Η παρουσίαση φορτώνεται. Παρακαλείστε να περιμένετε

Η παρουσίαση φορτώνεται. Παρακαλείστε να περιμένετε

1 ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑ ΚΑΙ ΥΓΙΕΙΝΗ ΤΡΟΦΙΜΩΝ ΠΑΡΟΥΣΙΑΣΗ 2 Η ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΤΙΚΑ ΤΩΝ ΜΙΚΡΟΒΙΩΝ – ΒΑΚΤΗΡΙΑ – ΚΑΤΗΓΟΡΙΟΠΟΙΗΣΗ ΤΩΝ ΒΑΚΤΗΡΙΩΝ - ΤΕΧΝΙΚΕΣ.

Παρόμοιες παρουσιάσεις


Παρουσίαση με θέμα: "1 ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑ ΚΑΙ ΥΓΙΕΙΝΗ ΤΡΟΦΙΜΩΝ ΠΑΡΟΥΣΙΑΣΗ 2 Η ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΤΙΚΑ ΤΩΝ ΜΙΚΡΟΒΙΩΝ – ΒΑΚΤΗΡΙΑ – ΚΑΤΗΓΟΡΙΟΠΟΙΗΣΗ ΤΩΝ ΒΑΚΤΗΡΙΩΝ - ΤΕΧΝΙΚΕΣ."— Μεταγράφημα παρουσίασης:

1 1 ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑ ΚΑΙ ΥΓΙΕΙΝΗ ΤΡΟΦΙΜΩΝ ΠΑΡΟΥΣΙΑΣΗ 2 Η ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΤΙΚΑ ΤΩΝ ΜΙΚΡΟΒΙΩΝ – ΒΑΚΤΗΡΙΑ – ΚΑΤΗΓΟΡΙΟΠΟΙΗΣΗ ΤΩΝ ΒΑΚΤΗΡΙΩΝ - ΤΕΧΝΙΚΕΣ

2 2 ΛΕΞΕΙΣ ΚΛΕΙΔΙΑ (Key Words)

3 3 PROKARYOTES BACTERIAARCHAEA ΕΥΚΑΡΥΩΤΕΣ ΕΥΚΑΡΥΩΤΕΣ

4 4

5 5 ΠΡΟΚΑΡΥΩΤΕΣ (Βακτήρια) Ευβακτήρια ή «Αληθή» βακτήρια – Ανθρώπινα παθογόνα – Κλινικά ή περιβαλλοντικά – Ένα βασίλειο –Πεπτιδογλυκάνη (μουρείνη): peptidoglycan (murein) –Mουραμικό οξύ (muramic acid) Αρχαία – Περιβαλλοντικοί μόνο οργανισμοί – Δεύτερο βασίλειο; –Ψευδομουρείνη (pseudomurein) –Δεν φέρουν μουραμικό οξύ (no muramic acid) –Διαφορές αλληλουχίας στο 16S rRNA

6 6 N-Acetyl-Glucosamine (NAG), N-Acetyl-Muramic acid (NAM), N-Acetyl-Talosamic acid (NAT)

7 7

8 8 Προκαρυωτικά σε αντιδιαστολή με τα Ευκαρυωτικά κύτταρα Μη-διαμερισματοποιημέναΜη-διαμερισματοποιημένα Οι κυτταρικές μεμβράνες στερούνται στερολών (π.χ. χολοστερόλης)Οι κυτταρικές μεμβράνες στερούνται στερολών (π.χ. χολοστερόλης) Μονήρη κυκλικά χρωμοσώματαΜονήρη κυκλικά χρωμοσώματα Ριβοσωμικά RNA 70SΡιβοσωμικά RNA 70S - υπομονάδες 30S (16S rRNA)30S (16S rRNA) 50S (5S & 23S rRNA)50S (5S & 23S rRNA)

9 9 Κυτταρόπλασμα Η Οξειδωτική Φωσφορυλίωση γίνεται στην κυτταρική μεμβράνη (αφού δεν υπάρχουν μιτοχόνδρια). Μεμβράνη Το κυτταρικό τοίχωμα έξω από την μεμβράνη είναι άκαμπτο και προστατεύει από αλλαγές στην οσμωτική πίεση. Τοίχωμα

