Στοχαστικά Σήματα - 1.
Ένζυμα Δρ. Αθ. Μανούρας TΜΗΜΑ TΕΧΝΟΛΟΓΙΑΣ ΤΡΟΦΙΜΩΝ Βιοχημεία.
ΣΥΣΤΗΜΑΤΑ ΑΥΤΟΜΑΤΟΥ ΕΛΕΓΧΟΥ Ι 8 η Διάλεξη ΣΥΣΤΗΜΑΤΑ ΑΥΤΟΜΑΤΟΥ ΕΛΕΓΧΟΥ Ι ΠΑΡΑΔΕΙΓΜΑΤΑ ΣΧΕΔΙΑΣΜΟΥ ΚΑΙ ΧΡΗΣΗΣ ΤΟΥ ΓΕΩΜΕΤΡΙΚΟΥ ΤΟΠΟΥ ΤΩΝ ΡΙΖΩΝ Το σύστημα ελέγχου.
Bιοχημεία Νοσηλευτικής
Bιοχημεία Νοσηλευτικής
ΣΤΑΤΙΣΤΙΚΑ ΜΕΤΡΑ ΔΙΑΣΠΟΡΑΣ - ΑΣΥΜΜΕΤΡΙΑΣ - ΚΥΡΤΩΣΕΩΣ
Ένζυμα Ένζυμο: Πρωτεϊνικό μόριο που ενεργεί ως καταλύτης δηλαδή ως χημικός παράγοντας ο οποίος επιταχύνει μια συγκεκριμένη χημική αντίδραση χωρίς να καταναλώνεται.
ΧΗΜΙΚΗ ΙΣΟΡΡΟΠΙΑ ΟΡΙΣΜΟΣ
ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΙΩΑΝΝΙΝΩΝ ΑΝΟΙΚΤΑ ΑΚΑΔΗΜΑΪΚΑ ΜΑΘΗΜΑΤΑ
Αν. Καθηγητής Ιατρικής Σχολής ΕΚΠΑ Εργ. Βιολογικής Χημείας.
ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΙΩΑΝΝΙΝΩΝ ΑΝΟΙΚΤΑ ΑΚΑΔΗΜΑΪΚΑ ΜΑΘΗΜΑΤΑ
Εισαγωγή στο Γραμμικό Προγραμματισμό
Μέγιστη ροή Κατευθυνόμενο γράφημα 12 Συνάρτηση χωρητικότητας
Tρούγκος Κων/νος Αν. Καθ. Βιολογικής Χημείας Βιοχημεία Noσηλευτικής
ΕΛΑΣΤΙΚΟΤΗΤΑ ΚΕΦΑΛΑΙΟ 3.
Αν. Καθ. ΒιολογικήςΧημείας Υπεύθυνος Βιοχημείας Ι
Εφαρμοσμένη Ενζυμολογία (Θ)
ΤΑΛΑΝΤΩΣΕΙΣ.
ΑΕΡΙΑ ΑΙΜΑΤΟΣ ΟΞΕΟΒΑΣΙΚΗ ΙΣΟΡΡΟΠΙΑ Βρετζάκης Γιώργος
ΡΥΘΜΟΣ ΔΙΕΡΓΑΣΙΑΣ ΓΙΑ ΣΥΡΡΙΚΝΟΥΜΕΝΑ ΣΦΑΙΡΙΚΑ ΤΕΜΑΧΙΔΙΑ
ΚΕΦΑΛΑΙΟ 3ο ΜΕΤΑΒΟΛΙΣΜΟΣ
ΕΙΣΑΓΩΓΗ ΣΤΗΝ ΟΙΚΟΝΟΜΙΚΗ ΕΠΙΣΤΗΜΗ
ΝΕΟ-ΓΛΥΚΟ-ΓΕΝΕΣΗ Βιολογική Χημεία Ι Χριστίνα Πιπέρη Αναπλ. Καθηγήτρια
Ευθύγραμμη ομαλά μεταβαλλόμενη κίνηση
Ευθύγραμμη ομαλά μεταβαλλόμενη κίνηση
Fe2O3(S) + 3C(S) + 1/2O2(G) → 2Fe(S) + CO2(G) + 2CO(G)
Από όλα τα βήματα του μοντέλου του συρρικνούμενου κόκκου, δηλαδή:
Χημική Κινητική. Μελετώνται.. η ταχύτητα των χημικών αντιδράσεων οι παράγοντες που επηρεάζουν την ταχύτητα χημικής αντίδρασης ο μηχανισμός της αντίδρασης.
ΧΗΜΙΚΗ ΙΣΟΡΡΟΠΙΑ. Μονόδρομη αντίδραση: 1.Είναι η αντίδραση που γίνεται προς μια μόνο κατεύθυνση. 2.Μετά το τέλος ένα τουλάχιστον από τα αντιδρώντα σώματα.
Μεταγράφημα παρουσίασης:

Η ΚΙΝΗΤΙΚΗ ΘΕΩΡΗΣΗ ΤΟΥ ΜΕΤΑΒΟΛΙΣΜΟΥ Βιβλιογραφία ΔΚ Τσουκάτου «Φυσικοχημικές Αρχές του Ελέγχου και της Ρύθμισης του Μεταβολισμού» Εκδόσεις ΕΦΥΡΑ

Η κινητική Michaelis-Menten Η απλή ενζυμική κινητική υποδηλώνει το ρυθμιστικό για το μεταβολισμό ρόλο που μπορεί τέτοιες αντιδράσεις να παίξουν για αυξομειώσεις των συγκεντρώσεων του υποστρώματος κοντά στην Km. Μια αύξηση ή ελάττωση της συγκέντρωσης του υποστρώματος οδηγεί σε αύξηση η ελάττωση της ταχύτητας μετατροπή του σε προϊόν με αποτέλεσμα τη ρύθμιση της συγκέντρωσης του.

