Η παρουσίαση φορτώνεται. Παρακαλείστε να περιμένετε

Η παρουσίαση φορτώνεται. Παρακαλείστε να περιμένετε

PICORNAVIRIDAE -ENTEROVIRUS ΝΙΚΟΛΑΟΣ ΣΙΑΦΑΚΑΣ ΛΕΚΤΟΡΑΣ ΔΙΑΓΝΩΣΤΙΚΗΣ ΙΟΛΟΓΙΑΣ ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΟ ΚΛΙΝΙΚΗΣ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑΣ ΠΓΝ «ΑΤΤΙΚΟΝ»

Παρόμοιες παρουσιάσεις


Παρουσίαση με θέμα: "PICORNAVIRIDAE -ENTEROVIRUS ΝΙΚΟΛΑΟΣ ΣΙΑΦΑΚΑΣ ΛΕΚΤΟΡΑΣ ΔΙΑΓΝΩΣΤΙΚΗΣ ΙΟΛΟΓΙΑΣ ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΟ ΚΛΙΝΙΚΗΣ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑΣ ΠΓΝ «ΑΤΤΙΚΟΝ»"— Μεταγράφημα παρουσίασης:

1 PICORNAVIRIDAE -ENTEROVIRUS ΝΙΚΟΛΑΟΣ ΣΙΑΦΑΚΑΣ ΛΕΚΤΟΡΑΣ ΔΙΑΓΝΩΣΤΙΚΗΣ ΙΟΛΟΓΙΑΣ ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΟ ΚΛΙΝΙΚΗΣ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑΣ ΠΓΝ «ΑΤΤΙΚΟΝ»

2 Εισαγωγή Εισαγωγή Ιστορική Αναδρομή Ιστορική Αναδρομή Ταξινόμηση Ταξινόμηση Επιδημιολογία και Κλινικές Εκδηλώσεις στον Άνθρωπο Επιδημιολογία και Κλινικές Εκδηλώσεις στον Άνθρωπο Δομή Δομή Κύκλος Ζωής στο Κύτταρο Ξενιστή Κύκλος Ζωής στο Κύτταρο Ξενιστή Παθογένεια Παθογένεια Παράγοντες Λοιμογόνου Δυναμικού Παράγοντες Λοιμογόνου Δυναμικού Εργαστηριακή Διάγνωση Εργαστηριακή Διάγνωση Θεραπεία και Πρόληψη Θεραπεία και Πρόληψη PICORNAVIRIDAE

3 ΕΙΣΑΓΩΓΗ Οικογένειες Ιών με Γενετικό Υλικό Οικογένειες Ιών με Γενετικό Υλικό RNA (+) Πολικότητας (Baltimore Group IV)

4 ΤΑΞΙΝΟΜΗΣΗ Picornaviridae: Picornaviridae: Περισσότεροι από 200 διαφορετικοί ιοί Περισσότεροι από 200 διαφορετικοί ιοί Σοβαρές ασθένειες σε άνθρωπο και ζώα Σοβαρές ασθένειες σε άνθρωπο και ζώα 12 Γένη Picornaιοί που προσβάλουν τον άνθρωπο Picorna ιοί που προσβάλουν τον άνθρωπο

5 ΚΛΙΝΙΚΑ ΣΗΜΑΝΤΙΚΟΙ PICORNA IOI Γένος Εντεροϊών – ΤΟ ΠΙΟ ΣΗΜΑΝΤΙΚΟ ΓΕΝΟΣ - Περιλαμβάνει: εντεροϊούς (ανθεκτικούς σε όξινο περιβάλλον) – Κυριότερη αιτία άσηπτης μηνιγγίτιδας, πολιομυελίτιδα, νόσος χειρών-ποδών-στόματος, αιμορραγική επιπεφυκίτιδα, μυοκαρδίτιδα, πλευροδυνία, κοινό κρυολόγημα)εντεροϊούς (ανθεκτικούς σε όξινο περιβάλλον) – Κυριότερη αιτία άσηπτης μηνιγγίτιδας, πολιομυελίτιδα, νόσος χειρών-ποδών-στόματος, αιμορραγική επιπεφυκίτιδα, μυοκαρδίτιδα, πλευροδυνία, κοινό κρυολόγημα) ρινοϊούς (ευαίσθητους σε όξινο περιβάλλον) – λοιμώξεις αναπνευστικού, κοινό κρυολόγημαρινοϊούς (ευαίσθητους σε όξινο περιβάλλον) – λοιμώξεις αναπνευστικού, κοινό κρυολόγημα Γένος Ηπατοϊών - Ιός Ηπατίτιδας A (λοιμώδης ηπατίτιδα) Γένος Καρδιοϊών - Ομάδα EMCV (encephalomyocarditis) – φλεγμονή μυοκαρδίου και εγκεφάλου, ευαίσθητος σε όξινο μυοκαρδίου και εγκεφάλου, ευαίσθητος σε όξινο περιβάλλον, δεξαμενή σε τρωκτικά περιβάλλον, δεξαμενή σε τρωκτικά Γένος Αφθοϊών - Ιός Νόσου Foot-and-Mouth σε βοοειδή, χοίρους κ.λ.π., καταστροφική κυρίως στην Αφρική καταστροφική κυρίως στην Αφρική

6 Aρχαιότερη καταγραφή Ιογενούς Λοίμωξης Αρχαία Αίγυπτος, π.Χ. Ένδειξη Πιθανής Παραλυτικής Πολιομυελίτιδας ΙΣΤΟΡΙΚΗ ΑΝΑΔΡΟΜΗ Poliovirus Poliovirus

