荣昌猪遗传资源的保护与开发利用 重庆市畜牧科学院 王金勇. 面积 1079 人口 :81 万  起源于本地 (古昌州) 公元 1567 年前 起源 起源湖广移民带入 公元 1649 年后 康熙二年至四十年 清康熙四十年 ( 1701 )前后, 经过长期战乱, 人口大减,清廷 先后招湖广、江 西等省人民实行.

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荣昌猪遗传资源的保护与开发利用 重庆市畜牧科学院 王金勇

面积 1079 人口 :81 万

 起源于本地 (古昌州) 公元 1567 年前 起源 起源湖广移民带入 公元 1649 年后 康熙二年至四十年 清康熙四十年 ( 1701 )前后, 经过长期战乱, 人口大减,清廷 先后招湖广、江 西等省人民实行 退荒,不少人在 荣昌落户。广东 和湖南的移民来 川时,将当地的 白猪仔带入荣昌 饲养,经过自然 选育,逐步成为 目前远近闻名的 荣昌猪。 余德仁先生

项目来源: “ 十一五 ” 国家科技支撑计划 项目名称:荣昌猪品种资源开发关键技术研究与 产业化示范 项目编号: 2007BAD51B03 牵头单位:重庆市畜牧科学院 参加单位: 14 个一级单位 起止年限:

荣昌猪资源群体 的大规模基因筛查 育种素材的收集 育种基础群的组建 育种素材的收集 育种基础群的组建 优异性状基因资源挖掘 DNA 分子标记辅助选 择、基因诊断技术 荣昌猪专门化品系 配套系 荣昌猪专门化品系 配套系 畜禽遗传资源冷 冻保存库 保种核心群 ( 场 ) 农村繁殖群 世代选育 猪肉精深加工 猪肉精加工关键技术 高效冷冻保存 技术体系建立 高效冷冻保存 技术体系建立 营养参数、饲养工艺 生物安全控制技术 营养参数、饲养工艺 生物安全控制技术 课题 一 课题二 课题三 课题四、五 课题六 产业化 示范

 高效冷冻保存技术研究  三级保护体系建立  特色(优势)性状遗传基础研究  专门化品系选育  数字化

高效冷冻保存技术研究 猪精液冷冻技术研究 实验研究: 实验 1 、精液冷冻保存基础液配方的筛选 实验 2 、精液冷冻保存液配方的优化 实验 3 、精液冷冻解冻液配方的筛选 实验 4 、精液冷冻解冻速率的筛选

猪精液冷冻技术体系 采精 精液活率检查 精液稀释 冻前平衡 液氮滴冻 精液品质检查 采用最优猪冷冻精液稀释液配方 解冻输精 采用 V 号解冻液配方 解冻速率为 27.5 ℃ /s 冻精入库

高效冷冻保存技术研究 猪卵母细胞冷冻保存技术研究 实验研究: 实验 1 、不同冷冻保护剂对猪 MII 期卵母细胞冷冻保存 效果的影响 实验 2 、不同冷冻保存方法对猪 MII 期卵母细胞冷冻保 存效果的影响 实验 3 、冻后猪卵母细胞作激活后发育效果

猪卵母细胞冷冻保存技术体系 卵母细胞体外成熟培养卵母细胞体外成熟培养 OPS 玻璃化冷冻 激活 玻璃化解冻 CB 处理 发育培育 44h 144h 检测囊胚率 EDFS40 入库保存 检测卵裂率 FDA 检测存活 场强 100V/mm , 80μs 、 3 次, 每次间隔 100ms 7.5μg/ml 、 6h

高效冷冻保存技术研究 猪胚胎冷冻技术研究 实验研究: 实验 1 、猪胚胎的常规冷冻保存 实验 2 、玻璃化冷冻液对猪扩张囊胚冷冻效果的影响 实验 3 、冷冻处理方法对玻璃化猪囊胚冷冻效果的影响 实验 4 、猪胚胎的移植

猪胚胎冷冻保存技术体系 手术采胚 离心 CB 处理 OPS 冷冻 解冻移植 13000r/min 、 13min 配种后 6-7 天囊胚 7.5μg/ml 、 30min 入库保存 检测冻后品质

三级保护体系建立

四个保护区 直升镇火烧店 社区、漫水村 保护区 峰高街道峨眉 社区保护区 昌州街道石河 村保护区 双河街道高峰 村、白云社区 保护区

两个保种场( 1 个国家级)

两个保种场( 1 个市级)