10 10 Όλα τα κύτταρα, προκαρυωτικά και ευκαρυωτικά έχουν ριβοσώµατα

11 11 ΕυκαρυωτικάΠροκαρυωτικά Gram + Gram - Cell wall Rough endoplasmic reticulum Mitochondria (π.χ. ζώα) Nucleoid Nucleus Cell membrane Cytoplasm Flagellum Cell (inner) membraneOuter membrane Ribosomes Granule Cell wall Capsule Pili

12 12 Βακτήρια με Πλασμίδια Φέρουν Πλασμίδια (Plasmids) Τι είναι τα πλασμίδια; Σε ορισμένα βακτήρια, εκτός από το γενετικό υλικό τους, που είναι ένα κυκλικό μόριο DNA μήκους 1 mm, υπάρχουν πλασμίδια.Τι είναι τα πλασμίδια; Σε ορισμένα βακτήρια, εκτός από το γενετικό υλικό τους, που είναι ένα κυκλικό μόριο DNA μήκους 1 mm, υπάρχουν πλασμίδια. Τα πλασμίδια είναι κυκλικά μόρια DNA, 100 φορές μικρότερα από το κύριο κυκλικό μόριο και μπορούν να αντιγράφονται ανεξάρτητα απ’ αυτό. Περιέχουν γονίδια ανθεκτικότητας στα αντιβιοτικά και γονίδια που τους επιτρέπουν να μεταφέρονται από βακτήριο σε βακτήριο.Τα πλασμίδια είναι κυκλικά μόρια DNA, 100 φορές μικρότερα από το κύριο κυκλικό μόριο και μπορούν να αντιγράφονται ανεξάρτητα απ’ αυτό. Περιέχουν γονίδια ανθεκτικότητας στα αντιβιοτικά και γονίδια που τους επιτρέπουν να μεταφέρονται από βακτήριο σε βακτήριο.

13 13 Πλασμίδια Πρόκειται για εξωχρωμοσωμικά DNA (Extra- chromosomal DNA) Βρίσκονται σε πολλαπλά αντίγραφα Κωδικοποιούν - Παράγοντες παθογένειας (pathogenesis factors) - Παράγοντες αντίστασης στα αντιβιοτικά (antibiotic resistance factors)

14 14 ΜΗ ΕΝΣΩΜΑΤΟΥΜΕΝΑ ΠΛΑΣΜΙΔΙΑ (a) ΚΑΙ ΕΠΙΣΩΜΑΤΑ (b)

15 15 Ο Κυτταρικός Φάκελλος του Βακτηρίου Gram θετικά βακτήρια Gram αρνητικά βακτήρια

16 16 Η ΧΡΩΣΗ GRAM Η χρώση κατά Gram είναι µέθοδος χρώσης βακτηρίων που δίνει δυνατότητα αναγνώρισής τους. Η µέθοδος επινοήθηκε πριν από 100 περίπου χρόνια από τον Δανό γιατρό Hans Gram. Η µέθοδος συνίσταται στην κατ' αρχή χρώση µε ιώδες της γεντιανής (gentian violet), στη συνέχεια ακολουθεί επεξεργασία µε το διάλυµα Gram που αποτελείται από 1 µέρος ιώδιο, 2 µέρη ιωδιούχο κάλιο και 300 µέρη νερό. Ύστερα από έκπλυση µε αιθυλική αλκοόλη τα βακτήρια είτε διατηρούν ένα βαθύ µπλε χρώµα είτε αποχρωµατί- ζονται τελείως. Καµιά φορά χρησιµοποιείται και κάποια άλλη χρωστική όπως η φουξίνη ή η εοζίνη για να γίνουν πιο ορατά τα αποχρωµατισµένα βακτήρια.

17 17

18 18 Η ΧΡΩΣΗ GRAM Τα βακτήρια που διατηρούν τη μπλε χρωστική χαρακτηρίζονται ως Gram θετικά, ενώ εκείνα που αποχρωματίζονται, Gram αρνητικά. Μερικοί μικροοργανισμοί που άλλοτε διατηρούν τη χρωστική και άλλοτε όχι χαρακτηρίζονται Gram μεταβλητοί. Χαρακτηριστικά Gram θετικά βακτήρια είναι οι σταφυλόκοκκοι. Χαρακτηριστικά Gram αρνητικά βακτήρια είναι οι βάκιλοι που προκαλούν τον κοκίτη ενώ χαρακτηριστικά Gram μεταβλητοί είναι οι βάκιλοι που προκαλούν τη φυματίωση. Η διαφορά αυτή στη χρώση οφείλεται στη διαφορετική λεπτή δοµή των κυτταρικών τοιχωμάτων τους.