7 ΙΣΤΟΡΙΚΗ ΑΝΑΔΡΟΜΗ FMDV FMDV Ανακάλυψη: 1898 (F. Loeffler & P. Frosch) Νόσος Foot-And-Mouth σε Χοίρους F. Loeffler

8 Poliovirus Poliovirus Ανακάλυψη: 1909 (K. Landsteiner & E. Popper). Καλλιέργεια σε κύτταρα: 1949 (J. Enders) - βάση για ανάπτυξη εμβολίου. ΙΣΤΟΡΙΚΗ ΑΝΑΔΡΟΜΗ K. Landsteiner J. Enders

9 Poliovirus (PV) Poliovirus (PV) Επιδημίες: Αυξημένη Συχνότητα τον 20ό Αιώνα → Βελτίωση Συνθηκών Υγιεινής (Διαχείριση Απορριμμάτων, Υδροδότηση, Αποχέτευση). Εισαγωγή Αδρανοποιημένου Εμβολίου (IPV - Salk): 1955 Εισαγωγή Στοματικού Εξασθενημένου Εμβολίου (OPV - Sabin): 1961 ΙΣΤΟΡΙΚΗ ΑΝΑΔΡΟΜΗ J. Salk Παιδιά με Πολιομυελίτιδα O A. Sabin εμβολιάζει παιδί με OPV

10 Coxsackievirus (CV) Coxsackievirus (CV) Ανακάλυψη: 1948 (Dalldorf) → ενοφθαλμισμός σε νεογέννητα ποντίκια κλινικού δείγματος από 2 παιδιά με παραλυτική ασθένεια από την πόλη Coxsackie της Νέας Υόρκης. Echovirus (E) Echovirus (E) Ανακάλυψη: Δεκαετία 1950 → Κόπρανα ασυμπτωματικών παιδιών προκαλούσαν κυτταροπαθογόνο δράση σε κυτταροκαλλιέργειες. Αρχικός ρόλος τους υπό αμφισβήτηση (Enteric Cytopathic Human Orphan) ΙΣΤΟΡΙΚΗ ΑΝΑΔΡΟΜΗ

11 Enterovirus (EV) , , 97, 98, , , , 113, 114 Enterovirus (EV) , , 97, 98, , , , 113, 114 Ανακάλυψη: Πιο πρόσφατα (τέλη Δεκαετίας 1960 έως σήμερα, συνεχώς νέοι ορότυποι. EV-71 → Αναδυόμενο Παθογόνο Ανακάλυψη: 1969 – Καλιφόρνια, ΗΠΑ Σημαντικές Επιδημίες: ΝΑ Ασία, Ωκεανία ΙΣΤΟΡΙΚΗ ΑΝΑΔΡΟΜΗ

12 Γένος Εντεροϊών: >100 Ορότυποι: Γένος Εντεροϊών: >100 Ορότυποι: Coxsackie A: 23 Ορότυποι Coxsackie A: 23 Ορότυποι Coxsackie B: 6 Ορότυποι Coxsackie B: 6 Ορότυποι Echo: 28 Ορότυποι Echo: 28 Ορότυποι Πολιοϊοί: 3 Ορότυποι Πολιοϊοί: 3 Ορότυποι Νεότεροι Εντεροϊοί (π.χ ): >40 Νεότεροι Εντεροϊοί (π.χ ): >40 Ρινοϊοί: 99 Ρινοϊοί: 99 Εντεροϊοί του Ανθρώπου Εντεροϊοί του Ανθρώπου Ταξινομούνται* σε 4 Είδη Ταξινομούνται* σε 4 Είδη (Human Enterovirus Species A-D) Ρινοϊοί Ρινοϊοί Ταξινομούνται* σε 3 Είδη Ταξινομούνται* σε 3 Είδη (Human Rhinovirus Species A-C) *Με βάση το γονιδίωμα των ιών ΤΑΞΙΝΟΜΗΣΗ ΕΝΤΕΡΟΪΩΝ

13 Εξάπλωση: Παγκόσμια (κυρίως καλοκαίρι και φθινόπωρο) 30-50x10 6 λοιμώξεις pa μόνο στις ΗΠΑ Εξάπλωση: Παγκόσμια (κυρίως καλοκαίρι και φθινόπωρο) 30-50x10 6 λοιμώξεις pa μόνο στις ΗΠΑ Δεύτερος πιο διαδεδομένος παθογόνος ιός Μετάδοση: Μετάδοση: Μέσω κοπρανοσταματικής οδού Μέσω κοπρανοσταματικής οδού Από άνθρωπο σε άνθρωπο Από άνθρωπο σε άνθρωπο Από μολυσμένη τροφή – νερό (πόσιμο ή θαλασσινό-πισίνας) Από μολυσμένη τροφή – νερό (πόσιμο ή θαλασσινό-πισίνας) Βιωσιμότητα στο νερό: pH 3-5: 1-3hrs, pH 10-11: mins Αντιστρ. ανάλογη Τ o C Ισχυρή: Σύνδεση με σωματίδια (π.χ. λύμματα) Μέσω αναπνευστικής οδού με μολυσμένα σταγονίδια, ή άμεσα από άνθρωπο σε άνθρωπο (Ρινοϊοί και συγκεκριμ. oρότυποι εντεροϊών, π.χ. CA-21) Μέσω αναπνευστικής οδού με μολυσμένα σταγονίδια, ή άμεσα από άνθρωπο σε άνθρωπο (Ρινοϊοί και συγκεκριμ. oρότυποι εντεροϊών, π.χ. CA-21) ΕΠΙΔΗΜΙΟΛΟΓΙΑ ΕΝΤΕΡΟΪΩΝ

