NASLEĐIVANJE KVANTITATIVNIH SVOJSTAVA

Slides:



Advertisements
Παρόμοιες παρουσιάσεις
KRUŽNICA I KRUG VJEŽBA ZA ISPIT ZNANJA.
Advertisements

Odabrane oblasti analitičke hemije
Laboratorijske vežbe iz Osnova Elektrotehnike
STEROIDI.
PTP – Vježba za 2. kolokvij Odabir vrste i redoslijeda operacija
IPR – NAFTA 2.
oscilacije i talasi 1. Oscilatorno kretanje 2. Matematičko klatno
ANALIZA GREŠAKA U MERENJU Analiza i poređenje rezultata merenja vežba 1.1 Dušan Jovanović 55/06.
AOS
Van der Valsova jednačina
RIZIK PORTFOLIA SHRPEOV MODEL
BROJ π Izradio: Tomislav Svalina, 7. razred, šk. god /2016.
NASLOV TEME: OPTICKE OSOBINE KRIVIH DRUGOG REDA
IPR – NAFTA 1.
Digitalna logika i minimizacija logičkih funkcija
Čvrstih tela i tečnosti
SPSS 1.OPIS KATEGORIČKE VARIJABLE 2.OPIS NUMERIČKE VARIJABLE
18.Основне одлике синхроних машина. Начини рада синхроног генератора
Toplotno sirenje cvrstih tela i tecnosti
Merenja u hidrotehnici
Eritrocitopoeza.
POLINOMI :-) III℠, X Силвија Мијатовић.
VODA U TLU.
VREMENSKI ODZIVI SISTEMA
Direktna kontrola momenta DTC (Direct Torque Control)
Aminokiseline, peptidi, proteini
Kontrola devijacije astronomskim opažanjima
SPECIJALNE ELEKTRIČNE INSTALACIJE
Merni uređaji na principu ravnoteže
PRIJENOS TOPLINE Izv. prof. dr. sc. Rajka Jurdana Šepić FIZIKA 1.
Merni uređaji na principu ravnoteže
Tehnika i tehnologija proizvodnje gasa (6)
Vijetove formule. Rastavljanje kvadratnog trinoma na linearne činioce
TROUGΔO.
JEDNOSTAVNA LINEARNA REGRESIJA
Vijetove formule. Rastavljanje kvadratnog trinoma na linearne činioce
JEDNAČINA PRAVE Begzada Kišić.
Imunodeficijencije.
Rezultati vežbe VII Test sa patuljastim mutantima graška
II. MEĐUDJELOVANJE TIJELA
KRETANJE TELA U SREDINI SA PRIGUŠENJEM – PROBLEM KIŠNE KAPI
PONAVLJANJE.
KALIBRACIJA SONDE ZA PRITISAK VEŽBA 2.1
MATEMATIČKI MODELI EFIKASNOSTI
Dimenziona analiza i teorija sličnosti
Normalna raspodela.
Strujanje i zakon održanja energije
Izradila: Ana-Felicia Barbarić
Polifazna kola Polifazna kola – skup električnih kola napajanih iz jednog izvora i vezanih pomoću više od dva čvora, kod kojih je svako kolo pod dejstvom.
RIZIK PORTFOLIA SHRPEOV MODEL
Hemijska termodinamika
Analiza deponovane energije kosmičkih miona u NaI(Tl) detektoru
Transformacija vodnog vala
SREDIŠNJI I OBODNI KUT.
4. Direktno i inverzno polarisani PN spoja
Kvarkovske zvijezde.
UČINSKA PIN DIODA.
10. PLAN POMAKA I METODA SUPERPOZICIJE
Tehnološki proces izrade višetonskih negativa
Dan broja pi Ena Kuliš 1.e.
Geografska astronomija : ZADACI
POUZDANOST TEHNIČKIH SUSTAVA
ANALIZA GREŠAKAU MJERENJU UPOREDNA ANALIZA REZULTATA Ana Đačić 62/07
Unutarnja energija Matej Vugrinec 7.d.
N. Zorić1*, A. Šantić1, V. Ličina1, D. Gracin1
Pirotehnika MOLIMO oprez
doc. dr. sc. Martina Briš Alić
Tomislav Krišto POSLOVNA STATISTIKA Tomislav Krišto
Kratki elementi opterećeni centričnom tlačnom silom
Balanced scorecard slide 1
Μεταγράφημα παρουσίασης:

NASLEĐIVANJE KVANTITATIVNIH SVOJSTAVA

Većina ekonomski važnih svojstava (količina mleka, količina mlečne masti, prirast, konverziaj hrane, prinos vune itd.) pripada kvantitativnim svojstvima. Fenotipska ispoljenost ovih svojstava zavisi od: a) većeg broja (minor ili aditivnih) gena sa slabim pojedinačnim efektom (poligeni tip nasleđivanja) b ) faktora spoljne sredine

Populacija  +1δ +2δ +3δ

E- faktori spoljne sredine F = G + E   F – fenotip G – genotip E- faktori spoljne sredine

FENOTIP I FENOTIPSKI PARAMETRI Fenotip je spoljašnji izgled ili rezultati merenja kvantitativnih osobina, kao rezultat interakcije genotipa i spoljne sredine.