19 19 Gram+, Gram-

20 20 Χρώση Gram για Mycobacterium tuberculosis

21 21 Η ΧΡΩΣΗ GRAM Τα κυτταρικά τοιχώματα των θετικών κατά Gram βακτηρίων αποτελούνται κυρίως από πεπτιδογλυκάνες, ενώ τα κυτταρικά τοιχώματα των αρνητικών κατά Gram βακτηρίων αποτελούνται από δυο στρώσεις, ένα λεπτό στρώµα από πεπτιδογλυκάνες και µια εξωτερική µεµβράνη από λιποπρωτεΐνες και λιποπολυσακχαρίτες. Η διαφορετική αυτή χρώση δίνει τη δυνατότητα στους µικροβιολόγους να κατατάσσουν τα βακτήρια σε τρεις κατηγορίες, τα βακτήρια χωρίς τοιχώματα, τα αρνητικά κατά Gram και τα θετικά κατά Gram.

22 22 GRAM ΘΕΤΙΚΟ GRAM ΑΡΝΗΤΙΚΟ Cytoplasm Cytoplasm Lipoteichoic acid Peptidoglycan-teichoic acid Cytoplasmic membrane Inner (cytoplasmic) membrane Outer Membrane Lipopolysaccharide Porin Braun lipoprotein Periplasmic space

23 23 Διαφορές στην εξωτερική μεμβράνη Gram αρνητικά βακτήρια Gram αρνητικά βακτήρια Κύριος φραγμός διαπερατότητας (major permeability barrier)Κύριος φραγμός διαπερατότητας (major permeability barrier) Χώρος μεταξύ εσωτερικής και εξωτερικής μεμβράνηςΧώρος μεταξύ εσωτερικής και εξωτερικής μεμβράνης –περιπλασμικός χώρος (periplasmic space): –περιπλασμικός χώρος (periplasmic space): Ο χώρος που περιλαμβάνεται μεταξύ της κυτταροπλασματικής μεμβράνης και της εξωτερικής μεμβράνης καλείται –περιπλασμικός χώρος, μέσα στον οποίο ανευρίσκονται διάφορα ένζυμα.  αποθήκευση λυτικών ενζύμων Gram θετικά βακτήριαGram θετικά βακτήρια Δεν έχουν περιπλασμικό χώροΔεν έχουν περιπλασμικό χώρο

24 24 GRAM ΑΡΝΗΤΙΚΑ ΚΥΤΤΑΡΙΚΟΣ ΦΑΚΕΛΛΟΣCytoplasm Inner (cytoplasmic) membrane Outer Membrane (Major permeability barrier) Lipopolysaccharide Porin Braun lipoprotein Periplasmic space Degradative enzyme Periplasmic binding protein Permease

25 25 Ο Λιποπολυσακχαρίτης, LPS Ο LPS χορηγούμενος σε πειραματόζωα αλλά και στον άνθρωπο προκαλεί πληθώρα παθοφυσιολογικών καταστάσεων, όπως: πυρετό, διαταραχές του μεταβολισμού, λευκοκυττάρωση, λευκοπενία, υπόταση, κυκλοφορική ανεπάρκεια (shock) ακόμα και θάνατο. Λόγω της θέσης που κατέχει στο κυτταρικό τοίχωμα των Gram αρνητικών βακτηρίων και των τοξικών του συνεπειών ονομάζεται και ενδοτοξίνη.

26 26 Δοκιμή Πυρογόνων - Πυρετογόνων Δοκιμή Λίμουλους – Limulus test

27 27 Pyrogen free materials Limulus test: Gram-positive bacteria do not cause degranulation of the horseshoe crab hemocytes. (a) Morphological examination of hemocytes in contact with Gram- positive bacterium S. aureus and Gram-negative bacterium P. aeruginosa. (b) Factor C activity was assayed to indicate whether the hemocytes had degranulated. Samples were tested with and without LPS, in case Factor C was exocytosed in its inactive precursor form. The histobars show dose-dependent increase in the fluorescent product formed by increasing levels of LPS which activated the Factor C. The inset shows that after incubation with S. aureus, hemocytes aggregated at the bottom of pyrogen-free borosilicate glass tube appearing as a dense button of cells. In contrast, P. aeruginosa, a Gram-negative bacterium with LPS, caused hemocyte degranulation, thus, the absence of such aggregation of hemocytes as they were degranulated. Scale bar, 10 μm in (a).