14 Ασυμπτωματικές / Υποκλινικές Λοιμώξεις - Πλειοψηφεία Ασυμπτωματικές / Υποκλινικές Λοιμώξεις - Πλειοψηφεία Παράλυση / Πολιομυελίτιδα – Πολιοϊοί και άλλοι εντεροϊοί (EV-71) Παράλυση / Πολιομυελίτιδα – Πολιοϊοί και άλλοι εντεροϊοί (EV-71) Άσηπτη Ιογενής Μηνιγγίτιδα – Κυριότερη αιτία (85%) (όλοι οι εντεροϊοί, συνήθως <5 ετών) – Ανάρρωση χωρίς παρενέργειες Άσηπτη Ιογενής Μηνιγγίτιδα – Κυριότερη αιτία (85%) (όλοι οι εντεροϊοί, συνήθως <5 ετών) – Ανάρρωση χωρίς παρενέργειες Εγκεφαλίτιδα – Εντοπισμένη ή Γενικευμένη Εγκεφαλίτιδα – Εντοπισμένη ή Γενικευμένη Μη διαφοροποιούμενο εμπύρετο – όλοι οι εντεροϊοί Μη διαφοροποιούμενο εμπύρετο – όλοι οι εντεροϊοί Ερπητική Αγγειοπάθεια – Κυρίως Coxsackie A Ερπητική Αγγειοπάθεια – Κυρίως Coxsackie A Επιδημική Πλευροδυνία (Bornholm) – Κυρίως Coxsackie B Επιδημική Πλευροδυνία (Bornholm) – Κυρίως Coxsackie B Παγκρεατίτιδα – Πολλοί εντεροϊοί Παγκρεατίτιδα – Πολλοί εντεροϊοί ΚΛΙΝΙΚΕΣ ΕΚΔΗΛΩΣΕΙΣ ΕΝΤΕΡΟΪΩΝ

15 Νόσος Χειρών, Ποδών και Στόματος – Coxsackie A (προσφάτως περιστατικά από CV-A10, και CV-A16) και άλλοι εντεροϊοί (EV-71) Νόσος Χειρών, Ποδών και Στόματος – Coxsackie A (προσφάτως περιστατικά από CV-A10, και CV-A16) και άλλοι εντεροϊοί (EV-71) Αιμορραγική Επιπεφυκίτιδα – Κυρίως CV-A24, EV-70, EV-71 Αιμορραγική Επιπεφυκίτιδα – Κυρίως CV-A24, EV-70, EV-71 ΚΛΙΝΙΚΕΣ ΕΚΔΗΛΩΣΕΙΣ ΕΝΤΕΡΟΪΩΝ

16 Mυοκαρδίτιδα – Coxsackie Β (κυριότερη αιτία) και άλλοι εντεροϊοί – Νεογέννητα → μεγάλη θνησιμότητα Mυοκαρδίτιδα – Coxsackie Β (κυριότερη αιτία) και άλλοι εντεροϊοί – Νεογέννητα → μεγάλη θνησιμότητα Αναπνευστικές Λοιμώξεις – Πολλοί εντεροϊοί → κοινό κρυολόγημα Αναπνευστικές Λοιμώξεις – Πολλοί εντεροϊοί → κοινό κρυολόγημα ΚΛΙΝΙΚΕΣ ΕΚΔΗΛΩΣΕΙΣ ΕΝΤΕΡΟΪΩΝ

17 Νεογνικές Λοιμώξεις – Coxsackie Β και echo ιοί – Νεογέννητα → μεγάλη θνησιμότητα. Περιγεννητική μετάδοση → ήπιο εμπύρετο – πολυσυστημική ανεπάρκεια & θάνατο Νεογνικές Λοιμώξεις – Coxsackie Β και echo ιοί – Νεογέννητα → μεγάλη θνησιμότητα. Περιγεννητική μετάδοση → ήπιο εμπύρετο – πολυσυστημική ανεπάρκεια & θάνατο Χρόνιες Λοιμώξεις (?) Χρόνιες Λοιμώξεις (?) Σύνδρομο Χρονίας Κοπώσεως – Coxsackie B Σύνδρομο Χρονίας Κοπώσεως – Coxsackie B Τύπου 1 Διαβήτης – Coxsackie B Τύπου 1 Διαβήτης – Coxsackie B

18 ΚΛΙΝΙΚΕΣ ΕΚΔΗΛΩΣΕΙΣ ΡΙΝΟΪΩΝ Λοιμώξεις ανώτερου αναπνευστικού/Κοινό κρυολόγημα – ρινική συμφόρηση, βήχας, φτάρνισμα, πονόλαιμος, μυαλγίες, κόπωση, πυρετός. Λοιμώξεις ανώτερου αναπνευστικού/Κοινό κρυολόγημα – ρινική συμφόρηση, βήχας, φτάρνισμα, πονόλαιμος, μυαλγίες, κόπωση, πυρετός. Άσθμα – Σημαντικός ρόλος ICAM-1 (Intercellular Adhesion Molecule-1) στο Άσθμα – μόριο που χρησιμοποιείται ως υποδοχέας για την είσοδο των ρινοϊών στον ενδοκυττάριο χώρο Άσθμα – Σημαντικός ρόλος ICAM-1 (Intercellular Adhesion Molecule-1) στο Άσθμα – μόριο που χρησιμοποιείται ως υποδοχέας για την είσοδο των ρινοϊών στον ενδοκυττάριο χώρο