胚胎、配子冷冻保存库( 36 m 2 ) DNA 样本库( 22 m 2 ) 一个冷冻保存库

为研究荣昌猪基因组、基因结构 以及新基因发现等工作奠定了坚 实的基础。该文库是我国乃至国 际上第一套荣昌猪的 BAC 文库, 是研究我国优良地方品种遗传资 源的重要平台。 构建了荣昌猪 BAC 文库 BAC 文库包含约 19.2 万个克隆作,平均插入基因组片 段为 120kb ,约覆盖猪全部基因组的 7 倍以上。

特色(优势)性状遗传基础研究 荣昌仔猪早期肌肉、脂肪生长规律研究 哺乳仔猪从出生至 80 日龄,每隔 7 天跟踪测量 用超声诊断仪测量眼肌面积和背膘厚度

眼肌日龄生长曲线 眼肌体重生长曲线 背膘日龄生长曲线 背膘体重生长曲线 荣昌仔猪早期肌肉、脂肪生长规律研究

特色(优势)性状遗传基础研究 荣昌乳猪氨基酸组成及含量分析 荣昌乳猪肌肉氨基酸分析典型色谱图 荣昌乳猪肌肉中脯氨酸典型色谱图

荣昌乳猪氨基酸组成及含量分析 荣昌乳猪四部位肌肉氨基酸分析典型色谱图 荣昌乳猪四部位肌肉中脯氨酸典型色谱图

项目一号肉 2 号肉 3 号肉 4 号肉 天门冬氨酸 Asp 苏氨酸 Thr 丝氨酸 Ser 谷氨酸 Glu 甘氨酸 Gly 丙氨酸 Ala 半胱氨酸 Cys 缬氨酸 Val 蛋氨酸 Met 异亮氨酸 Iso 亮氨酸 Leu 酪氨酸 Tyr 苯丙氨酸 Phe 赖氨酸 Lys 组氨酸 His 精氨酸 Arg 脯氨酸 Pro 氨基酸总量 TAA 必需氨基酸 EAA 呈味氨基酸 FAA EAA/TAA ( % ) FAA/TAA ( % ) 不同部位荣昌乳猪肌肉中氨基酸含量 荣昌乳猪肌肉 EAA/TAA 在 40% 以 上,是优质蛋白质 来源 。 荣昌乳猪肌肉中主要 呈味氨基酸含量较高, 是肌肉风味挥发性成 分的重要来源。

在所检测的 17 种氨基酸中,谷氨酸的含量最高,在 3.60% ~ 4.50% 之间, 约占总氨基酸含量的 15% 以上;天冬氨酸和赖氨酸的含量也较高,在 2.00% ~ 2.50% 之间,约占总含量的 8.80% ~ 9.60% ;最低的是半胱氨 酸,仅为 0.24% ~ 0.59% ,约占总含量的 0.97% ~ 2.20% 。肉中总氨基 酸含量随体重增加呈不断上升趋势,其中 100 kg 的总含量显著高于 10 kg 。 异亮氨酸、亮氨酸和苯丙氨酸含量在 10 ~ 20 kg 显著提高,随后呈缓慢 上升趋势。可见,各氨基酸含量随体重的变化规律不尽相同。

荣昌乳猪 1 号肉肌肉脂肪酸 典型气相色谱图 荣昌乳猪 2 号肉肌肉脂肪酸 典型气相色谱图 荣昌乳猪 3 号肉肌肉脂肪酸 典型气相色谱图 荣昌乳猪 4 号肉肌肉脂肪酸 典型气相色谱图 荣昌乳猪脂肪酸组成及含量气相色谱分析

荣昌乳猪四部位肌肉饱和脂肪酸、单不饱和脂肪酸 多不饱和脂肪酸相对含量的比较 四部位肌肉饱和脂肪酸 ( SFA )相对含量差异 不显著( P > 0.05 ) 四部位肌肉单不饱和脂肪 酸( MUFA )相对含量差异 不显著( P > 0.05 ) 四部位肌肉多不饱和脂肪 酸( PUFA )相对含量差 异显著( P < 0.05 )

荣昌乳猪四个部位肌肉中脂肪酸组成主要是 C16 和 C18 脂肪酸,占总量的 85% 以上,其它脂 肪酸含量较少,荣昌乳猪四部位肌肉饱和脂肪酸 ( SFA )中,以棕榈酸( C16:0 )和硬脂酸 ( C18:0 )为主,占所测脂肪酸总量的 45% 左右, 占所测饱和脂肪酸的 90% 以上。四部位肌肉饱和 脂肪酸( SFA )总量差异不显著( P > 0.05 荣昌乳猪四个部位肌肉中脂肪酸组成主要是 C16 和 C18 脂肪酸,占总量的 85% 以上,其它脂 肪酸含量较少,荣昌乳猪四部位肌肉饱和脂肪酸 ( SFA )中,以棕榈酸( C16:0 )和硬脂酸 ( C18:0 )为主,占所测脂肪酸总量的 45% 左右, 占所测饱和脂肪酸的 90% 以上。四部位肌肉饱和 脂肪酸( SFA )总量差异不显著( P > 0.05 )