Fenotipski parametri su statistički parametri koji opisuju distribuciju frekvencija rezultata merenja svojstava u populaciji.

SVOJSTVO S V% Min Max Količina mleka   Dnevni prirast Prinos vune

NAČINI DELOVANJA POLIGENA (ADITIVNIH ILI MINOR GENA)   Delovanje poligena može biti: -         aditivno -         dominantno -         epistatično

Delovanje gena je aditivno kad fenotip koji oni daju predstavlja zbir negativnih i pozitivnih efekata pojedinačnih gena. Aditivni efekat gena je u tesnoj vezi sa oplemenjivačkom vrednošću grla.

Dominantno delovanje gena je posledica interakcije alela unutar lokusa Dominantno delovanje gena je posledica interakcije alela unutar lokusa. Dominantnost može biti: -         delimična -         puna -         overdominantnost Na dominantnom efektu gena se zasniva pojava heterozisa

Epistatično delovanje gena je posledica interakcije između lokusa.

A B a b Dominans Epistasis

FAKTORI SPOLJNE SREDINE I KVANTITATIVNE OSOBINE   Uticaji faktora spoljne sredine na kvantitativne osobine mogu biti: -     trenutni – uticaji ishrane, nege, zdravstvenog stanja itd. koji se eliminišu kada se posmatra srednja vrednost -       trajni – uticaji farme, godine, sezone itd. koji se eliminišu izborom metoda testiranja i matematičko statističkim metodama -    materinski uticaji koji se eliminišu izborom metoda testiranja i matematičko statističkim metodama

MATERINSKI EFEKAT Svaki doprinos na fenotip individue na koji direktno utiče fenotip njihove majke. Citoplazmatični efekat - bez ekstranuklearne DNK - sa ekstranuklearnom DNK Prenatalni materinski efekat Transfer antitela majke potomcima Postnatalni materinski efekat

Naslednost i promenjivost (interakcija genotip-okolina) Naslednost - proces razvića novih organizama koji su slični svojim roditeljima i precima. Promenjivost – razlike koje postoje između roditelja i potomaka (nastale kao posledica promena u NASLEDNOJ OSNOVI i uticajem FAKTORA OKOLINE koji se neprekidno menjaju u toku razvića jedinke).

Naslednost i faktori okoline Vinters-ov krug Krug predstavlja individualnu naslednu mogućnost i ograničenost Faktori okoline su mnogobrojni: klima, ishrana, način držanja i sl. Samo u optimalnim uslovima sredine moguće je potpuno ispoljavanje genetskog potencijala.

Nasledno variranje Primer: Prinos mleka u zavisnosti od genotipa Rasa A Rasa B Rasa C

Nasledno variranje

Nasledno variranje Nasledno variranje ima značaja za: evoluciju eksperimente u oblasti genetike stvaranje novih rasa

Rasa A- visoka mlečnost Nenasledno variranje Primer: Prinos mleka u zavisnosti od faktora okoline (farma) Rasa A- visoka mlečnost Farma 1 Farma 2 Farma 3

Nenasledno variranje Nenasledno variranje značajno je za poljoprivrednu proizvodnju.

G E N E T S K I P A R A M E T R I HERITABILNOST REPITABILNOST   HERITABILNOST REPITABILNOST GENETIČKE KORELACIJE FENOTIPSKE KORELACIJE KORELACIJE OKOLINE VARIJANSE I KOVARIJANSE

Služe za: · Izučavanje izvora varijabilnosti – pre svega genetske ·        Proučavanje prirodne akcije gena koji determinišu određena svojstva ·        Izbor pravca oplemenjivanja ·        Procenu oplemenjivačkih vrednosti priplodnjaka i plotkinja ·   Izbor metoda selekcije sa odgovarajućim efektom tj. genetičkim trendom ·        Modeliranje kriterijuma selekcije ·        Proučavanje interakcije između genotipa životinje i okoline

KOEFICIJENT NASLEDNOSTI HERITABILNOST KOEFICIJENT NASLEDNOSTI h2

Jay L. Lush.

U širem smislu

U izrazu regresije heritabilnost predstavlja očekivanu promenu u aditivnoj genetskoj vrednosti potomaka za svaku jedinicu promene u fenotipu roditelja:   h2 = bAP

Vrednosti heritabilnosti se mogu kretati u intervalu od 0 do 1.