19 Μη Ελυτροφόροι Ιοί Εικοσαεδρικής Συμμετρίας Διαμέτρου 28-34nm («Pico») Μη Ελυτροφόροι Ιοί Εικοσαεδρικής Συμμετρίας Διαμέτρου 28-34nm («Pico») Γενετικό Υλικό: ss (+) RNA, 4 Δομικά – 7 Λειτουργικά Γονίδια, 5΄- και 3΄- Μη Κωδική Περιοχή Γενετικό Υλικό: ss (+) RNA, 4 Δομικά – 7 Λειτουργικά Γονίδια, 5΄- και 3΄- Μη Κωδική Περιοχή ΔΟΜΗ PICORNA IΩΝ

20 ΚΥΚΛΟΣ ΖΩΗΣ PICORNA ΙΩΝ ΣΤΟ ΚΥΤΤΑΡΟ-ΞΕΝΙΣΤΗ 1. Προσκόλληση στον κυτταρικό υποδοχέα 3. Μετάφραση ιϊκών πρωτεϊνών (γένωμα RNA +πολικότητας) & 3. Παραγωγή πολυπρωτεΐνης 4. Αυτοκαταλυτική πρωτεόλυση – παραγωγή ιϊκών πρωτεϊνών 5. Παραγωγή αρν. πολικότητας αντιγράφου γενώματος – μήτρα για θετ. Πολικότητας αντίγραφα 6. Σχηματισμός ωρίμων ιϊκών σωματιδίων 7. Απελευθέρωση (λύση κυττάρου) ΠΥΡΗΝΑΣ ΚΥΤΤΑΡΟΠΛΑΣΜΑ ΚΥΣΤΙΔΙΟ 2. Είσοδος στον ενδοκυττάριο χώρο (Σχηματισμός Σωματιδίων Α και απελευθέρωση γενώματος στο κυτταρόπλασμα)

21 ΠΑΘΟΓΕΝΕΙΑ ΕΝΤΕΡΟΪΩΝ Περίοδος Επώασης: 7-14 ημέρες Περίοδος Επώασης: 7-14 ημέρες Είσοδος στον οργανισμό: Κοπρανοστοματική οδός Είσοδος στον οργανισμό: Κοπρανοστοματική οδός Μετά την κατάποση: 1) Πολλαπλασιασμός στο στοματοφαρυγγικό και εντερικό βλεννογόνο (επιβίωση στο όξινο στομαχ. περιβάλλον) Μετά την κατάποση: 1) Πολλαπλασιασμός στο στοματοφαρυγγικό και εντερικό βλεννογόνο (επιβίωση στο όξινο στομαχ. περιβάλλον) 2) Προσβάλλεται λεμφικό σύστημα (αμυγδαλές, σωμάτια Peyer ειλεού) 2) Προσβάλλεται λεμφικό σύστημα (αμυγδαλές, σωμάτια Peyer ειλεού) 3) Παροδική ιαιμία 4) Μειοψηφεία περιπτώσεων: προσβολή ΚΝΣ ή άλλου οργάνου-στόχου

22 ΠΑΘΟΓΕΝΕΙΑ ΕΝΤΕΡΟΪΏΝ Παράδειγμα: Κύκλος Ζωής Πολιοϊών στον Ξενιστή

23 ΠΑΘΟΓΕΝΕΙΑ ΡΙΝΟΪΏΝ Περίοδος Επώασης: 20 ώρες-5 ημέρες Περίοδος Επώασης: 20 ώρες-5 ημέρες Είσοδος στον οργανισμό: Ανώτερη Αναπνευστική Οδός μέσω Σταγονιδίων Είσοδος στον οργανισμό: Ανώτερη Αναπνευστική Οδός μέσω Σταγονιδίων Μετά την είσοδο: 1) Προσβολή επιθηλιακών κυττάρων που έχουν στην επιφάνειά τους τον υποδοχέα ICAM-1 Μετά την είσοδο: 1) Προσβολή επιθηλιακών κυττάρων που έχουν στην επιφάνειά τους τον υποδοχέα ICAM-1 2) Έκκριση Χημειοκινών-Κυτταροκινών από προσβεβλημένα κύτταρα