荣昌乳猪不同部位肌肉中挥发性物质种类及数量 荣昌乳猪背最长肌肉( 2 号肉)挥发性风味物质指纹图 荣昌乳猪背臀腿肉( 3 号肉)挥发性风味物质指纹图

荣昌乳猪不同部位肌肉中挥发性香气物质种类及数量分别为: 2 号肉, 共计 11 大类 140 种物质; 3 号肉共计 11 大类 90 种物质; 4 号肉共计 11 大类 86 种物质。 荣昌乳猪各部位检测到的挥发性风味物质相对含量最高的是己醛。 荣昌乳猪肌肉中占优势的挥发性风味物质主要有:丁醛、戊醛、 2- 甲基丁醛、己醛、庚醛、苯甲醛、辛醛、壬醛、正癸醛、环戊醇、 1- 戊醇、 1- 己醇、 1- 庚醇、 1- 辛烯 -3- 醇、 2- 癸烯 -1- 醇、 1- 辛醇、芳 樟醇、 2- 丁酮、 2,3- 辛烷二酮、 6- 甲基 -5- 庚烯 -2- 酮、丙酮酸、 α,γ- 二 乙酰基乙酰醋酸、 2,2,4- 三甲基 -3- 羧异丙基戊酸异丁基酯、邻苯二 乙酸异丁基十八 ( 烷 ) 基酯、辛烷、十一烷、 D- 柠檬烯、 1- 碘 -2 甲基壬 烷、 3- 甲硫基丙醛、 2- 甲基 -1- 丁硫醇、 3,3- 二甲基哌啶、 4,5- 二乙基 -2 , 3- 二甲基 - 二氢呋喃。

不同部位肌肉、脂肪组织显微结构分析 快肌免疫荧光组化分析 慢肌免疫荧光组化分析

利用全基因组表达谱基因芯片分析不同 品种、不同部位、不同发育方式脂肪组 织基因表达差异 不同部位、不同类型脂肪组织 特色(优势)性状遗传基础研究 荣昌猪不同部位脂肪组织的基因表达谱研究

筛选到大量的差异表达基因,揭示了品 种间、部位间、性别间脂肪组织巨大表 型差异背后的分子调控机制。 差异基因染色体富集叠瓦图差异基因表达模式聚类图 荣昌猪不同部位脂肪组织的基因表达谱研究

选择荣昌猪胚胎期发育和生后发育阶段的 10 个时间点 采用高通量测序手段大规模发现猪 microRNA 特色(优势)性状遗传基础研究 猪 microRNA 组研究

完成了首个从出生前到出生后整个发 育阶段的 microRNA 组图谱。 pre-miRNA 序列增至 867 条,编码的成 熟体 miRNA 序列增至 1004 条,其中特 异 miRNA 序列达到 777 条。 猪 microRNA 组研究

特色(优势)性状遗传基础研究 全白荣昌猪耳聋的遗传机制研究

听觉脑干诱发电位图 底 回 中 回 顶 回 耳蜗毛细胞扫描电镜图 通过脑干听觉诱发电位( ABR )检测、扫描电镜、耳蜗铺片 及抗体染色等证实,全白荣昌猪耳蜗毛细胞的缺失和纤毛的 融合是导致耳聋的直接原因。

专门化品系选育

专门化品系选育 荣昌猪烤乳猪专门化品系 核心选育群有公猪 12 头,能繁母猪 110 头,经产 仔猪数达 头,达 6kg 体重日龄 34.8 天。

荣昌猪高脂肪含量专门化品系 专门化品系选育

数字化 荣昌母猪数据集 共计 2315 张连续断面图像,数 据集总数据量为 69.9GB 。

荣昌公猪数据集 共计 7254 张连续断面图像,整个数据集 总数据量为 229GB 。

荣昌怀孕母猪数据集 共计 6525 张连续断面图像,整个数据集总 数据量为 199GB 。

荣昌仔猪数据集 共计 2495 张连续断面图像,整个数 据集总数据量为 79GB 。

整体三维重建

 荣昌猪多层次保护体系 保护区 / 保种场 / 冷冻库 /BAC 文库 保护区 / 保种场 / 冷冻库 /BAC 文库  特色(优势)性状 肉质 / 脂肪沉积 / 人类疾病模型 肉质 / 脂肪沉积 / 人类疾病模型  结构 数字化 / 基因组重测序 数字化 / 基因组重测序  专门化品系选育 小结