Vasily M. Studitsky, et.al. Tibs 29:127-136 (2004) Ζέρβας Χριστόδουλος Τριανταφύλλου Αλέξανδρος- Σταύρος.

Παρουσίαση με θέμα: "Vasily M. Studitsky, et.al. Tibs 29:127-136 (2004) Ζέρβας Χριστόδουλος Τριανταφύλλου Αλέξανδρος- Σταύρος."— Μεταγράφημα παρουσίασης:

1 Vasily M. Studitsky, et.al. Tibs 29:127-136 (2004) Ζέρβας Χριστόδουλος Τριανταφύλλου Αλέξανδρος- Σταύρος

2

3

4 Nucleosome mobilization (RNA pol I, III) H2A-H2B dimer depletion (RNA pol II)

5 Bulging Model Twisting Model

6  Απομάκρυνση νουκλεοσωμάτων από DNA και επαναπρόσληψή τους στο DNA  Μετακίνηση στο DNA λόγω της RNA πολυμεράσης (πιο πιθανή θεωρία)

7 RNA pol 25 bp βάσεων -> επιβράδυνση Άφιξη στη δυάδα -> μεταφορά νουκλεοσώματος

8  Μετακίνηση νουκλεοσώματος 20-900 bp αντίθετα με την κίνηση της RNA pol  Σταθερό νουκλεόσωμα μέχρι η RNA pol να μεταγράψει 50-60 bp, δίνοντας αρκετό μήκος DNA για το σχηματισμό της θηλιάς  Οκταμερές παραμένει στο DNA με αποτέλεσμα το σχηματισμό του εξογκώματος (bulge) κι έτσι η RNA pol συνεχίζει τη μεταγραφή  Υποπερίπτωση: δομή arrest RNA pol

9

10 Κατά τη διαδικασία αυτή δεν χάνονται ιστόνες

11  Υπερελίκωση του DNA καθώς απομακρύνεται από το νουκλεόσωμα (η διέλευση της RNA pol προκαλεί δομικές αλλαγές σε όλη τη γενετική περιοχή)  RNA pol αυτή καθ’ αυτή  Σταδιακή απελευθέρωση του DNA από το νουκλεόσωμα

12 Συντελείται απο RNA pol II

13 (1)2->3->4->7’ (2) 2->4->7’

14  RNA pol II > RNA pol III, I  Μέγεθος εμποδίου εξαρτάται από τις γενικές ιδιότητες του συμπλέγματος της μεταγραφής  Τρόπος ρύθμισης γονιδιακής έκφρασης  Παραδείγματα: πρωτοογκογονίδια (c-myc, c-fos), HIV-1 polyprotein, hsp70

15 Το πρώτο νουκλεόσωμα της μεταγραφικής περιοχής του γονιδίου hsp70 αφαιρείται κατά την έναρξη της μεταγραφής του

16  Πχ FACT complex  Προσελκύει RNA Pol II  Αυξάνει την ικανότητα της RNA pol II να απομακρύνει το διμερές H2A-H2B από το οκταμερές

17  Acute myeloid leukemia  HIV infection

18  http://people.rit.edu/japfaa/nucleosome.jpg http://people.rit.edu/japfaa/nucleosome.jpg  http://edoc.hu-berlin.de/dissertationen/geissenhoener-antje- 2004-07-13/HTML/Geissenhoener_html_3269dbec.jpg http://edoc.hu-berlin.de/dissertationen/geissenhoener-antje- 2004-07-13/HTML/Geissenhoener_html_3269dbec.jpg  http://www.nature.com/nrm/journal/v6/n1/images/nrm1551- f1.jpg http://www.nature.com/nrm/journal/v6/n1/images/nrm1551- f1.jpg  http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c0/ ARN_pol_II_en_accion.jpg/300px-ARN_pol_II_en_accion.jpg http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/c/c0/ ARN_pol_II_en_accion.jpg/300px-ARN_pol_II_en_accion.jpg  http://www.iliaoikonomia.gr/files/news/15354_ph1.jpg http://www.iliaoikonomia.gr/files/news/15354_ph1.jpg  http://www.abcam.com/cms/displayImage.cfm?intImageID=422 8 http://www.abcam.com/cms/displayImage.cfm?intImageID=422 8  http://jcs.biologists.org/content/114/14/2561/F5.large.jpg http://jcs.biologists.org/content/114/14/2561/F5.large.jpg  http://www.nature.com/nsmb/journal/v20/n9/images/nsmb.26 48-F3.jpg http://www.nature.com/nsmb/journal/v20/n9/images/nsmb.26 48-F3.jpg  http://www.nature.com/nrg/journal/v11/n6/images/nrg2781- f5.jpg http://www.nature.com/nrg/journal/v11/n6/images/nrg2781- f5.jpg  http://origin-ars.els-cdn.com/content/image/1-s2.0- S0167478103002811-gr1.gif http://origin-ars.els-cdn.com/content/image/1-s2.0- S0167478103002811-gr1.gif