Heritabilnost nije biološka konstanta Heritabilnost između svojstava se razlikuje: Niskonasledna , sa vrednošću 0,0-0,10 ili 0-10% Srednjenasledna, sa vrednošću 0,1-0,4 ili 10-40% Visokonasledna, preko 0,4 ili 40% Heritabilnost nije biološka konstanta

Metode za izračunavanje heritabilnosti na osnovu: sličnosti između srodnika h2 = 2( regresija potomaka na jednog od roditelja )= 2b h2 = ( regresija potomaka na prosek roditelja )= b h2 = 4 (interklasna korelacija unutar polusrodnika )= 4t h2 = 2 (interklasna korelacija unutar punih srodnika )= 2t aktuelnih selekcijskih ogleda izučavanja monozigotnih blizanaca

METOD INTRAKLASNE KORELACIJE

STATISTIČKI DEO METODA INTRAKLASNE KORELACIJE   Yik =  + Ai + Eik gde je: Yik – opažanje (merenje) na k-toj individui (potomku) i-tog oca  - opšta srednja vrednost posmatrane osobine Ai – uticaj i-tog oca Eik – nekontrolisani izvori varijabilnosti

Tabela 1: Analiza varijanse IZVORI VARIJABILNOSTI   STEPENI SLOBODE SUME KVADRATA SREDINE KVADRATA E2 IZMEĐU OČEVA S-1 SKs MKs 2w+k2S IZMEĐU POTOMAKA UNUTAR OČEVA n.-S SKw MKw 2w s - broj očeva n.- ukupan broj potomaka ni- broj potomaka po očevima k- koeficijent korekcije za nejednak broj potomaka po očevima ni=k kod jednakog broja potomaka po očevima

SUME KVADRATA   OČEVA POTOMSTVA

SREDINE KVADRATA   OČEVA POTOMSTVA

VARIJANSE OČEVA

POTOMSTVA

UKUPNA FENOTIPSKA VARIJANSA = +

INTRAKLASNI KORELACIONI KOEFICIJENT   HERITABILNOST h2=4*t

STANDARDNA GREŠKA HERITABILNOSTI  

RAZLIKE U SLUČAJU NEJEDNAKOG BROJA POTOMAKA PO OČEVIMA   STANDARDNA GREŠKA HERITABILNOSTI

Koeficijent ponovljivosti (Repeatability-Repitabilitet) Definicija: Repitabilitet (R) predstavlja vrednost intraklasnog koeficijenta korelacije između ponovljenih merenja iste osobine (laktacija, osobine plodnosti, proizvodnja jaja, vune ) i individue. Po pravilu pokazuje veću vrednost od heritabiliteta i predstavlja njegovu gornju granicu (uticaj spoljne sredine na ispoljavanje osobina). Vrednost R se kreće od 0-1

Koeficijent ponovljivosti (Repeatability-Repitabilitet) Izračunavanje Postupakom analize varijanse. Ukupna varijansa se rasčlanjava na varijabilnost između i unutar merenja. Za izračunavanje R nije potrebno grupisati grla po srodstvu Metod analize varijanse

Primena Za ocenu celokupne genetske varijanse, pri čemu moramo uvažiti, da 2G ocenjuje i deo varijanse spoljne sredine Za proveru tačnosti merenja te izbor tehnike merenja Za korekciju h2. Heritabilnost obično ocenjujemo na osnovu jednog merenja. Ako je na raspolaganju veći broj merenja h2 je veća. Tada h2 množimo faktorom

Korelacije Koeficijent korelacije rxy Pokazuje stepen slaganja između dve promenjive veličine. Korelacije: Fenotipske Genetske Okoline Genetske korelacije uslovljene su: Plejotropijom – pojava da isti geni utiču na ispoljavanje više osobina. Ukopčanošću gena – koja potiče od blizine lokusa na istom hromozomu na kojima se nalaze geni koji utuču na ispoljavanje 2 osobine. Koeficijent korelacije ima vrednosti od -1 do +1.

Korelacije Koeficijent korelacije Greška koeficijenta korelacije

rp rg Mlečna goveda Prinos mleka - Prinos ml. masti Fenotipske i genetske korelacije između važnijih osobina domaćih životinja rp rg Mlečna goveda Prinos mleka - Prinos ml. masti Prinos mleka - Prinos proteina Prinos mleka - Sadržaj proteina Prinos mleka - Sadržaj ml. masti + 0.80 + 0.90 - 0.30 + 0.95 - 0.20 Svinje Dnevni prirast - Dnevna konzumacija Dnevni prirast - Konverzija hrane Prinos mesa - Debljina leđne slanine - 0.40 - 0.80 - 0.50 - 0.45 - 0.75 Ovce Masa čistog runa - Prinos vune Masa čistog runa - Dužina vlakna Masa čistog runa - Vijugavost + 0.50 + 0.40 - 0.35 + 0.30 - 0.30 Živina Broj jaja - Masa tela Broj jaja - Masa jaja Masa tela - Masa jaja - 0.20 0.00 - 0.05 + 0.33

Principi i efekat selekcije

Selekcija Najznačajniji faktor promene frekvencije gena Selekcijom se ne stvaraju novi geni već se povećava frekvencija poželjnih, a smanjuje frekvencija nepoželjnih gena. Doprinos svake od odabranih individua zavisi od broja potomaka.