24 ΠΑΡΑΓΟΝΤΕΣ ΛΟΙΜΟΓΟΝΟΥ ΔΥΝΑΜΙΚΟΥ Περιοχή Εσωτερικής Σύνδεσης Ριβοσωμάτων (IRES - Internal Ribosome Entry Site): Στην 5΄-UTR, ανεξάρτητη σχηματισμού cap έναρξη μετάφρασης (εις βάρος μετάφρασης κυτταρρικών πρωτεϊνών) Περιοχή Εσωτερικής Σύνδεσης Ριβοσωμάτων (IRES - Internal Ribosome Entry Site): Στην 5΄-UTR, ανεξάρτητη σχηματισμού cap έναρξη μετάφρασης (εις βάρος μετάφρασης κυτταρρικών πρωτεϊνών) Έντονη 2γής δομή που αναγνωρίζεται από τα ριβοσώματα του κυττάρου (4 Διαφορετικοί Τύποι στους Picorna Ιούς) Ιϊκές πρωτεΐνες: Ιϊκές πρωτεΐνες: 3D → RNA-εξαρτώμενη RNA πολυμεράση (Μόνο RNA ιοί και HBV) 3D → RNA-εξαρτώμενη RNA πολυμεράση (Μόνο RNA ιοί και HBV) VP1 → Σύνδεση με υποδοχέα στην επιφάνεια κυττάρου-ξενιστή VP1 → Σύνδεση με υποδοχέα στην επιφάνεια κυττάρου-ξενιστή 2Α → Ιϊκή πρωτεάση, κλείνει κυτταρική πρωτεϊνοσύνθεση 2Α → Ιϊκή πρωτεάση, κλείνει κυτταρική πρωτεϊνοσύνθεση 2Β → Αυξάνει διαπερατότητα κυτταροπλασματικής μεμβράνης 2Β → Αυξάνει διαπερατότητα κυτταροπλασματικής μεμβράνης 3Α → Αναστέλλει ενδοκυττάριες μεταφορές ουσιών 3Α → Αναστέλλει ενδοκυττάριες μεταφορές ουσιών 3C → Ιϊκή πρωτεάση, αναστέλλει μεταγραφή κυττάρου 3C → Ιϊκή πρωτεάση, αναστέλλει μεταγραφή κυττάρου

25 ΠΑΡΑΓΟΝΤΕΣ ΛΟΙΜΟΓΟΝΟΥ ΔΥΝΑΜΙΚΟΥ

26 Μεταλλάξεις (Υψηλός ρυθμός λαθών RNA πολυμεράσης) Μεταλλάξεις (Υψηλός ρυθμός λαθών RNA πολυμεράσης) ΓενετικοίΑνασυνδυασμοί ΓενετικοίΑνασυνδυασμοί Quasispecies Quasispecies Φυσική Επιλογή: Επιβίωση του ΚΑΛΥΤΕΡΑ ΠΡΟΣΑΡΜΟΣΜΕΝΟΥ – Δρα στο υπόβαθρο της Γενετικής Ποικιλομορφίας (Πιθανολογική Διδικασία) Φυσική Επιλογή: Επιβίωση του ΚΑΛΥΤΕΡΑ ΠΡΟΣΑΡΜΟΣΜΕΝΟΥ – Δρα στο υπόβαθρο της Γενετικής Ποικιλομορφίας (Πιθανολογική Διδικασία) Εξελικτική Πίεση: (ανθρωπογενείς αλλαγές, ανοσοποιητικό σύστημα, εμβόλια, αντιμικροβιακές ουσίες, κ.λ.π.) → Παράγοντας που κατευθύνει τη Φυσική Επιλογή Εξελικτική Πίεση: (ανθρωπογενείς αλλαγές, ανοσοποιητικό σύστημα, εμβόλια, αντιμικροβιακές ουσίες, κ.λ.π.) → Παράγοντας που κατευθύνει τη Φυσική Επιλογή Γενετική Ποικιλομορφία

27 ΓΕΝΕΤΙΚΟΣΑΝΑΣΥΝΔΥΑΣΜΟΣ ΜΕΤΑΛΛΑΞΕΙΣ ΦΥΣΙΚΗ ΕΠΙΛΟΓΗ ΓΕΝΕΤΙΚΗ ΠΟΙΚΙΛΟΜΟΡΦΙΑ ΕΞΕΛΙΚΤΙΚΗ ΠΙΕΣΗ ΚΑΛΥΤΕΡΑ ΠΡΟΣΑΡΜΟΣΜΕΝΑ ΣΤΕΛΕΧΗ - ΕΞΕΛΙΞΗ ΠΑΡΑΓΟΝΤΕΣ ΛΟΙΜΟΓΟΝΟΥ ΔΥΝΑΜΙΚΟΥ

28 Quasispecies: Ετερόμορφος γενετικά πληθυσμός του ιδίου στελέχους, δηλ. Quasispecies: Ετερόμορφος γενετικά πληθυσμός του ιδίου στελέχους, δηλ. Εξαιρετική Γενετική Ποικιλομορφία (RNA ιοί: HCV, Picornaviridae) Τι σημαίνει αυτό; TAXEIA ΕΞΕΛΙΞΗ ΕΤΟΙΜΟ ΕΚ ΤΩΝ ΠΡΟΤΕΡΩΝ ΤΟ ΥΠΟΒΑΘΡΟ ΣΤΟ ΟΠΟΊΟ ΘΑ ΔΡΑΣΕΙ Η ΦΥΣΙΚΗ ΕΠΙΛΟΓΗ ΕΤΟΙΜΟ ΤΟ «ΟΠΛΟΣΤΑΣΙΟ» ΤΩΝ ΙΩΝ ΠΡΙΝ «ΚΗΡΥΧΘΕΙ Ο ΠΟΛΕΜΟΣ» ΠΑΡΑΓΟΝΤΕΣ ΛΟΙΜΟΓΟΝΟΥ ΔΥΝΑΜΙΚΟΥ Quasispecies εντός του ιδίου ασθενή