28 28 Πορίνες Η εξωτερική μεμβράνη των Gram αρνητικών βακτηρίων είναι μια διπλοστοιβάδα φωσφολιπιδίων, που φέρει μόρια λιποπολυσακχαριτών και ένα σύστημα πρωτεϊνών. Η εξωτερική μεμβράνη αφενός μεν δεν αφήνει να μετακινηθούν οι πρωτεΐνες του περιπλασμικού χώρου, αφετέρου δε προφυλάσσει το βακτηριακό κύτταρο από διάφορους παράγοντες βλαπτικούς π.χ. ένζυμα υδρολυτικά. Δρα επίσης, ως ηθμός και αφήνει μόνο μικρού Μ.Β. υδρόφιλες ουσίες να εισέλθουν ενώ μεγαλύτερες ουσίες όπως για παράδειγμα τα αντιβιοτικά διέρχονται δυσκολότερα.

29 29

30 30 Πορίνες Αυτό έχει ως αποτέλεσμα τα Gram αρνητικά βακτήρια να εμφανίζουν μεγαλύτερη αντοχή σε πολλά αντιβιοτικά από ότι τα Gram θετικά βακτήρια. Η ιδιότητα της εξωτερικής μεμβράνης να δρα προστατευτικά αποκλείοντας τη διέλευση βλαβερών για το βακτήριο μορίων, οφείλεται στο σύστημα των πρωτεϊνών της, τις ονομαζόμενες πορίνες.

31 31 Cytoplasm Lipoteichoic acid Peptidoglycan-teichoic acid Cytoplasmic membrane GRAM ΘΕΤΙΚΑ ΚΥΤΤΑΡΙΚΟΣ ΦΑΚΕΛΛΟΣ Degradative enzyme

32 32 Βακτηριολυτικά ένζυμα, π.χ. λυσοζύμη Λυσοζύμη είναι ένζυμο που διασπά τις πεπτιδογλυκάνες από το κυτταρικό τοίχωμα των ευαίσθητων βακτηρίων. Η λυσοζύμη καταστρέφει ορισμένα Gram θετικά βακτήρια και δεν είναι γενικά δραστική στα αρνητικά λόγω της διαφοράς στο κυτταρικό τοίχωμα. OM= Outer Membrane PG= PeptidoGlycan CM= Cytoplasmic Membrane

33 33

34 34 ΜΑΣΤΙΓΙΑ (FLAGELLA) Μερικά βακτήρια είναι κινητάΜερικά βακτήρια είναι κινητά Κινησιογόνα οργανίδια – μαστίγιαΚινησιογόνα οργανίδια – μαστίγια Ανιχνεύουν το περιβάλλονΑνιχνεύουν το περιβάλλον Αντιδρούν στην παρουσία τροφής και δηλητηρίων - χημειοταξίαΑντιδρούν στην παρουσία τροφής και δηλητηρίων - χημειοταξία Μαστίγια - Πακτωμένα στην κυτταρική μεμβράνη - Προέχουν σαν αλυσίδες - Υπομονάδες Φλαγελλίνης (Flagellin) - Κινούνται με σπειροειδή κίνηση και δρουν ως «προπέλες» του βακτηρίου

35 35 Flagellum of Gram-negative Bacteria

36 36 ΜΑΣΤΙΓΙΑ (FLAGELLA) Τα Escherichia coli κύτταρα χρησιμοποιούν μακρές, λεπτός δομές που ονομάζονται μαστίγια για να έχουν ώθηση. Αυτές περιστρέφονται αριστερόστροφα, δημιουργώντας μια ροπή που προκαλεί το βακτήριο να περιστρέφεται δεξιόστροφα.Escherichia coli

