第2章 遗传物质的分子基础
第2节 核酸的化学结构 DNA(27%) 组蛋白(含量比较稳定,与DNA大致相等) 染色体 蛋白质(66%) 非组蛋白 RNA(6%)
碱基结构
核苷和核苷酸
磷酸二脂键
DNA分子结构和表示方法
DNA双螺旋结构 右手螺旋 反向平行(antiparallel) 内侧是扁平的盘状碱基 两条链的碱基以氢键(hydrogen bond)与互补碱基相连 A=T;C≡ G 上下碱基对相距0.34nm 每个螺旋长3.4nm,10bp,直径2nm 大沟(major groove)和小沟(minor groove)
氢 键
DNA结构模型
DNA结构示意图
碱基排列顺序的多样性 DNA分子是由A-T和C-G两种bp连接起来的,每个DNA分子一般有成千上万个bp 在每一个位置上只有4种可能: A、 T、C、G 假设DNA分子长1000bp,就可能有41000种不同的排列形式,41000种不同的分子结构 反映出来的就可能是41000种不同性质的基因。
生物体的碱基顺序是稳定的 对特定的生物体来说, DNA分子中的碱基顺序通常是保持不变,这样才能保持该遗传特性的稳定 只有在特殊的条件下,改变其碱基顺序或用碱基类似物代替某一碱基时,才出现可遗传的变异(突变)
核苷酸和脱氧核苷酸
RNA结构
tRNA结构
tRNA分子中含有稀有碱基
tRNA的三维结构
第3节 DNA复制 DNA replication
DNA复制的一般特点 原料:dNTP,互补配对原则 半保留复制 半不连续复制 需要引物 新链的延伸方向只能是5' →3'
半保留复制 semiconservative replication
复制起始点 复制起始点 replication origin,ori DNA分子的复制是在特定位置开始的,这个位点称为复制起始点。
复制子 replicon 一个复制起始点控制下复制的一段DNA 原核生物DNA只有一个复制子 真核生物每条染色体上有多个复制子
原核生物复制子
真核生物DNA多复制起始点电镜图
复制叉 replication fork 半不连续复制 先导链 随后链 冈崎片断 引物 primer
原核生物DNA复制 DNA复制所需要的酶 引物酶 primerase DNA聚合酶 DNA polymerase DNA连接酶 DNA ligase 解旋酶 helicase 拓扑异构酶
DNA复制过程 起始 延伸 终止
DNA复制小结
真核生物DNA的复制特点 细胞周期的特定时期复制 多起点复制 冈崎片断较原核生物短 核小体全保留复制 染色体端粒的复制
细胞周期的特定时期复制 原核生物在整个细胞生长过程中都可以进行DNA复制 真核生物DNA在S期复制
RNA的复制 有些病毒不含DNA,以RNA为遗传物质 RNA在RNA聚合酶作用下先合成“-”链 “-”链从“+”链模板上释放出来 “-”链作为模板再合成“+”链
端粒DNA的复制 真核生物DNA是线性的 线性DNA末端不能复制 每复制一次DNA序列就要缩短一节!