29 ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΑΓΝΩΣΗ Είδος Κλινικού Δείγματος: Είδος Κλινικού Δείγματος: Κόπρανα → Διερεύνηση Εμπυρέτου και Λοίμωξης ΚΝΣ Κόπρανα → Διερεύνηση Εμπυρέτου και Λοίμωξης ΚΝΣ ΕΝΥ → Διερεύνηση Λοίμωξης ΚΝΣ ΕΝΥ → Διερεύνηση Λοίμωξης ΚΝΣ Συνήθως φυσιολογική γλυκόζη, ελαφριά αύξηση πρωτεΐνης (<100mg/dl), <100 κύτταρα/μl, Συνήθως φυσιολογική γλυκόζη, ελαφριά αύξηση πρωτεΐνης (<100mg/dl), <100 κύτταρα/μl, Περικαρδιακό Υγρό Περικαρδιακό Υγρό Αίμα – Ορός (Σπανιότερη Ανίχνευση) → Διερεύνηση Κάθε Τύπου Πιθανής Λοίμωξης Αίμα – Ορός (Σπανιότερη Ανίχνευση) → Διερεύνηση Κάθε Τύπου Πιθανής Λοίμωξης Φαρυγγικό – Ρινοφαρυγγικό Επίχρισμα → Διερεύνηση Λοίμωξης Αναπνευστικού Φαρυγγικό – Ρινοφαρυγγικό Επίχρισμα → Διερεύνηση Λοίμωξης Αναπνευστικού

30 Μέθοδος Ανίχνευσης: Μέθοδος Ανίχνευσης: Κυτταροκαλλιέργειες → Μέθοδος Αναφοράς (?) Κυτταροκαλλιέργειες → Μέθοδος Αναφοράς (?) Κυτταροπαθογόνος δράση εντεροϊών Μειωμένη Ευαισθησία Μειωμένη Ειδικότητα Δυσκολία Χρονοβόρες (4-14 Ημέρες) ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΑΓΝΩΣΗ

31 Μέθοδος Ανίχνευσης: Μέθοδος Ανίχνευσης: Ορολογική Διάγνωση → ΙgG, IgM Ορολογική Διάγνωση → ΙgG, IgM «Παράθυρο» Μειωμένη Ειδικότητα >100 Ορότυποι Συνεχώς Νέα Στελέχη - Ορότυποι ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΑΓΝΩΣΗ

32 Μέθοδος Ανίχνευσης: Μέθοδος Ανίχνευσης: Οροεξουδετέρωση Οροεξουδετέρωση Χρειάζονται Κυτταροκαλλιέργειες >100 Ορότυποι Συνεχώς Νέα Στελέχη - Ορότυποι

33 Μέθοδος Ανίχνευσης: Μέθοδος Ανίχνευσης: Μοριακή Απ’ Ευθείας στο Κλινικό Δείγμα → Reverse Transcription (RT) PCR, Real Time RT-PCR, Nested RT-PCR Μοριακή Απ’ Ευθείας στο Κλινικό Δείγμα → Reverse Transcription (RT) PCR, Real Time RT-PCR, Nested RT-PCR Αυξημένη Ευαισθησία Αυξημένη Ειδικότητα Μειωμένος Χρόνος Για Όλους και Νέους Ορότυπους Μέθοδος Επιλογής ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΑΓΝΩΣΗ

34 Ποια η Σημασία της Περαιτέρω Οροτυπικής και Γονοτυπικής Ταυτοποίησης? Επιδημιολογία Επιδημιολογία Ανίχνευση/Χαρακτηρισμός Πιο Παθογόνων Στελεχών Ανίχνευση/Χαρακτηρισμός Πιο Παθογόνων Στελεχών Ανίχνευση/Χαρακτηρισμός Αναδυομένων Στελεχών Ανίχνευση/Χαρακτηρισμός Αναδυομένων Στελεχών ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΑΓΝΩΣΗ

35 Μέθοδος Ταυτοποίησης; Μέθοδος Ταυτοποίησης; RNA Ιοί Μεταλλάξεις Γενετικοί Ανασυνδυασμοί Quasispecies Γενετική Ποικιλομορφία Δύσκολη Ταυτοποίηση Πολλοί Ορότυποι Αμέτρητα Στελέχη ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΑΓΝΩΣΗ

36 Οροτυπική Ταυτοποίηση Θετικών Δειγμάτων με: Οροτυπική Ταυτοποίηση Θετικών Δειγμάτων με: 1) RT-PCR με Γονίδιο-Στόχο 1D → VP1 Καψιδική Πρωτεΐνη 1) RT-PCR με Γονίδιο-Στόχο 1D → VP1 Καψιδική Πρωτεΐνη Η αντιγονική ταυτότητα που προσδιορίζει τον ορότυπο βρίσκεται κυρίως στη VP1 καψιδική πρωτεΐνη Γονίδιο – Στόχος Εκκινητικών Μορίων ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΑΓΝΩΣΗ

37 Οροτυπική Ταυτοποίηση Θετικών Δειγμάτων με: Οροτυπική Ταυτοποίηση Θετικών Δειγμάτων με: 2) Sequencing του Γονιδίου για τη VP1 2) Sequencing του Γονιδίου για τη VP1 3) Ανάλυση της Αλληλουχίας με BLAST 3) Ανάλυση της Αλληλουχίας με BLAST Κριτήριο Ταυτοποίησης: Ομοιότητα >75% ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΑΓΝΩΣΗ

38 Τι ακολουθεί μετά; ΒΙΟΠΛΗΡΟΦΟΡΙΚΗ Τι ακολουθεί μετά; ΒΙΟΠΛΗΡΟΦΟΡΙΚΗ Σύγκριση ανιχνευθέντων τμημάτων γενετικού υλικού με Συγγενείς Αλληλουχίες με το κατάλληλο λογισμικό (π.χ. Clustal) και κατασκευή φυλογενετικών δένδρων που δείχνουν τις γενετικές αποκλίσεις των νέων παθογόνων στελεχών από τα ήδη γνωστά: Σύγκριση ανιχνευθέντων τμημάτων γενετικού υλικού με Συγγενείς Αλληλουχίες με το κατάλληλο λογισμικό (π.χ. Clustal) και κατασκευή φυλογενετικών δένδρων που δείχνουν τις γενετικές αποκλίσεις των νέων παθογόνων στελεχών από τα ήδη γνωστά: ClustalW TreeView Δενδρόγραμμα