37 37 Η ΔΙΑΦΟΡΑ ΤΩΝ ΜΑΣΤΙΓΙΩΝ ΑΠΟ ΤΙΣ ΒΛΕΦΑΡΙΔΕΣ (CILIA, π.χ. ΠΝΕΥΜΟΝΙΚΑ ΚΥΤΤΑΡΑ, ΠΡΩΤΟΖΩΑ)

38 38 Αξονικά νημάτια (Axial filaments) Σπιροχαίτες (spirochetes), ωχρά σπιροχαίτη Παρόμοια λειτουργία με τα μαστίγια Αναπτύσονται κατά μήκος του κυττάρου Εκτελούν οφιοειδείς (snake-like) κινήσεις Τριχίδια (Pili) ή Ινίδια (fimbriae) Τριχοειδείς (hair-like) προεκτάσεις του κυττάρου Φυλετική σύνδεση (sexual conjugation) Προσκόλληση (adhesion) στα επιθήλια του ξενιστή

39 39 Ο σχηματισμός μορφών χωρίς τοίχωμα (Wall-less ) Προκύπτουν από τη δράση: –ενζύμων που διαλύουν το κυτταρικό τοίχωμα –αντιβιοτικών που αναστέλλουν τη βιοσύνθεση πεπτιδογλυκάνης (peptidoglycan biosynthesis) Συνήθως μη-βιώσιμες μορφές (non-viable) Μη διπλασιαζόμενα βακτήρια χωρίς τοίχωμα: –σφαιροπλάστες (spheroplasts) με εξωτερική μεμβράνη –πρωτοπλάστες (protoplasts) χωρίς εξωτερική μεμβράνη Διπλασιαζόμενα βακτήρια χωρίς τοίχωμα: –L μορφές (στελέχη που στερούνται τοιχώματος) –Γένος (Genus) βακτηρίων χωρίς τοίχωμα: Mycoplasma

40 40 Μυκοπλάσματα Το Μυκόπλασμα (Mycoplasma) είναι γένος βακτηρίων που δεν διαθέτουν κυτταρικό τοίχωμα σε αντίθεση με τα κοινά βακτήρια. Χωρίς κυτταρικό τοίχωμα, είναι ανεπηρέαστα από πολλά αντιβιοτικά όπως η πενικιλίνη και τα αντιβιοτικά β-λακτάμης, τα οποία στοχοποιούν τη σύνθεση του κυτταρικού τοιχώματος. Μπορούν να είναι παρασιτικά ή σαπροφυτικά. Αρκετά είδη είναι παθογόνα για τον άνθρωπο με σημαντικότερο εκπρόσωπο το είδος M. pneumoniae που προκαλεί άτυπη πνευμονία και αναπνευστικές διαταραχές.

41 41 Περιβλήματα και στοιβάδες βλέννας Capsules and slime layers Εξωτερικά περιβλήματα (outside cell envelopes) Αν είναι σαφώς περιγεγραμμένα: Περιβλήματα (capsules) Μη-σαφώς περιγεγραμένα: στοιβάδες βλέννας ή γλυκοκάλυκας (slime layer or glycocalyx) Συνήθως πολυσακχαριδικά (polysaccharide) Συχνά χάνονται σε καλλιέργειες in vitro Προστατευτικά in vivo

42 42

43 43 Ενδοσπόρια (Endospores) ή Σπόροι (spores) Σχηματίζονται από αδρανή (Dormant) βακτήρια Παράγονται από κύτταρα που λιμοκτονούν Ανθίστανται σε αντίξοες συνθήκες - υψηλές θερμοκρασίες - οργανικούς διαλύτες Περιέχουν διπικολινικό ασβέστιο (calcium dipicolinate): θερμοανθεκτικότητα Ανάμεσα σε άλλα εμφανίζονται στα γένη Bacillus και Clostridium (αναερόβια)

44 44 Παραλλαγές στη μορφολογία των ενδοσπορίων: (1, 4) κεντρικά ενδοσπόρια, (2, 3, 5) τερματικά ενδοσπόρια, (6) πλευρικά ενδοσπόρια. Χρωματισμένο παρασκεύασμα του Bacillus subtilis δείχνει τα ενδοσπόρια πράσινο και τα σποριογόνα κύτταρα με κόκκινο