Αλληλεπιδρούσες θέσεις σύνδεσης- Αλλοστερισμός Τα αλλοστερικά ένζυμα λόγω της συνεργατικότητας του υποστρώματος και της σιγμοειδούς μορφής της κινητικής τους διαθέτουν μεγαλύτερα ρυθμιστικά αποθέματα κοντά στις συγκεντρώσεις ημικορεσμού τους από τα απλά. Επιπρόσθετα λόγω της δυνατότητας αλλαγής της ροής χωρίς την ανάγκη αλλαγής της συγκέντρωσης του υποστρώματος είναι πιθανά σημεία ελέγχου μιας μεταβολικής πορείας.

O συντελεστής ελαστικότητας Έστω ένζυμο που υπακούει στη κινητική Michaelis-Menten,

Όταν έχουμε και επίδραση του προἳόντος η ελαστικότητα θα είναι Όπου ρ o βαθμός απομάκρυνσης από την ισορροπία. ‘Όταν ρ είναι μικρό βρισκόμαστε μακριά από την ισορροπία ενώ όταν ρ=1 έχουμε ισορροπία και vf η προς τα δεξιά ταχύτητα και Vf η προς τα δεξιά μέγιστη ταχύτητα. Αντιστρεπτά ενζυμικά βήματα κοντά στην ισορροπία διαθέτουν τεράστια ρυθμιστικά, ομοιοστατικά, για τη στάσιμη κατάσταση αποθέματα. Αυτό οφείλεται στο γεγονός ότι κοντά στην ισορροπία οι προς τα δεξιά ή αριστερά αντιδράσεις που τείνουν να αποκαταστήσουν μια διατάραξη είναι πολύ μεγαλύτερες από την καθαρή ροή της στάσιμης κατάστασης.

Για ένζυμα που υπακούουν στη κινητική Hill η ελαστικότητα σα συνάρτηση του ποσοστού κορεσμού Ŷ και του συντελεστή h δίνεται από τ σχέση Τα αλλοστερικά ένζυμα παρουσιάζουν μεγαλύτερη, μέχρι και τριπλάσια, ελαστικότητα από απλά ενζυμικά βήματα κοντά στην [S]0.5 άρα έχουν στις συγκεντρώσεις αυτές του υποστρώματος υψηλότερη ρυθμιστική ικανότητα.

ΤΑ ΑΠΟΦΑΣΙΣΤΙΚΑ ΒΗΜΑΤΑ ΜΙΑΣ ΜΕΤΑΒΟΛΙΚΗΣ ΠΟΡΕΙΑΣ Α) Το αποφασιστικό βήμα πρέπει να βρίσκεται στα πρώτα βήματα της μεταβολικής πορείας. Β) Το αποφασιστικό βήμα πρέπει να είναι ενζυμική αντίδραση μακριά από την ισορροπία. Γ) Αλλοστερικά ένζυμα θα πρέπει να αναζητηθούν ως τα αποφασιστικά βήματα μιας πορείας. Δ) Το περιοριστικό βήμα (το πιο αργό) της μεταβολικής πορείας. Μερικές πειραματικές διεργασίες που χρησιμοποιούνται για τον έλεγχο των παραπάνω κριτηρίων. 1. Ροή της ισοτοπικής ιχνηθέτησης. 2. Προσθήκη ενδιαμέσων 3. Το θεώρημα της διασταύρωσης (cross-over) 4. Χρήση μεταλλαγμένων κυττάρων

Ο συντελεστής ελέγχου της ροής Έστω η μεταβολική πορεία:   J Xo → S1 → S2 → ……. Sn → X1 Sk (διακλάδωση)  με ροή από το Xo στο Χ1 ίση με J. Ο συντελεστής ελέγχου της ροής του ενζύμου i θα είναι το ποσοστό της μεταβολής της ροής που θα οφείλεται σε μια μεταβολή του ποσοστό της συγκέντρωσης του ενζύμου i.

Το αθροιστικό θεώρημα Το συνδετικό θεώρημα Έστω το τμήμα μιας μεταβολικής πορείας  λόγω του αθροιστικού θεωρήματος και του συνδετικού Μπορώ να υπολογίσω τους συντελεστές ελέγχου ροής από τους συντελεστές ελαστικότητας. Ποσοτικό κριτήριο για τον καθορισμό κάποιου ή κάποιων βημάτων ως αποφασιστικά στον μεταβολικό έλεγχο μας δίνει ο συντελεστής ελέγχου της ροής. Το αθροιστικό θεώρημα δείχνει πώς όσο ο συντελεστής ελέγχου της ροής πλησιάζει το 1 το βήμα τείνει να γίνει το αποφασιστικό βήμα, αυτό που περιορίζει (καθορίζει) τη ταχύτητα. Το συνδετικό θεώρημα συνδέει το συντελεστή ελέγχου της ροής με το συντελεστή ελαστικότητας και δίνει ένα ποσοτικό κριτήριο διάκρισης μεταξύ του ρυθμιστικού ομοιοστατικού ρόλου και του αποφασιστικού ελεγκτικού ρόλου κάποιου βήματος, υποδεικνύοντας αντίστροφη σχέση τους. Συνδυασμός των δύο θεωρημάτων μας βοηθά να υπολογίσουμε τους συντελεστές ελέγχου της ροής από συντελεστές ελαστικότητας, δηλαδή κινητικά δεδομένα.