39 Τι ακολουθεί μετά; Τι ακολουθεί μετά; Ανίχνευση με ποικίλες εφαρμογές RT-PCR και χαρακτηρισμός με βιοπληροφορική Μεταλλάξεων και Γενετικού Ανασυνδυασμού σε Όλο το Γένωμα που οδηγούν σε Νέα Ποικιλόμορφα Στελέχη με ισχυρό Λοιμογόνο Δυναμικό (π.χ. λογισμικό SimPlot): Ανίχνευση με ποικίλες εφαρμογές RT-PCR και χαρακτηρισμός με βιοπληροφορική Μεταλλάξεων και Γενετικού Ανασυνδυασμού σε Όλο το Γένωμα που οδηγούν σε Νέα Ποικιλόμορφα Στελέχη με ισχυρό Λοιμογόνο Δυναμικό (π.χ. λογισμικό SimPlot): ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΑΚΗ ΔΙΑΓΝΩΣΗ

40 1 η Βάση Κωδικονίου 2 η Βάση Κωδικονίου 3 η Βάση Κωδικονίου ΠΡΩΤΕΪΝΗ ΠΟΛΥΠΕΠΤΙΔΙΟ ΑΛΦΑΒΗΤΟ ΠΡΟΤΑΣΗ ΚΕΦΑΛΑΙΟ ΒΙΒΛΙΟ ΚΑΘΕ ΣΤΕΛΕΧΟΣ ΕΙΝΑΙ ΕΝΑ ΒΙΒΛΙΟ ΜΕ ΠΛΗΡΟΦΟΡΙΕΣ ΠΟΥ ΤΙΣ ΔΙΑΒΑΖΟΥΜΕ ΜΕ ΤΙΣ ΜΟΡΙΑΚΕΣ ΜΕΘΟΔΟΥΣ ΕΝΤΕΡΟΪΟΣ

41 ΘΕΡΑΠΕΙΑ Ουσιαστικά δεν υπάρχει! Ουσιαστικά δεν υπάρχει! Pleconaril: Μόνο για λοιμώξεις αναπνευστικού από εντεροϊούς και ρινοϊούς, προσδένεται στη VP1 και εμποδίζει προσκόλληση ιού σε κυτταρικό υποδοχέα Pleconaril: Μόνο για λοιμώξεις αναπνευστικού από εντεροϊούς και ρινοϊούς, προσδένεται στη VP1 και εμποδίζει προσκόλληση ιού σε κυτταρικό υποδοχέα IVIG: Σε νεογνά, ή σοβαρές λοιμώξεις σε ανοσοκατεσταλμένους IVIG: Σε νεογνά, ή σοβαρές λοιμώξεις σε ανοσοκατεσταλμένους HNIG: μπορεί να αποτρέψει επιδημικές εξάρσεις σε νεογνά με καλά αποτελέσματα HNIG: μπορεί να αποτρέψει επιδημικές εξάρσεις σε νεογνά με καλά αποτελέσματα

42 ΠΡΟΛΗΨΗ Πλύσιμο Χεριών! Πλύσιμο Χεριών! Εμβόλιο: Μόνο κατά των πολιοϊών – Μεγάλος αριθμός οροτύπων εντεροϊών & ρινοϊών → αδυναμία σχεδιασμού γενικού εμβολίου για όλους Εμβόλιο: Μόνο κατά των πολιοϊών – Μεγάλος αριθμός οροτύπων εντεροϊών & ρινοϊών → αδυναμία σχεδιασμού γενικού εμβολίου για όλουςΟΜΩΣ

43 ΠΡΟΛΗΨΗ Ev-71: Αναδυόμενο Επικίνδυνο Παθογόνο Νόσος Χειρών, Ποδών και Στόματος Νόσος Χειρών, Ποδών και Στόματος Αιμορραγική Επιπεφυκίτιδα Αιμορραγική Επιπεφυκίτιδα Μηνιγγίτιδα Μηνιγγίτιδα Εγκεφαλίτιδα Εγκεφαλίτιδα Παράλυση Παράλυση Νευρολογικές και καρδιοαναπνευστικές επιπλοκές → 10-30% περιστατικών HFMD (Σημαντική Θνησιμότητα) Συχνότερη επίπτωση σε παιδιά <5 ετών, 2-5 ημέρες μετά την έναρξη της ασθένειας Σοβαρές Επιδημίες στην Α/ΝΑ Ασία και Ωκεανία

44 ΠΡΟΛΗΨΗ Ev-71: Αναδυόμενο Επικίνδυνο Παθογόνο Υποψήφιο για Εμβόλιο Υποψήφιο για Εμβόλιο Έως σήμερα, δοκιμές σε πειραματόζωα με: Έως σήμερα, δοκιμές σε πειραματόζωα με: «Ζωντανό», εξασθενημένο ιό «Ζωντανό», εξασθενημένο ιό Αδρανοποιημένο ιό Αδρανοποιημένο ιό Ιϊκές πρωτεΐνες (γενετική μηχανική) Ιϊκές πρωτεΐνες (γενετική μηχανική) DNA εμβόλιο DNA εμβόλιο Απουσία Κλινικών Μελετών έως Σήμερα

45 ΠΡΟΛΗΨΗ Ρινοϊοί VP4 Καψιδική Πρωτεΐνη: Διατηρείται φυλογενετικά μεταξύ των διαφορετικών οροτύπων, ΣΥΝΕΠΩΣ: VP4 Καψιδική Πρωτεΐνη: Διατηρείται φυλογενετικά μεταξύ των διαφορετικών οροτύπων, ΣΥΝΕΠΩΣ: ΣΤΟΧΟΣ ΓΙΑ ΠΙΘΑΝΟ ΕΜΒΟΛΙΟ?