45 45 Καλλιέργεια και ταυτοποίηση των μολυσματικών παραγόντων

46 46 Λέξεις Κλειδιά (Key Terms)  Απομόνωση - Isolation (culture)  Αποικίες άγαρ - Agar plate plate/colonies  Θρεπτικά υγρά - Liquid media  Ταυτοποίηση και ταξινόμηση Identification & taxonomy  Οικογένεια - Family  Γένος - Genus  Είδος - Species  Τύπος - Type  Στέλεχος - Strain Μετά την καλλιέργεια  Βιοχημικά tests π.χ. ζύμωση λακτόζης  Γενετικά tests  Αλληλούχηση DNA - Sequencing,  Polymerase chain reaction (PCR)  DNA-DNA ομολογία - υβριδοποίηση  Περιοριστικά ένζυμα Restriction enzymes (digests)  Χημικά «αποτύπωμα» Chemical - fatty acid/protein profiling/fingerprinting  Ανοσολογικά tests – Immunological tests  Άμεση ταυτοποίηση (π.χ. χωρίς καλλιέργεια)  PCR  Ανίχνευση αντιγόνων - Antigen detection  Χρώση - Staining (e.g. Gram stain)  Ορολογικά - Serology (antibody detection)

47 47 Ταξινόμηση (Taxonomy) Καθορίζει κοινά χαρακτηριστικά ανάμεσα σε στελέχη ενός βακτηριακού είδους Συνήθως είναι γενετική ταξινόμηση Επιτρέπει την ανάπτυξη διαγνωστικών τεστ

48 48 Κατηγοριοποίηση (Classification) επαγωγικά - απαγωγικά Στέλεχος, μία μονήρης απομόνωση ή σειρά. (Strain: one single isolate or line). Τύπος και ενίοτε παθότυπος, ένα υποσύνολο του είδους. (Type: sub-set of species). Είδος, στενά συγγενικά στελέχη. (Species: related strains). Γένος, στενά συγγενικά είδη. (Genus: related species). Οικογένεια, στενά συγγενικά γένη. (Family: related genera).

49 49 Αναγνώριση μολυσματικών παραγόντων στο διαγνωστικό εργαστήριο Αναγνώριση (ταυτοποίηση) του «αιτίου» Κρίσιμες θεραπείες (π.χ. Aids treatment) Βοηθά την επιλογή ειδικών αντιβιοτικών (Helps specific antibiotic selection) Γενικό νοσοκομειακό εργαστήριο (General hospital laboratory) –Φυσιολογικές/βιοχημικές δοκιμές (Physiological/biochemical tests) Εργαστήρια αναφοράς (Reference laboratories) –Γενετικές δοκιμές (Genetic tests)

50 50 Βήματα απομόνωσης και ταυτοποίησης «Steps in isolation and identification» Βήμα 1 ο : Ενοφθαλμισμός με κρίκο στερών καλλιεργειών σε τρυβλία (Streaking culture plates) – Μορφολογία αποικιών μετά την επώαση (colonies on incubation e.g. after 24 hr) – Μέγεθος, υφή, χρώμα, αιμόλυση (size, texture, color, hemolysis) – Απαιτήσεις σε οξυγόνο (oxygen requirement)

51 51 Καλλιέργεια σε αιματούχο άγαρ «Sheep blood agar plate culture» Bacillus anthracis Bacillus cereus

52 52 Μικτές αποικίες «Mixed colonies»

53 53 Απομόνωση και Ταυτοποίηση-1 Isolation and identification Βήμα 2 ο : Οι αποικίες χρωματίζονται κατά Gram – τα κύτταρα παρατηρούνται με τη βοήθεια μικροσκοπίου (cells are observed microscopically)

54 54

55 55 Μορφολογία μετά την χρώση Gram «Gram stain morphology» Σχήμα - ShapeΣχήμα - Shape –Κόκκοι (σφαιρικοί) - cocci (round) –Βάκιλοι (βακτηρίες, κύλινδροι) - bacilli (rods) –Σπείρες ή καμπύλες - spiral or curved (e.g. spirochetes) Μονήρη ή πολλαπλά κύτταρα - Single or multiple cellsΜονήρη ή πολλαπλά κύτταρα - Single or multiple cells –Ομάδες (π.χ. σταφυλόκοκκοι) - clusters (e.g. staphylococci) –Αλυσίδες (π.χ. στρεπτόκοκκοι) -chains (e.g. streptococci) Θετικά ή αρνητικά κατά Gram - Gram positive or negativeΘετικά ή αρνητικά κατά Gram - Gram positive or negative

56 56

57 57

58 58

59 59 Βήμα 3 ο : Απομόνωση βακτηρίων και αναγνώριση του είδους Γενικά χρησιμοποιώντας φυσιολογικές και βιοχημικές δοκιμές.