端粒酶 telomerase 端粒酶是一种核糖核蛋白,含有一个RNA分子 这个RNA分子就是合成端粒序列的模板 在体细胞中,端粒酶是没有活性的,胚胎细胞和肿瘤细胞中有端粒酶活性
第4节 RNA转录与加工 转录 transcription:以DNA为模板,在RNA聚合酶的催化下,以ATP、CTP、GTP和UTP为原料,合成RNA的过程。 转录是基因表达的中心环节
RNA分类 mRNA,messenger RNA tRNA,transfer RNA rRNA,ribosomal RNA
rRNA的类型 原核生物有3种rRNA:5S、16S、23S 真核生物有4种rRNA:5S、5.8S、18S、28S
RNA合成的一般特点 不需要引物 原料为rNTP,不是dNTP 只有一条DNA链用作模板
有关概念 模板链 template strand 非模板链 nontemplate strand 编码链 coding strand(有意义链) 非编码链 nocoding strand
原核生物RNA的合成
RNA聚合酶 在E.coli中 全酶holoenzyme α2ββ'σ σ亚基的功能是识别转录起始点 核心酶 core enzyme α2ββ' RNA链的延伸由核心酶催化
启动子 promotor DNA分子上RNA聚合酶最先结合部位 Promotor在转录起始点的上游
原核生物启动子由2个元件3个要素组成 1、-10序列(Pribnow box) 转录起始点上游-10位置,consensus sequence是TATAPuATG 2、-35序列(Sextama box) RNA聚合酶所覆盖的区域,共有序列是TTGACA,位于-35位置。 是RNA聚合酶对转录模板的初始识别位点,决定启动子的强度。 3、-10区和-35区间的距离 两个元件之间的距离却至关重要;相距17bp时,转录效率最高。
终止子 terminator 提供转录终止信号的DNA序列 内在终止子,不依赖ρ因子 依赖ρ因子的终止子
终止子的结构特征 发夹结构 polyU序列 真正起终止作用的不是DNA序列,而是转录生成的RNA结构
转录泡
RNA的合成 起始 延伸 终止和释放
转录和翻译同时进行 在原核生物中,转录、翻译以及mRNA的降解通常是同时进行的。 因为在原核生物中不存在核膜包裹的细胞核。 RNA的转录和多肽链的合成都是从5′→3′,只要mRNA的5′端合成后,即可开始翻译。 在原核生物中mRNA的寿命一般只有几分钟。 往往在3′端mRNA的转录还没有最后结束,5′端mRNA在完成多肽链的合成后,已经开始降解。
真核生物RNA的合成与加工
真核生物RNA合成的特点1: 真核生物RNA的转录在细胞核内进行 转录完成后需要运送到核外,因此寿命较长
真核生物一个mRNA分子一般只含有一个基因
真核生物RNA合成的特点3: 真核生物有几种RNA聚合酶 RNA聚合酶Ⅰ 除5S rRNA以外的所有rRNA RNA聚合酶Ⅱ mRNA前体(核不均一RNA,hnRNA) RNA聚合酶Ⅲ 5SRNA、tRNA、小核RNA
真核生物RNA合成的特点4: 真核生物RNA聚合酶不能独立转录RNA 特定的基因需要特定的转录因子
真核生物RNA合成的特点5: 真核生物启动子结构复杂 不同的聚合酶使用的启动子不同 不同的启动子含有的保守序列不同 RNA聚合酶Ⅱ 的启动子结构最复杂
真核生物启动子元件
真核生物RNA合成后的加工 rRNA转录后的甲基化
mRNA转录后的加工 加帽 加尾 当mRNA合成到30b时 在5′端加7-甲基鸟嘌呤核苷 5′-5′ 转录完成后,在特定位置切去一节,加polyA RNA末端腺苷酸转移酶 帽子和尾巴对mRNA的稳定性以及运输具有重要作用 剪接 splicing
成熟mRNA与模板DNA的比较
第5节 遗传密码和蛋白质的翻译
遗传密码字典
遗传密码的主要特征 三联体密码 密码子间无间隔,遗传密码的译读是连续的。 密码子间存在简并现象(degeneracy) 最后一个碱基具有灵活性 包含起始密码子和终止密码子 遗传密码子的通用性:除极少数情况外遗传密码从病毒到人类都是通用的
蛋白质的合成 蛋白质的生物合成称为翻译 translation mRNA携带从DNA上转录的遗传密码附着在核糖体上,由tRNA来运送氨基酸,按照mRNA上的密码顺序,连接成多肽链,并进一步加工成有生物活性的蛋白质分子。 合成蛋白质的原料是20种氨基酸 核糖体是合成蛋白质的场所 氨基酸的顺序由mRNA上的密码子决定
原核生物和真核生物核糖体比较
tRNA的二维结构
tRNA的三维结构
氨酰tRNA合成酶 aminoacyl tRNA synthetase Aminoacyladenylic acid 腺苷酸化氨基酰
翻译起始
多肽链的延伸
多肽链的终止 终止密码子 UAA UAG UGA 多肽链释放因子 E.coli RF1 RF2 真核生物 eRF 多肽链末端加H2O 多肽链离开P位 核糖体解体
多聚核糖体
思考题: 真核生物蛋白质合成的起始与原核生物有何不同?
多肽链的加工 刚刚合成的多肽链,很多不具有生物活性 不同链的缔合 共价修饰 卷曲或折叠 成为具有立体结构、有生物活性的蛋白质 结构蛋白(作为细胞的组成部分)、功能蛋白(如血红蛋白等)、酶
血红蛋白的立体结构
中心法则 central dogma