46 ΠΡΟΛΗΨΗ Εμβόλιο-Πολιομυελίτιδα: Εμβόλιο-Πολιομυελίτιδα: Ενδομυϊκό (Intramuscular Poliovirus Vaccine – IPV) / Salk Ενδομυϊκό (Intramuscular Poliovirus Vaccine – IPV) / Salk Ιοί και των τριών οροτύπων αδρανοποιημένοι με φορμαλίνη Ιοί και των τριών οροτύπων αδρανοποιημένοι με φορμαλίνη Πρoκαλεί την παραγωγή αντισωμάτων στον ορό του ασθενή μόνο – δεν προκαλεί τοπική ανοσία στο έντερο → δεν αποτρέπει τοπική λοίμωξη του εντέρου Πρoκαλεί την παραγωγή αντισωμάτων στον ορό του ασθενή μόνο – δεν προκαλεί τοπική ανοσία στο έντερο → δεν αποτρέπει τοπική λοίμωξη του εντέρου Όμως, αποτρέπει την παραλυτική πολιομυελίτιδα, καθώς η ιαιμία αποτελεί απαραίτητη προϋπόθεση για την ασθένεια Όμως, αποτρέπει την παραλυτική πολιομυελίτιδα, καθώς η ιαιμία αποτελεί απαραίτητη προϋπόθεση για την ασθένεια J. Salk

47 ΠΡΟΛΗΨΗ Εμβόλιο-Πολιομυελίτιδα: Εμβόλιο-Πολιομυελίτιδα: Στοματικό (Oral Poliovirus Vaccine – OPV) / Sabin Στοματικό (Oral Poliovirus Vaccine – OPV) / Sabin Αποτελείται από εξασθενημένους ιούς και των 3 οροτύπων Αποτελείται από εξασθενημένους ιούς και των 3 οροτύπων Προκαλεί συστημική και τοπική ανοσία στο έντερο με την ενεργοποίηση παραγωγής IgA αντισωμάτων Προκαλεί συστημική και τοπική ανοσία στο έντερο με την ενεργοποίηση παραγωγής IgA αντισωμάτωνΟΜΩΣ Σπάνια αναστροφή στελεχών εμβολίου OPV σε παθογόνα μέσω τυχαίων μεταλλάξεων και ανασυνδυασμού, προκαλώντας πολιομυελίτιδα (1 σε δόσεις) Σπάνια αναστροφή στελεχών εμβολίου OPV σε παθογόνα μέσω τυχαίων μεταλλάξεων και ανασυνδυασμού, προκαλώντας πολιομυελίτιδα (1 σε δόσεις)

48 ΠΡΟΛΗΨΗ Εμβόλιο-Πολιομυελίτιδα: Εμβόλιο-Πολιομυελίτιδα: VAPP (Vaccine Associated Paralytic Poliomyelitis) VAPP (Vaccine Associated Paralytic Poliomyelitis) Σε περιοχές χαμηλής κάλυψης από OPV Σε περιοχές χαμηλής κάλυψης από OPV Πιο συχνή σε ενήλικες και σε ανοσοκατεσταλμένα παιδιά Πιο συχνή σε ενήλικες και σε ανοσοκατεσταλμένα παιδιά Επιδημίες προκαλούνται από γενετικώς αλλοιωμένα στελέχη που αποκτούν την ικανότητα να κυκλοφορήσουν στους πληθυσμούς (cVDPV – Circulating Vaccined Derived Paralytic Poliomyelitis) Επιδημίες προκαλούνται από γενετικώς αλλοιωμένα στελέχη που αποκτούν την ικανότητα να κυκλοφορήσουν στους πληθυσμούς (cVDPV – Circulating Vaccined Derived Paralytic Poliomyelitis) Μερικές πρόσφατες επιδημίες VAPP: Μερικές πρόσφατες επιδημίες VAPP: Ισπανιόλα ( ) Ισπανιόλα ( ) Φιλιππίνες (2001) Φιλιππίνες (2001) Μαδαγασκάρη ( ) Μαδαγασκάρη ( ) Αϊτή (2002) Αϊτή (2002) Κίνα (2006) Κίνα (2006) Ιράν ( ) Ιράν ( )


Κατέβασμα ppt "PICORNAVIRIDAE -ENTEROVIRUS ΝΙΚΟΛΑΟΣ ΣΙΑΦΑΚΑΣ ΛΕΚΤΟΡΑΣ ΔΙΑΓΝΩΣΤΙΚΗΣ ΙΟΛΟΓΙΑΣ ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΟ ΚΛΙΝΙΚΗΣ ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑΣ ΠΓΝ «ΑΤΤΙΚΟΝ»"

Παρόμοιες παρουσιάσεις


Διαφημίσεις Google