בקרת ביטוי גנים בפרוקריוטיים

Slides:



Advertisements
Παρόμοιες παρουσιάσεις
מציאת צורה של מבני Tensegrity
Advertisements

מעבר מביטוי רגולרי ל – NFA (גזור ושמור) משפט: לכל ביטוי רגולרי r קיים אוטומט סופי A כך ש – L(A)=L(R). לכל אוטומט סופי A קיים ביטוי רגולרי r כך ש – L(A)=L(R).
תחשיב הפסוקים חלק ו'.
72120 – ביוכימיה של התא תרגיל מס' 3: קינטיקה אנזימתית.
שיעור 6 האטמוספירה בתנועה.
מגוון גנטי.
ניתוח תחבירי (Parsing) - המשך
Atom Interferomtry סוגי אינטרפרומטרים סוגי אינטרפרומטרים מודל של Double Y Interferometer מודל של Double Y Interferometer סיבוב של האינטרפרומטר סיבוב של.
שדות מגנטיים של זרמים משלוח ספינות חלל מכדור הארץ לחלל נעשה ע"י רקטות. אבל כאשר נתחיל לייבא מינרלים מהחלל לארץ, לא יהיה לרשותנו דלק לשליחת ספינות חלל.
תורת התורים תיאור חלקי עולם כרשתות של תורים לצורך: יישומים: הבנה
בדיקת תכונות של גרפים במודל מטריצת השכנויות ענב וינרב ינון חביב.
הרצאה 11: סמנטיקה ומשפט השלמות. אינטרפרטציה אינטרפטציה M מורכבת מ- 1. קבוצה D≠ ,D - תחום האינטרפטציה. 2. פרושים של פרדיקטים, פונקציות וקבועים ב- D, כלומר,
סמינר במדעי המחשב חורף תשסט תורת הטיפוסים הפשוטים הבסיסית הרצאה מס 3 ינון רפופורט חלק 1 משפט בנית הנושא.
בשעור הקודם הגדרנו את מושג השטף החשמלי השטף החשמלי דרך משטח A הוא כמות קווי השדה שעוברת דרך המשטח.
מבוא לסימולציות: מערכות בקרה
תורות עם שוויון. תהי Гתורה מעל שפה שמכילה יחס בינרי =. אנו נכתוב s  t במקום ~s = t. Г נקראת תורה עם שוויון אם הנוסחאות הבאות הן משפטים של Г: A6. הרפלקסיביות.
התנהגות הרוח במערכות סינופטיות
משוואות מקסוול וגלים אלקטרומגנטיים
ניתוח תחבירי (Parsing) של דקדוקי LR(1)
ΥΠΟΥΡΓΕΙΟ ΠΑΙΔΕΙΑΣ ΚΑΙ ΠΟΛΙΤΙΣΜΟΥ
Η θέση της χρωματίνης στον πυρήνα είναι τυχαία ή όχι
מבני נתונים 08 מיון.
מוטציות התא – מבנה ותפקוד המוטציות, השפעותיהן והגורמים להן
ΕΛΕΓΧΟΣ ΤΗΣ ΓΟΝΙΔΙΑΚΗΣ ΕΚΦΡΑΣΗΣ
Confidence intervals based on bootstrap “tables”
מבני נתונים ויעילות אלגוריתמים
גודל פיזיקאלי סקלרי אינו תלוי בכיוון
בס"ד אינטגרלים משולשים (והחוט המשולש לא במהרה יינתק)
מבני נתונים ויעילות אלגוריתמים
בתשלומי המעסיקים לקופות גמל
תקשורת אלקטרו-אופטית מרצה: רועי עמרם.
בהנחיית פרופ' עוזי אורנן
ניהול הייצור למערכות מידע – ניהול האיכות, תרשימי בקרה
שירטוט מערכות אופטיות בסיסיות
ניהול הייצור למערכות מידע תרגול – ניהול פרוייקטים
מרתון בכימיה - פרויקט נחשון יום א
שעור 4 השלמות בתרשימי בקרה תרשימי C תרשימי U עקרונות הדגימה: מושגים
גישת תיק השקעות גיוון.
מדיניות תעסוקה בישראל ערביי ישראל פורום ספיר 4 נובמבר 2010
היבט כולל על הדואליות בין קינמטיקה וסטטיקה
אנימציה2: המתכת אבץ בתמיסת יוני נחושת
בדיקת מונוטוניות של פונקציות בוליאניות
בקרה במכונות מושגי יסוד תרשים מלבנים חוג פתוח/סגור משתנה מבוקר/מבקר
הרצאה 7 מבוא לסטטיסטיקה התפלגות נורמלית
גלגול, פיתול ותנע זוויתי
אולימפיאדה צעירה ע"ש אילן רמון שלב ג' 2013
10. תכנות לוגי ב-Datalog שקפים: אלדר פישר
ליאור שפירא, חיים קפלן וחברים
גלים אלקטרומגנטיים.
תורת התורים תיאור חלקי עולם כרשתות של תורים לצורך: יישומים: הבנה
אורך, היקף, שטח ונפח.
השוואה בין מחלקות.
נושא 4: זרם חילופין.
ספקטרוסקופיה ואפקט החממה
תורת הגרפים.
מדדים בית ספריים לניבוי אפקטיביות ההטמעה של טכנולוגיות חדשניות:
אנדוקרינולוגיה.
מתוך "טעם של כימיה" מזון למחשבה שומנים ושמנים
סימולציה- קוטביות מולקולות סימולציה- צורות מולקולה
מבני נתונים ויעילות אלגוריתמים
מבני נתונים ויעילות אלגוריתמים
זרם חילופין AC.
גלאי FM באפנון FM משתנה תדר הגל הנושא ע"י המשרעת של אות המידע, בעוד שהמשרעת של הגל הנושא נשארת קבועה. גלאי FM צריך לזהות את שינויי התדר ולהפוך אותם לשינויי.
בניית רובוט במבנה משולש הנשלט ע"י מחשב כף יד
אלגוריתם סנכרון למערכות OFDMA
אנרגיה בקצב הכימיה פרק א'
סדרה סופית של תשלומים קבועים :
72120 – ביוכימיה של התא מנגנוני קטליזה אנזימתית - כימוטריפסין
שומנים ושמנים.
ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΟ ΙΩΑΝΝΙΝΩΝ ΑΝΟΙΚΤΑ ΑΚΑΔΗΜΑΪΚΑ ΜΑΘΗΜΑΤΑ
Μεταγράφημα παρουσίασης:

בקרת ביטוי גנים בפרוקריוטיים

בקרה על פעולת הגנים בכל תא של כל אורגניזם קיים מידע גנטי זהה. בכל תא בא לידי ביטוי רק חלק מן המידע. זהו חלק הכרחי לקיום התא ולתפקודו. גן מתבטא על ידי תוצר ביולוגי שלו, הקיים בתא ופעיל בו. http://www.amalnet.k12.il/sites/genetic/frm_articles.htm

איך מתבצעת הבקרה על ביטוי הגנים? מנגנוני בקרה שולטים על הביטוי הייחודי של הגנים בכל תא ועל דיכויים של גנים אחרים באמצעות חלבוני בקרה. הפיקוח על ביטוי הגנים נעשה ברמות בקרה שונות: 1. רמת הדנ"א 2. רמת התיעתוק 3. רמת הרנ"א 4.רמת התרגום 5.רמת החלבון

-תיאורית מודל האופרון Jacob and Monod, 1961 ראשית המחקר להבנת מנגנוני הבקרה האחראיים על פעולת הגנים נעשתה בחיידקים, בגלל פשטות המבנה שלהם ונוחות גידולם במעבדה

בקרה באופרון הלקטוז בפרוקריוטים - שינוי בסביבה החיצונית משפיע מידית על התבטאות הגנים שבתאים. למשל חיידקי המעיים מסוג אשריכיה קוליE. coli- מסוגלים להתרבות על מצע מזון שבו מקור הפחמן והאנרגיה הוא גלוקוז אבל בהיעדרו של גלוקוז הם יכולים לחיות גם על מצע של לקטוז (דו סוכר). כאשר מגדלים את החיידקים על מצע מזון שאין בו לקטוז, האנזים ביתא - גלקטוזידאז המפרק לקטוז לגלוקוז וגלקטוז אינו מיוצר. כאשר מעבירים את החיידקים למצע מזון שמכיל לקטוז, תוך זמן קצר נוצר האנזים מחדש.

פירוק הלקטוז לגלוקוז וגלקטוז על ידי האנזים ביתא-גלקטוזידאז פירוק הלקטוז לגלוקוז וגלקטוז על ידי האנזים ביתא-גלקטוזידאז

אופרון אופרון (operon) הוא צבר גנים (cluster genes) שביטויים מבוקר ע"י רצפי בקרה משותפים. כל הגנים באופרון נמצאים בשכנות, ומתועתקים כיחידת mRNA אחת ולכן נמצאת תחת בקרת שעתוק משותפת. הגנים בקבוצה הם לרוב בעלי תפקיד משותף במנגנון מטבולי, למשל קבוצת גנים הדרושים לסינתזה של חומצת אמינו מסוימת.