Selekcija Promene frekvencije gena mogu se sprovoditi putem: Izbora roditeljskih parova Kontrole načina parenja roditelja (metod odgajivanja) koji uključuje inbriding i ukrštanje

Selekcija se zasniva samo na aditivnim efektima gena 1954 2008 Selekcija omogućava menjanje i poboljšanje nasledne osnove domaćih životinaja (prošlost i sadašnjost). Selekcija se zasniva samo na aditivnim efektima gena

Efekat selekcije (∆ G ili R ili ES) Očekivani uspeh selekcije-uspeh koji se očekuje i unapred prognozira. Zasniva se na saznanjima populacione genetike. Odstupanje ostvarenog od očekivanog uspeha selekcije zavisi od tačnosti ocene PV domaćih životinja (aditivna genetska vrednost individua u odnosu na populaciju iz koje potiče). PV se zasniva na podacima fenotipa, porekla, srodnika i potomaka.

Efekat selekcije (∆ G) G = h2 ( Ps – P ) = h2  SD Efekat (uspeh selekcije) pokazuje promene u frekvenciji gena koje su izazvane selekcijom. Izračunava se na osnovu sledeće formule : G = h2 ( Ps – P ) = h2  SD u kojoj je: G = efekat (uspeh selekcije) ili genetski napredak za generaciju Ps = prosek odabranih roditelja P = prosek populacije h2 = heritabilitet SD = selekcijski diferencijal

Selekcijski diferencijal Selekcijski diferencijal (SD) predstavlja razliku između prosečne vrednosti roditelja i prosečne vrednosti grupe ili populacije SD = (Ps - P) SD = i × δ

Selekcijski diferencijal Vrednost selekcijskog diferencijala zavisi od: 1. Ukupne varijabilnosti posmatrane osobine (veća varijabilnost > SD a time i efekat selekcije) 2. Reproduktivne sposobnosti dom. živ. (veća reproduktivna sposobnost manje potrebnih životinja za zamenu > SD) 3. Broj odabranih životinja (manji broj životinja > SD) 4. Dugovečnosti (dugovečnije životinje manje potrebnih životinja za zamenu (remont) > SD) 5. Pola (muška grla po pravilu imaju > SD, razlog: potreban manji broj prilodnih grla u odnosu na ženska)

Selekcijski diferencijal SD = 2 SD m + SD ž Ukupan SD

Intenzitet selekcije Intenzitet selekcije je strogost pri odabiranju grla za priplod. Što je veći intenzitet selekcije veća je i njena efikasnost. Može se povećati: povećanjem broja testiranih životinja izborom načina testiranja : centralna testna stanica - farmski test; grupno – individualno držanje u testu smanjenjem broja izabranih životinja tačne metode za ocene oplemenjivačkih vrednosti primena savremenih biotehnologija (VO, zamrzavanje sperme, embrio transfer)

Heritabilitet Koeficijet heritabiliteta većine ekonomski važnih osobina domaćih životinja je nizak ili srednji . Veće vrednosti heritabiliteta > efekat selekcije

Efekat selekcije za godinu (∆ g) Osim za generaciju, efekat selekcije može da se odredi i za godinu. Genetski napredak za godinu je važan sa ekonomske tačke gledišta i dobija se kada se genetska promena za generaciju podeli sa generacijskim intervalom (t ili L). ∆ g = h2 (Ps - P) t

Generacijski interval (L, t) Generacijski interval jednak je prosečnoj starosti roditelja prilikom rađanja potomaka i predstavlja vreme u kome se geni prenose u narednu generaciju. Kraći generacijski interval > efekat selekcije Progeni test (test po potomstvu) i ponavljanje rezultata (veći broj merenja povećavaju t, ali istovremeno čine selekciju uspešnijom-tačnijom)

Metode odabiranja (selekcije) tj Metode odabiranja (selekcije) tj. procene oplemenjivačke vrednosti domaćih životinja Individualna selekcija (fenotip) -Selekcija po familijama - Selekcija unutar familija -Kombinovana (unutar i između familija) -Selekcija po braći i sestrama (sib) -Selekcija po poreklu -Selekcija po potomstvu -Indirektna selekcija -Selekcija na više osobina -nezavisni nivo selekcije -tandem selekcija -SI -Selekcija na osnovu linearnih modela -BLUP (AM)