Εισαγωγή  Σε μελέτες που έχουν γίνει τα τελευταία 20 χρόνια και βασίζονται τόσο σε μορφολογικά χαρακτηριστικά όσο και στο μιτοχονδριακό DNA, προτείνεται.

Παρουσίαση με θέμα: "Εισαγωγή  Σε μελέτες που έχουν γίνει τα τελευταία 20 χρόνια και βασίζονται τόσο σε μορφολογικά χαρακτηριστικά όσο και στο μιτοχονδριακό DNA, προτείνεται."— Μεταγράφημα παρουσίασης:

1 Εισαγωγή  Σε μελέτες που έχουν γίνει τα τελευταία 20 χρόνια και βασίζονται τόσο σε μορφολογικά χαρακτηριστικά όσο και στο μιτοχονδριακό DNA, προτείνεται είτε η τροποποίηση των ταξινομικών σχέσεων είτε η ύπαρξη αδελφών ειδών ή υποειδών μέσα στο είδος A. boyeri (Francisco et al., 2008).  Σκοπός της μελέτης είναι ο προσδιορισμός της γενετικής ποικιλότητας και των φυλογενετικών σχέσεων πληθυσμών της Atherina boyeri που προέρχονται κυρίως από τον ελλαδικό χώρο μέσω της αλληλούχισης τμήματος του βρόγχου εκτόπισης (D-loop).

2 Περιοχές δειγματοληψίας ΈνδειξηΠληθυσμός 1Ηγουμενίτσα 2Λευκάδα 3Ζάκυνθος 4Καλαμάκι 5Κυπαρισσία 6Κορινθιακός 7Εύβοια 8Λήμνος 9Μυτιλήνη 10Κως 11Νίσυρος 12Κάσος 13Πρέβεζα 14Αμβρακικός 15Κεφαλονιά 16Αιτωλικό 17Τριχωνίδα 18Ν. Μουδανιά 19Βιστωνίδα 20Κύμη 21Κάλυμνος 22Κουρνά Τουρκία Απομόνωση ολικού DNA Πολλαπλασιασμός του βρόγχου εκτόπισης D-loop με PCR Primers: CR-A: 5’-TTC CAC CTC TAA CTC CCA AAG CTAG-3’ CR-B: 5’-ACG CTG GAA AGA ACG CCC GGC ATG G-3’ (Lee Woo-Tai et al.,1995) Καθαρισμός & Αλληλούχιση του προϊόντος - Προέκυψε τμήμα ~500bp - Επεξεργασία αποτελεσμάτων - Κατασκευή φυλογενετικών δένδρων

3 1234567891011121314151617181920212223 1.Ν.ΜΟΥΔΑΝΙΑ − 2.ΒΙΣΤΩΝΙΔΑ0.00 − 3.ΚΟΥΡΝΑ0.00 − 4.ΚΑΛΥΜΝΟΣ0.01 0.02 − 5.ΚΥΜΗ0.000.01 − 6.ΤΟΥΡΚΙΑ0.000.01 * − 7.ΑΙΤΩΛΙΚΟ0.04 − 8.ΚΕΦΑΛΛΟΝΙΑ0.04 0.00 − 9.ΤΡΙΧΩΝΙΔΑ0.040.030.04 ** − 10.ΑΜΒΡΑΚΙΚΟΣ0.07 − 11.ΚΟΡΙΝΘΙΑΚΟΣ0.15 0.160.15 0.14 0.15 − 12.ΚΥΠΑΡΙΣΣΙΑ0.15 0.160.15 0.14 0.150.00 − 13.ΚΑΣΟΣ0.160.150.16 0.15 0.14 0.150.00* − 14.ΚΑΛΑΜΑΚΙ0.15 0.14 0.150.00* − 15.ΝΙΣΥΡΟΣ0.15 0.14 0.15*0.00 * − 16.ΜΥΤΙΛΗΝΗ0.16 0.14 0.160.00 − 17.ΛΗΜΝΟΣ0.16 0.15 0.14 0.15*0.00* * − 18.ΛΕΥΚΑΔΑ0.15 0.16 0.15 0.14 0.150.00* * 0.010.00 − 19.ΖΑΚΥΝΘΟΣ0.16 0.150.14 0.15***0.00* * − 20.ΗΓΟΥΜΕΝΙΤΣΑ0.15 0.14 0.15*****0.00*** − 21.ΠΡΕΒΕΖΑ0.170.160.17 0.14 0.160.14 − 22.ΕΥΒΟΙΑ0.170.16 0.170.16 0.14 0.160.13 0.01 − 23.ΚΩΣ0.16 0.170.16 0.13 0.160.13 0.010.00 − Καθαρές νουκλεοτιδικές αποστάσεις μεταξύ των πληθυσμών

4

5  Υπάρχει έντονη διαφοροποίηση ανάμεσα στους «λιμναίου» τύπου πληθυσμούς και σε αυτούς που έχουν συλλεχθεί από παράκτιες περιοχές. Οι καθαρές νουκλεοτιδικές αποστάσεις ανάμεσα σε αυτούς τους δύο τύπους πληθυσμών κυμαίνονται από 0,13 έως 0,17.  Oι «θαλάσσιου» τύπου πληθυσμοί εμφανίζουν μηδενικά ποσοστά νουκλεοτιδικών αποστάσεων εκτός από τους πληθυσμούς της Εύβοιας, Κω και Πρέβεζας που φαίνεται να διαφοροποιούνται από τους υπόλοιπους θαλάσσιους πληθυσμούς.  Οι «λιμναίου» τύπου πληθυσμοί παρουσιάζουν χαμηλή απόκλιση μεταξύ τους (0,00 - 0,07). Εντούτοις, υπάρχει διαφοροποίηση μεταξύ των λιμναίων πληθυσμών που προέρχονται από το Ιόνιο και αυτών που προέρχονται από το Αιγαίο.  Ο πληθυσμός από τον Αμβρακικό φαίνεται να διαφοροποιείται από τους υπόλοιπους λιμναίους πληθυσμούς του Ιονίου.  Τα φυλογενετικά δέντρα που κατασκευάστηκαν με τις μεθόδους Neighbor-Joining, Maximum Parsimony και Bayesian Inference είχαν σχεδόν την ίδια τοπολογία και επιβεβαιώνουν τα παραπάνω αποτελέσματα.  Η έρευνα συνεχίζεται τόσο με τη χρήση περισσότερων μοριακών δεικτών όσο και με τη συλλογή περισσότερων πληθυσμών. Ευχαριστώ για την προσοχή σας.