מבנה אופרון הלקטוז קטע של כרומוזום שמכיל גנים מבניים שמקודדים ליצירת כמה אנזימים. ובנוסף גם אזור בקרה שמבקר את פעולתם של הגנים המבניים.

מבנה אופרון הלקטוז - המשך הגנים בדנ"א מתחלקים לשתי קבוצות עיקריות: גנים מבניים - הם גנים המקודדים לחלבונים או לתוצרי רנ"א. גנים מווסתים - גנים המקודדים לחלבונים השותפים בבקרת גנים אחרים, תוצרי גנים אלו נקראים חלבונים מווסתים (regulatory protein) .

ביטוי קבוע לעומת ביטוי משתנה ישנם חלבונים המתבטאים באופן קבוע בתא ללא קשר לפעילות התא נקראים חלבוני קבע . ישנם חלבונים שקצב ייצורם בתא משתנה בהתאם לצרוף תנאים מסוים נקראים חלבונים בני- השראה .

מבנה אופרון הלקטוז - המשך הגנים המבניים נמצאים על גבי הכרומוזום של החיידק, והם קרובים זה לזה; הם מתועתקים לרנ"א ומתורגמים לשלושת החלבונים המבניים כיחידה אחת. ( האנזים ביתא גלקטוזידאז, האנזים פרמיאז, ואנזים נוסף שחשיבותו טרם הובהרה). אזור הבקרה המצוי באופרון מכיל כמה אתרים: אתר מקדם - פרומוטר. אל האתר הזה נקשר האנזים רנ"א- פולימראז והוא שמתחיל בפעולת התעתוק של שלושת הגנים המבניים אתר מפעיל – אופרטור (operator)

מבנה אופרון הלקטוז - המשך סמוך לאופרון הלקטוז נמצא גן מווסת (rotaluger). הגן הזה מקודד ליצירת חלבון מווסת. החלבון המווסת יכול להתקשר לאופרטור, אתר מפעיל, שנמצא באזור הבקרה ולווסת את תהליכי התעתוק והתרגום.

אזורי הבקרה באופרון הלקטוז אתר מקדם Lac P) ) אתר הקישור לרנ"א פולמראז. מכאן מתחיל התעתוק של הגנים המבניים. גן מווסת Lac I מייצר חלבון דכאן בקצב קבוע . חלבון דכאן נקשר לאתר מפעיל Operator)), כך הוא חוסם את התעתוק ע"י האנזים רנ"א פולימראז. אתר מפעיל- אתר קישור לחלבון הדכאן

גנים מבנים באופרון הלקטוז Lac Z - מקודד לאנזים β גלקטוזידאז, המפרק את הלקטוז לגלוקוז ולגלקטוז. Lac Y – מקודד לחלבון נשא ממברנלי המאפשר את כניסת הלקטוז לתא. Lac A - מקודד לאנזים β - galactoside transacetylase ,, המעביר קבוצת אצטיל מאצטיל CoA ל- β - galactosides מוטציה בגן Lac A אינה פוגעת בקליטת לקטוז ופירוקו , לכן חשיבתו בתוך מערך אופרון הלקטוז עדין לא ברורה.

CAP - חלבון מפעיל , חלבון ה- CAP נקשר למולקולת cAMP התצמיד CAP-cAMP נקשר לאתר המקדם ומסייע להגביר את תהליך התעתוק.

מנגנון הפעולה של אופרון הלקטוז תהליך הבקרה במצע שאינו מכיל לקטוז כאשר מצע המזון אינו מכיל לקטוז, מולקולת החלבון הדכאן קשורה לאופרטור ולכן דרכו של האנזים רנ"א-פולימראז חסומה ותעתוק הגנים באופרון לא מתבצע. http://www.hs.ph.biu.ac.il/prokaryotes/anim.shtml

מנגנון הפעולה של אופרון הלקטוז - המשך א. בנוכחות לקטוז הלקטוז משמש גם כמקור פחמן וגם כגורם בקרה, המשרה את יצירתם של האנזימים. הלקטוז משמש כמשרן ב. בהיעדר לקטוז http://www.hs.ph.biu.ac.il/prokaryotes/anim.shtml

מבנה אופרון הלקטוז - המשך

אנימציות סרטון מתורגם http://www.hs.ph.biu.ac.il/prokaryotes/anim.shtml http://www.hs.ph.biu.ac.il/prokaryotes/background.shtml http://www.amalnet.k12.il/sites/genetic/frm_articles.htm

ולסיכום: האנזים לפירוק לקטוז נוצר רק כשיש בו צורךבאמצעות: בקרה חיובית – החלבון המווסת גורם לתחילת תיעתוק האופרון. בקרה שלילית – החלבון המווסת מונע את תיעתוק האופרון.