60 60 Ο Εργαστηριακός Πάγκος Clinical Microbiology Laboratory Bench

61 61 ΕΝΑ ΠΑΡΑΔΕΙΓΜΑ ΦΥΣΙΟΛΟΓΙΚΟΥ/ΒΙΟΧΗΜΙΚΟΥ ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΜΟΥ ΣΤΕΛΕΧΩΝ ΕΝΟΣ ΒΑΚΤΗΡΙΟΥ

62 62 Βήμα 4 ο : Δοκιμή αντοχής/ευπάθειας στα αντιβιοτικά

63 63 No growth Δοκιμασίες ευπάθειας στα αντιβιοτικά Antibiotic susceptibility testing ΕυπαθέςΑνθεκτικό Bacterial lawn lawn Growth Antibiotic disk

64 64 Μοριακή διαφοροποίηση Molecular differentiation Γενωμική - Genomics Χαρακτηρισμός γόνων - Gene characterization –Αλληλούχηση - Sequencing –PCR –Περιοριστικά κλάσματα - Restriction digests Υβριδοποίηση - Hybridization Αναλογίες βάσεων (% guanine + cytosine)

65 65 Αλληλούχηση συγκεριμένων περιοχών 16S rRNA Sequencing Διαφοροποιεί τα βακτηριακά είδη - Differentiates bacterial species Ανάπτυξη κλινικών δοκιμών που στηρίζονται στην αλληλούχηση - Development of clinical tests based on sequence (e.g. PCR)

66 66 (Real-time) Πραγματικού χρόνου PCR Cycle one Cycle two Cycle ds DNA Dye

67 67 DNA-DNA Υβριδοποίηση (hybridization) 100% Homology + Heat 0% Homology Strain 1 Strain 2

68 68 Αποτυπώματα και Περιγράμματα (Profiles) Λιπαρά οξέα μακράς αλυσίδας Long chain fatty acids - structural (e.g. cell membrane) Μεταβολίτες βραχείας αλυσίδας - Short chain - Απλοί μεταβολίτες - metabolic - Πτητικοί μεταβολίτες – volatiles - Αλκοόλες – alcohols - Περίγραμμα πρωτεϊνών (Protein profiling): defining a species by characteristic proteins - Πρωτεομική - Proteomics: defining all proteins expressed by a species under specific growth conditions

69 69 Δοκιμές συγκόλλησης π.χ. Streptococcal Agglutination Test Latex beads Streptococcal antigenic extract Antibody

70 70 Άμεση αλληλούχηση Bacterial DNA sequences amplified directly from human body fluids Αλυσιδωτή αντίδραση της πολυμεράσηςΑλυσιδωτή αντίδραση της πολυμεράσης Polymerase chain reaction (PCR)Polymerase chain reaction (PCR) Επιτυχία στην άμεση διάγνωση της φυματίωσηςΕπιτυχία στην άμεση διάγνωση της φυματίωσης

71 71 Μικροσκόπηση - Microscopy Εγκεφαλονωτιαίο υγρό Πτύελα Μικρή εξειδίκευση Απλό Μικροσκόπιο Ηλεκτρονικό Μικροσκόπιο: Λεπτομέρεια Υψηλής ευκρίνειας


Κατέβασμα ppt "1 ΜΙΚΡΟΒΙΟΛΟΓΙΑ ΚΑΙ ΥΓΙΕΙΝΗ ΤΡΟΦΙΜΩΝ ΠΑΡΟΥΣΙΑΣΗ 2 Η ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΤΙΚΑ ΤΩΝ ΜΙΚΡΟΒΙΩΝ – ΒΑΚΤΗΡΙΑ – ΚΑΤΗΓΟΡΙΟΠΟΙΗΣΗ ΤΩΝ ΒΑΚΤΗΡΙΩΝ - ΤΕΧΝΙΚΕΣ."

Παρόμοιες παρουσιάσεις


Διαφημίσεις Google